Эти и ряд других примеров заставляют предположить, что за актом узнавания, но перед каталитическим актом происходит некоторая более тонкая взаимная подстройка субстрата с активным центром. Иными словами, ферментативный процесс в таких случаях состоит из трех этапов: узнавания с образованием комплекса фермент-субстрат, тонкой подстройки субстрата к набору каталитических групп и самого акта катализа.