Cтраница 1
Фрагментная конденсация на второй фазе тоже возможна. [1]
Фрагментная конденсация проводится главным образом в гомогенных растворах, так что проблемы растворимости и способности к активированию могут быть лимитирующими факторами. Соединение двух фрагментов протекает по кинетики 2-го порядка, причем быстрая реакция возможна только при наличии достаточно высоких концентраций обоих реагирующих партнеров. Из-за снижающейся с ростом пептидной цепи растворимости достаточная концентрация партнеров реакции труднодостижима в случае фрагментов, имеющих более 50 аминокислотных остатков. Решением проблемы могло бы быть такое соединение фрагментов, которое основано на не зависящей от концентрации внутримолекулярной перегруппировке. Можно предположить, что эту проблему можно решить с помощью метода Уги и метода аминной ловушки ( разд. [2]
Фрагментная конденсация на второй фазе тоже возможна. Этот принцип описан Вейгандом и Рагнарсоном [539] уже в 1966 г. На примере различных синтезов, однако, этот вариант не представляется решением проблемы, так как ему присущи все уже известные недостатки твердофазного метода. [3]
В качестве альтернативы служит фрагментная конденсация. [4]
С помощью этого комбинированного ДЦГК-метода были успешно проведены фрагментные конденсации и циклизация фрагментов. Метод имеет, однако, недостаток: может протекать конкурентная реакция между ДЦГК и N-гидроксисукцинимидом, особенно заметная в случае стерически затрудненных пептидов. Согласно исследованиям Гросса и Вилка [305], эта побочная реакция ведет к размыканию кольца О-ациллактима, образованного из эквимолярных количеств ДЦГК и N-гидроксисукцинимида, под действием второго моля N-гидроксисукцинимида. При этом отщепляется дицикло-гексилмочевина. Промежуточный продукт - ацилнитрен перегруппировывается в изоцианат, который в свою очередь присоединяет третий моль N-гидроксисукцинимида с образованием N-гидроксисукцинимидного эфира сукцинимидоксикарбонил - / 3-аланина. Этот активированный эфир может выступать в качестве конкурирующего ацилйрующего реагента, вследствие чего происходит неконтролируемое встраивание / 3-аланина в пептидную цепь. [5]
Обычное до сих пор в пептидной химии понятие фрагментная конденсация предложено [26] заменить на более точное выражение сегментная конденсация. При этом более понятно, что подразумевается не обломок последовательности, а отрезок ее, сегмент. Между тем при семисинтезе ( разд. [6]
Такая стратегия синтеза - в данном случае в сочетании с фрагментной конденсацией в растворе - единственный метод, который гарантирует надежный полный синтез изолированного природного продукта. [7]
Под стратегией понимают последовательность связывания аминокислотных компонентов в пептид, причем следует различать постепенное наращивание и фрагментную конденсацию. Получение полипептидов путем постепенного наращивания цепи трудноосуществимо при больших размерах целевой молекулы. В этих случаях большое значение приобретает разделение объекта синтеза на отдельные фрагменты с последующим соединением их в полипептид. Оптимальный выбор комбинации защитных групп и применение подходящего метода конденсации для каждого отрезка составляет предмет тактики пептидного синтеза. [8]
Упомянутые выше лимитирующие факторы ступенчатого метода в гомогенном растворе, а также недостатки ступенчатого удлинения цепей на второй фазе не позволяют получать длинноцепочечные полипептиды или белки. В качестве альтернативы служит фрагментная конденсация. [9]
Для обратимого блокирования концевых и боковых основных, кислых и спиртовых групп аминокислот существует большое число защитных групп ( разд. Небольшие пептиды, а также участки последовательностей для фрагментной конденсации лучше всего могут быть синтезированы ступенчато с С-конца. [10]
На примере карбодиимидного метода с добавкой Р ( - г1шрокси - 5-нонборнен - 2 3-дикарбоксннмида, было изучено влияние различных растворителей при конденсациях фрагментов. Результаты этого исследования показали, что системы ДМФ - ДМСО ( 1: 1), N-метилпирролидон ( НМП) - пиридин и ДМФ - Н2О ( 7: 3) не подходят для фрагментной конденсации. [11]