Cтраница 1
Модель Зимма - Брэгга применима к природным белкам. [1]
Максимальное время релаксации полимерного клубка в модели Зимма пропорционально W3 / 2, а коэффициент диффузии изменяется как JV-1 / Z при N; клубок можно качественно рассматривать как абсолютно непротекаемый. [2]
Экспериментальные кривые перехода спираль - клубок описываются с помощью модели Зимма - Брэгга. [3]
Бесконечное поверхностное натяжение отвечает состоянию с а 0, когда кразделению на две фазы приводит также и модель Зимма - Брэгга. [4]
Формулу (33.24) можно применять и для случая разбавленного полимерного раствора - это подтверждается как приближенным расчетом для модели Зимма с учетом объемных взаимодействий, так и экспериментальными результатами. [5]
Бесконечное поверхностное натяжение отвечает состоянию с а 0, когда кразделению на две фазы приводит также и модель Зимма - Брэгга. [6]
Кроме того, рассматривались частоты встречаемости трех остатков на каждом конце ( а не только одного остатка по модели Зимма - Брэгга), поскольку каждый из трех концевых остатков а-спирали образует только одну водородную связь. Поскольку переходы беспорядочный клубок - - складчатый лист в синтетических полимерах значительно менее изучены, то таких корреляций для - структур пока установить не удалось. [7]
Во-первых, динамическое поведение макромолекулы в полуразбавленных растворах на больших масштабах подчиняется модели Рауза ( если можно пренебречь топологическими ограничениями), а не модели Зимма. Единственность характерного размера позволяет применить для исследования флуктуационной динамики полуразбавленного полимерного раствора метод скейлинговых оценок. [8]
Склонности к спирали, полученные с помощью статистической механики синтетических полипептидов, соответствуют склонностям, основанным на частотах встречаемости в глобулярных белках. В своих последующих работах Чоу и Фасман [201] сопоставили склонности к спирали, определенные но наблюдаемым частотам встречаемости в глобулярных белках, с данными, полученными на основании температур 9 переходов спираль - клубок синтетических полипептидов, согласно модели Зимма - Брэгга. Как показано в разд. Чоу и Фасман показали, что величины s семи типов остатков, для которых имеются данные по синтетическим полипептидам, в пределах 10 % согласуются со склонностями к спирали, полученными по частотам встречаемости в глобулярных белках. [9]
Это последнее значение хорошо согласуется с результатом теории Зимма [ ш ], который предложил недавно более детальную теорию характеристической вязкости растворов полимеров. Теория Зимма основана на рассмотрении уравнений движения системы центров сопротивления, связанных с пружинками, моделирующими статистические упругие силы. Следовательно, каждый центр сопротивления в модели Зимма отвечает уже не статистическому элементу, а кинетической единице цепи. [10]
В области перехода Т приблизительно пропорциональна s ( разд. Если известна разность энтальпий ЛЯ перехода, Т можно заменить на s, пользуясь уравнением ( А. В большинстве случаев получается вполне удовлетворительное совпадение, что и подтверждает модель Зимма - Брэгга. [11]
Экспериментальные результаты, полученные для различных полимеров - полидиметилсил океана, полибутадиена, полистирола и др., - показывают, что в целом все они ведут себя как частично проницаемые клубки, так что при соответствующем выборе параметра взаимодействия h обеспечивается удовлетворительное соответствие теории с экспериментом, и химическая природа гибкой полимерной цепи не играет здесь никакой роли. Пример результатов сопоставления теории с экспериментальными данными, относящимися к предельно разбавленным растворам, представлен на рис. 3.10 для растворов полистирола в двух различных тета-растворителях. Согласие теории с экспериментом сохраняется и для растворов в хороших растворителях. Дальнейшие исследования показали также, что рассмотрение частотных зависимостей G ] и [ G ] позволяет подтвердить существующие теоретические представления о вяз-коупругих свойствах не только линейных, но и разветвленных макромолекул, поведение растворов которых может трактоваться в терминах модели Зимма при учете частичной проницаемости макро-молекулярного клубка. При этом, однако, значение h для разветвленных полимеров оказывается несколько меньшим, чем для линейных макромолекул того же химического строения. [12]
Остатки с низкими относительными статистическими весами значительно укорачивают среднюю длину спирали. Чтобы оценить спиральный потенциал данного белка, было использовано одно значение параметра инициации сг 5 10 - 4 ( разд. Кроме того, были введены три различные значения s для всех типов остатков. Значения сг и s получают по наклонам и температурным переходам зависимостей, описывающих переходы спираль - клубок в синтетических полипептидах, используя уравнения ( А. Спиральная конформация предсказывается для всех положений остатков i, для которых Pt больше средней величины / V В результате получаются непрерывные потенциальные функции, поскольку уравнение (6.2) учитывает коо-перативность модели Зимма - Брэгга, согласно которой спирали должны иметь определенную длину ( рис. А. [13]
Если такого усреднения не проводить, матрица Яур становится зависящей от мгновенной конфигурации цепи. Фиксман [148], используя неусредненную Я / р, провел расчеты методом БД коэффициента диффузии DG цепи как целого, характеристической вязкости [ ц ] и корреляционной функции С ( К 0 для модели ГСЦ из 5, 10 и 20 субцепей. Результаты были сопоставлены с расчетами по обычной схеме с усредненным тензором. Влияние флуктуирующего гидродинамического взаимодействия на C ( h, t) оказалось пренебрежимо малым. Отсюда следует, что и длинноволновые векторные моды и коэффициент вращательной диффузии цеди как целого, которые, главным образом, определяют релаксацию С ( п, f), хорошо описываются моделью Зимма. В целом, однако, можно сделать вывод, что модель Зимма дает удовлетворительные результаты для крупномасштабных динамических свойств полимерных цепей. [14]
Если такого усреднения не проводить, матрица Яур становится зависящей от мгновенной конфигурации цепи. Фиксман [148], используя неусредненную Я / р, провел расчеты методом БД коэффициента диффузии DG цепи как целого, характеристической вязкости [ ц ] и корреляционной функции С ( К 0 для модели ГСЦ из 5, 10 и 20 субцепей. Результаты были сопоставлены с расчетами по обычной схеме с усредненным тензором. Влияние флуктуирующего гидродинамического взаимодействия на C ( h, t) оказалось пренебрежимо малым. Отсюда следует, что и длинноволновые векторные моды и коэффициент вращательной диффузии цеди как целого, которые, главным образом, определяют релаксацию С ( п, f), хорошо описываются моделью Зимма. В целом, однако, можно сделать вывод, что модель Зимма дает удовлетворительные результаты для крупномасштабных динамических свойств полимерных цепей. [15]