Cтраница 3
Формальные ряды очень полезны при анализе рекуррентных последовательностей. [31]
В случае применения подобной методики для анализа последовательности аминокислот необходима идентификация разделенных соединений, однако возможности ГХ в. Кроме того, что необходимы колонки различной избирательности, нужно знать и относительные удерживаемые объемы исследуемых соединений. Идентификация непосредственно зависит также от доступности подходящего стандарта. Если дипептиды можно синтезировать химически, то для более длинных пептидов это очень трудная задача. Применение ГХ только в целях разделения оправдано лишь тогда, когда выделенные пептидные производные можно уверенно идентифицировать и определить их последовательность с помощью других методов. [32]
Принцип безэталонной томографии рассмотрим на примере анализа искусственной последовательности на рис. 5.11. Термограммы данной последовательности отличаются существенной неоднородностью нагрева. [33]
Иллюстрация использования одной и той же затрамш с данным вектором для анализа последовательности различных фрагментов. [34] |
Метод Сенгера наиболее часто используется для анализа последовательности ДНК после ее неспецифического расщепления и клонирования суммы получаемых фрагментов. Метод весьма эффективен и экономичен, так же как метод Максама - Гилберта, и позволяет анализировать последовательность свыше 200 звеньев на одном геле. [35]
Интересно использовать тот же метод для анализа последовательностей букв алфавита в английском тексте. В четвертом столбце табл. 1 показаны результаты ( соотнесенные к 400 клеткам), полученные при анализе вступительных строк Потерянного рая Мильтона. [36]
Модель Смелзера может быть полезной при анализе последовательности этапов формирования социальных движений и коллективного действия. Согласно его точке зрения, каждое звено в данной цепи как бы добавляет вес в общий результат и является условием для осуществления последующих шагов. Однако его теория небезупречна. Иногда социальное движение крепнет без каких-либо активирующих событий, понимаемых в смысле открытых публичных конфронтации. Наоборот, серия инцидентов может привести к необходимости организовать движение, которое бы изменило обстоятельства, его же породившие. Движение может вскрыть противоречия, а не просто развиваться как ответ на них. Например, женское движение активно добивается равенства и устранения гендерной дискриминации, хотя ранее такой проблемы не существовало. Теория Смелзера интерпретирует социальные движения как реакции на ситуации, не допуская возможности того, что члены этих движений могут организоваться спонтанно для совершения определенных социальных перемен. В этом отношении его идеи контрастируют с подходом Алена Турэна. [37]
Комбинация этих двух методов может значительно облегчить анализ последовательности пептидов - к тому же для обоих, методов требуются очень малые количества вещества. Газовая хроматография пептидов изучалась только в двух лабораториях, в которых были предложены различные методики получения их производных. Для последующей идентификации крайне важно, чтобы структуру исходных соединений можно было узнавать по их производным. Хотя детальное рассмотрение масс-спектрометрии выходит за рамки рассматриваемого ниже процесса ГХ пептидов, многие операции, которые будут описаны, должны рассматриваться с учетом возможного использования масс-спектрометрического метода. Соединение капиллярной или набивной колонки непосредственно с масс-спектрометром дает возможность измерять полный масс-спектр каждого пика и, таким образом, с помощью этого способа получать необходимую информацию. [38]
Последовательности, узнаваемые четырьмя ферментами рестрикции, и число мишеней в каждой из двух вирусных ДНК. [39] |
Существует три этапа в этом классическом методе анализа последовательности. Первоначально РНК расщепляют на фрагменты умеренной длины ( примерно 50 пар оснований) частичным гидролизом РНазой. Затем анализируют общий состав оснований этих дискретных фрагментов с последующим их расщеплением до маленьких блоков, для которых можно непосредственно установить последовательность оснований. И наконец, большие по размеру фрагменты располагают в нужном порядке, используя частичное перекрывание последовательностей. Во всех случаях фрагменты детектируют без деструкции с использованием 32Р - меченных нуклеотидов. [40]
Рибонуклеазы, используемые для анализа последовательности РНК. [41] |
РНаэы, выпускаемые некоторыми фирмами специально для анализа последовательности нуклеотидов в РНК ( sequence grade), в определенных условиях проявляют исключительно высокую специфичность по отношению к основаниям. [42]
Электрофоретические подвижности некоторых нуклеотидов в системе 5 % - ная уксусная кислота - 0 5 % - ный пиридин - О. ОО1 U EDTA ( pH 3 5. [43] |
Целесообразность использования частичного гидролиза фосфодиэстеразой селезенки при анализе последовательности обсуждается в гл. Условия проведения этой операции несколько различаются в зависимости от того, выделен ли олигонуклеотид из панкреатического, Т, - или [ 2 -гидролиза-та главным образом вследствие того, что скорость отщепления концевых нуклеотидов при помощи фосфодиэстеразы селезенки неодинакова: UA G С. [44]
Следовательно, обычные методы деградации, применяемые для анализа последовательности аминокислот, в данном случае не пригодны. [45]