Cтраница 1
Короткие повторы, по-видимому, возникли в результате рет-ропозиции ДНК-копий, образованных на частично процессирован-ных тРНК и 7SPHK - Последняя выполняет важную клеточную функцию, она входит в состав рибонуклеопротеидных частиц, узнающих сигнальный пептид на N-конце новообразованного сек-ретируемого белка. Частицы участвуют в биосинтезе секретиру-емых белков, обеспечивая прикрепление рибосомы к мембранам эндоплазматической сети. Анализ нуклеотидной последовательности коротких повторов показывает, что матрицей для их образования послужили 7S РНК, тРНК и, наконец, UPHK, подвергшиеся процессингу и ошибочному полиаденилированию. Возможно, образование шпильки на З - конце молекул обеспечило затравку ( праймер) для обратной транскриптазы. [1]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - 105, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [2]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - Ю5, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [3]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - 105, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [4]
Однако непонятно, используются ли в клетке эти промоторы коротких повторов. Между особями одного вида иногда наблюдаются различия ( полиморфизм) в структуре генов и их ближайшего окружения, обусловленные внедрением коротких или длинных повторов. Однако вопрос о возможной селективной ценности ( например, о преимуществах при экспрессии гена) этих различий остается открытым. [5]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - 105, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [6]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - Ю5, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [7]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - 105, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [8]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - Ю5, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [9]
Последняя выполняет важную клеточную функцию, она входит в состав рибонуклеопротеидных частиц, узнающих сигнальный пептид на N-конце новообразованного сек-ретируемого белка. Частицы участвуют в биосинтезе секретиру-емых белков, обеспечивая прикрепление рибосомы к мембранам эндоплазматической сети. Анализ нуклеотидной последовательности коротких повторов показывает, что матрицей для их образования послужили 7S РНК, тРНК и, наконец, UPHK, подвергшиеся процессингу и ошибочному полиаденилированию. Возможно, образование шпильки на З - конце молекул обеспечило затравку ( праймер) для обратной транскриптазы. [10]
Короткие повторы, по-видимому, возникли в результате рет-ропозиции ДНК-копий, образованных на частично процессирован-ных тРНК и 7SPHK - Последняя выполняет важную клеточную функцию, она входит в состав рибонуклеопротеидных частиц, узнающих сигнальный пептид на N-конце новообразованного сек-ретируемого белка. Частицы участвуют в биосинтезе секретиру-емых белков, обеспечивая прикрепление рибосомы к мембранам эндоплазматической сети. Анализ нуклеотидной последовательности коротких повторов показывает, что матрицей для их образования послужили 7S РНК, тРНК и, наконец, UPHK, подвергшиеся процессингу и ошибочному полиаденилированию. Возможно, образование шпильки на З - конце молекул обеспечило затравку ( праймер) для обратной транскриптазы. [11]
Псевдогены, образованные на мРНК, предназначенных для кодирования известных белков, составляют небольшую часть геномных ретропозонов. Особенно богаты такими повторами геномы высших эукариот - млекопитающих. Внутри семейств как длинных, так и коротких повторов обнаруживается структурная неоднородность. Отдельные копии часто укорочены с 5 -конца, имеют делеции, вставки и нуклеотидные замены. [12]
Псевдогены, образованные на мРНК, предназначенных для кодирования известных белков, составляют небольшую часть геномных ретропозонов. Особенно богаты такими повторами геномы высших эукариот - млекопитающих. Те и другие несут на условном З - конце последовательность полис. Внутри семейств как длинных, так и коротких повторов обнаруживается структурная неоднородность. Отдельные копии часто укорочены с 5 -конца, имеют делеции, вставки и нуклеотидные замены. [13]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - 105, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [14]
Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3 - Ю5, что соответствует 5 - 6 % массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Нук-леотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК - Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых. Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретро-позонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных промежутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [15]