Присоединение - фермент
Cтраница 1
 |
Функции различных типов животных РНК-полимераз.| Структура транскрибируемого участка ДНК прокариот. [1] |
Присоединение фермента к промотору определяет рамку считывания информации с матрицы ДНК. На участке промотора имеется по меньшей мере два элемента ( в области 10 и 35 нуклеотидов, если считать по направлению, противоположному движению фермента), участвующих во взаимодействии с а-субъединицей РНК-полимеразы. Первый элемент ( в области 10 нуклеотидов) называется бокс Прибнова, по фамилии открывшего его автора. Этот бокс имеет последовательность ТАТААТ на одной из цепей и комплементарную ей последовательность - на другой. В положении 35 найдена последовательность ТТГАЦА. Обе эти нуклеотидные последовательности взаимодействуют с ст-субъединицей РНК-полимеразы и закрепляют ее на цепи ДНК. Сродство некоторых участков промотора вне областей 10 и 35 к РНК-полимеразе усиливает скорость транскрипции. Эти участки называются дискриминаторами и являются сугубо индивидуальными для каждого промотора. Далее к ст-субъ-единице присоединяется корфермент и образуется закрытый транскрипционный комплекс. В результате раскручивания цепей ДНК разрываются водородные связи между парами нуклеотидов ДНК и образуется открытый транскрипционный комплекс. [2]
Присоединение фермента к субстрату обычно протекает наиболее быстро. Данная стадия имеет очень небольшую энергию активации и это показывает, что первичный комплекс ES образуется за счет слабых связей - гидрофобных, водородных и электростатических. Второй этап требует сравнительно много энергии - он связан с разрывом и затем образованием новых ковалентных связей. Суммарная скорость ферментной реакции определяется прохождением через ту стадию второго этапа, которая имеет наибольшую свободную энергию, иными словами, наиболее высокий энергетический барьер. Чем этот барьер выше ( и выше энергия активации этой стадии), тем труднее протекает каталитический процесс. Сказанное иллюстрируется рис. 13, где видны энергетический барьер реакции, идущей без катализатора; энергетические барьеры отдельных стадий при последовательных превращениях промежуточного комплекса фермент-субстрат и наиболее высокий из этих барьеров, лимитирующий скорость всего процесса. [3]
Для присоединения ферментов и антигенов к макромолекуле целлюлозы используют в основном реакции азосочетания и ацили-рования. Как показали работы Гурвича и др. [28], содержание привитого белка в сополимере может быть значительно увеличено при использовании для синтеза привитого сополимера высокодисперсных суспензий производных целлюлозы, полученных путем переосаждения из медноаммиачного раствора. [4]
Экономия растворителя в результате присоединения ферментов к субклеточным структурам - это, конечно, не единственное преимущество такой организации биохимических механизмов. [5]
 |
Зависимость удельной активности иммобилизованного а-химотрипсина от концентрации поверхностных гидразидных групп на гранулах биогеля Р-2 [ 101. [6] |
Каким образом могут влиять на активность ферментов некоторые свойства носителей или тип присоединения фермента и насколько сильно это влияние, показано ниже на нескольких примерах. [7]
У бактерий молекула РНК-полимеразы состоит из двух компонентов: минимальной РНК-полимеразы, или кор-фермента ( от англ, core - сердцевина), содержащего все каталитические центры, участвующие в синтезе РНК, и 0-субъединицы, необходимой для правильного присоединения фермента к промотору и отделяющейся от РНК-полимеразы после начала синтеза РНК. Минимальная РНК-полимераза состоит из четырех субъединиц: двух идентичных а-субъ-единиц и неидентичных Р - и р - субъединиц. В р - и р - субъедини-цах имеется по одному атому Zn. Размеры этих субъединнц у других бактерий примерно такие же. ДНК) и ширину примерно 40 нм. Эти субъединицы контактируют с ДНК в комплексе РНК-полимеразы с промотором и несут в себе каталитические центры. [8]
У бактерий молекула РНК-полимеразы состоит из двух компонентов: минимальной РНК-полимеразы, или кор-фермента ( от англ, core - сердцевина), содержащего все каталитические центры, участвующие в синтезе РНК, и а-субъединицы, необходимой для правильного присоединения фермента к промотору и отделяющейся от РНК-полимеразы после начала синтеза РНК. Минимальная РНК-полимераза состоит из четырех субъединиц: двух идентичных а-субъ-единиц и неидентичных р - и р - субъединиц. В р - и р - субъединицах имеется по одному атому Zn. Размеры этих субъединиц у других бактерий примерно такие же. ДНК) и ширину примерно 40 нм. Эти субъединицы контактируют с ДНК в комплексе РНК-полимеразы с промотором и несут в себе каталитические центры. [9]
У бактерий молекула РНК-полимеразы состоит из двух компонентов: минимальной РНК-полимеразы, или кор-фермента ( от англ, core - сердцевина), содержащего все каталитические центры, участвующие в синтезе РНК, и а-субъединицы, необходимой для правильного присоединения фермента к промотору и отделяющейся от РНК-полимеразы после начала синтеза РНК. Минимальная РНК-полимераза состоит из четырех субъединиц: двух идентичных а-субъ-единиц и неидентичных Р - и р - субъединиц. В ( 5 - и ( У-субъединицах имеется по одному атому Zn. Размеры этих субъединиц у других бактерий примерно такие же. ДНК) и ширину примерно 40 нм. Эти субъединицы контактируют с ДНК в комплексе РНК-полимеразы с промотором и несут в себе каталитические центры. [10]
Они показали, что процесс ингибирования ацетилэстеразы должен протекать по бимолекулярному механизму и независимо от рН реакционной среды выше предела устойчивости фермента. Авторы пришли к выводу, что действие ДФП осуществляется по месту присоединения фермента к субстрату. [11]
Иммобилизация ферментов приводит к получению специфических гетерогенных катализаторов, которые могут быть повторно использованы, если они достаточно стабильны. На колонках можно осуществлять непрерывный катализ, что позволяет автоматизировать катализируемые процессы. Реакции, катализируемые иммобилизованными ферментами, обычно требуют меньше места для аппаратуры и легче контролируются. При присоединении ферментов к подходящему носителю они становятся часто более стабильными по сравнению со свободными ферментами ( разд. Применение инкапсулированных или включенных в матрицу ферментов в медицине может предотвратить иммунологические реакции организма. [12]
Страницы: 1