Репрессор - фаг
Cтраница 1
Репрессор фага К представляет собой димер из двух идентичных субъединиц. Субъединицы состоят из двух компактных доменов примерно одинаковых размеров, соединенных короткой перемычкой ( всего в мономере репрессора 236 а. Перемычка легко расщепляется протеазами. N-концевой домен, полученный после расщепления протеазами ( остатки 1 - 92), способен связываться с ДНК, однако менее прочно, чем интактный репрессор. Кроме того, изолированные N-концевые домены легко диссоциируют до мономеров. Поэтому считается, что в непосредственном контакте с ДНК находится только N-концевой домен, а С-концевой домен стабилизирует-связывание с ДНК за счет стабилизации димера. [1]
Репрессор фага К представляет собой димер из двух идентичных субъединиц. Субъединицы состоят из двух компактных доменов, примерно одинаковых размеров, соединенных короткой перемычкой, ( всего в мономере репрессора 236 а. Перемычка легко расщепляется протеазами. N-концевой домен, полученный после расщепления протеазами ( остатки 1 - 92), способен связываться с ДНК, однако менее прочно, чем интактный репрессор. Кроме того, изолированные N-концевые домены легко диссоциируют до мономеров - Поэтому считается, что в непосредственном контакте с ДНК находится только N-концевой домен, а С-концевой домен стабилизирует-связывание с ДНК за счет стабилизации димера. [2]
Репрессор фага Л представляет собой димер из двух идентичных субъединиц. Субъединицы состоят из двух компактных доменоа примерно одинаковых размеров, соединенных короткой перемычкой, ( всего в мономере репрессора 236 а. Перемычка легко расщепляется протеазами. N-концевой домен, полученный после расщепления протеазами ( остатки 1 - 92), способен связываться с ДНК, однако менее прочно, чем интактный репрессор. Кроме того, изолированные N-концевые домены легко диссоциируют до мономеров. Поэтому считается, что в непосредственном контакте с ДНК находится только N-концевой домен, а С-концевой домен стабилизирует-связывание с ДНК за счет стабилизации димера. [3]
 |
Промотор галактозного оперона. [4] |
Помимо общей регуляции с помощью БАК-сАМР существует индивидуальная регуляция катаболитных оперонов. Классическим примером является негативная регуляция лактозного оперона. В отличие от ранее рассмотренных димерных белков-регуляторов реп-рессор лактозного оперона представляет собой тетрамер и содержит два идентичных центра связывания ДНК - Пространственная структура этих центров формируется Х - концевыми участками полипептидных цепей, которые, судя по их аминокислотной последовательности, способны образовывать биспиральные элементы, аналогичные биспиральным ДНК-узнающим элементам репрессора фага л и БАК - С-концевые домены субъединиц лактозного репрессора формирует два центра связывания индуктора лактозного оперона. Оператор лактозного оперона располагается сразу за стартовой точкой транскрипции. Долгое время считалось, что присоединение лактозного репрессора к промотору стернчески мешает присоединению РНК-полимеразы. Однако недавно получены данные, свидетельствующие о том, что penpeccop и РНК-полимеразы могут расположиться на промоторе рядом друг с другом. Поэтому приходится думать о более изощренных механизмах репрессии, включающих специфические контакты репрессора с РНК-полимеразой. [5]
 |
Промотор галактозного оперона. [6] |
Помимо общей регуляции с помощью БАК-сАМР существует индивидуальная регуляция катаболитных оперонов. Классическим примером является негативная регуляция лактозного оперона. В отличие от ранее рассмотренных димерных белков-регуляторов реп-рессор лактозного оперона представляет собой тетрамер и содержит два идентичных центра связывания ДНК - Пространственная структура этих центров формируется Х - концевыми участками полипептидных цепей, которые, судя по их аминокислотной последовательности, способны образовывать биспиральные элементы, аналогичные биспиральным ДНК-узнающим элементам репрессора фага /, и БАК - С-концевые домены субъединиц лактозного репрессора формирует два центра связывания индуктора лактозного оперона. Оператор лактозного оперона располагается сразу за стартовой точкой транскрипции. Долгое время считалось, что присоединение лактозного репрессора к промотору стерически мешает присоединению РНК-полимеразы. Однако недавно получены данные, свидетельствующие о том, что penpeccop и РНК-полимеразы могут расположиться на промоторе рядом друг с другом. Поэтому приходится думать о более изощренных механизмах репрессии, включающих специфические контакты репрессора с РНК-полимеразой. [7]
Степень индукции SOS-системы в определенном смысле отражают благополучие клетки и ее шансы на выживание. Поэтому некоторые относительно автономные внутриклеточные генетические; элементы, например умеренные бактериофаги, используют индукцию SOS-системы в качестве сигнала для размножения и уничтожения клетки-хозяина: безвредный до того участок хромосомы ( про-фаг, см. гл. XIII), почувствовав слабость хозяина, начинает размножаться и уничтожает его, чтобы спастись самому. Для фага лямбда показано, что чувствительность к состоянию индукции SOS-системы объясняется тем, что репрессор фага устроен аналогично белку LexA и самораскусывается, связавшись с активированным RecA-белком. [8]
Степень индукции SOS-системы в определенном смысле отражают благополучие клетки и ее шансы на выживание. Поэтому некоторые относительно автономные внутриклеточные генетические элементы, например умеренные бактериофаги, используют индукцию SOS-системы в качестве сигнала для размножения и уничтожения клетки-хозяина: безвредный до того участок хромосомы ( про-фаг, см. гл. XIII), почувствовав слабость хозяина, начинает размножаться и уничтожает его, чтобы спастись самому. Для фага лямбда показано, что чувствительность к состоянию индукции SOS-системы объясняется тем, что репрессор фага устроен аналогично белку LexA и самораскусывается, связавшись с активированным RecA-белком. [9]
 |
Образование петли ДНК при кооперативном взаимодействии рспрессора с операторными участками, разделенными целым числом витков спирали ДНК. [10] |
Белок-активатор катаболитных оперонов ( БАК) в комплексе с циклическим сАМР активирует транскрипцию большого числа оперонов, отвечающих за расщепление различных соединений, преимущественно Сахаров, используемых бактериальной клеткой в качестве источникон энергии и углерода. Концентрация с AMP в клетках повышается при росте на плохо усваиваемых источниках, например ацетате или глицерине, и снижается при росте ни легко усваиваемых, например глюкозе. Поэтому система регуляции с помощью БАК-сАМР позволяет клетке включать опероны катаболизма лишь по мере истощения более легко усваиваемых пищевых веществ. БАК состоит из двух идентичных субъединиц. Каждая субъеди-ница образует два домена, но в отличие от репрессора фага Я за связывание с ДНК отвечает С-концевой домен. N-концевой домен БАК связывается с сАМР и обеспечивает межсубъединичные контакты в димере. [11]
Белок-активатор катаболитных оперонов ( БАК) в комплексе с циклическим сАМР активирует транскрипцию большого числа оперонов, отвечающих за расщепление различных соединений, преимущественно Сахаров, используемых бактериальной клеткой в качестве источников энергии и углерода. Концентрация с AMP в клетках повышается при росте на плохо усваиваемых источниках, например ацетате или глицерине, и снижается при росте на легко усваиваемых, например глюкозе. Поэтому система регуляции с ломощью БАК-сАМР позволяет клетке включать опероны катаболизма лишь по мере истощения более легко усваиваемых пищевых веществ. БАК состоит нз двух идентичных субъединиц. Каждая субъеди-яица образует два домена, но в отличие от репрессора фага Я за связывание с ДНК отвечает С-концевой домен. N-концевой домен БАК связывается с сАМР и обеспечивает межсубъединичные контакты в димере. [13]
Белок-активатор катаболитных оперонов ( БАК) в комплексе с циклическим сАМР активирует транскрипцию большого числа оперонов, отвечающих за расщепление различных соединений, преимущественно Сахаров, используемых бактериальной клеткой в качестве источников энергии и углерода. Концентрация с AMP в клетках повышается при росте на плохо усваиваемых источниках, например ацетате или глицерине, и снижается при росте на легко усваиваемых, например глюкозе. Поэтому система регуляции с помощью БАК-сАМР позволяет клетке включать опероны катаболизма лишь по мере истощения более легко усваиваемых пищевых веществ. БАК состоит из двух идентичных субъединиц. Каждая субъединица образует два домена, но в отличие от репрессора фага Я за связывание с ДНК отвечает С-концевой домен. N-концевой домен БАК связывается с сАМР и обеспечивает межсубъединичные контакты в димере. [15]
Страницы: 1