Риботимидин

Cтраница 1

Риботимидин - весьма редкий рибонуклеозид, построенный из тимина и рибозы. В качестве минорного компонента входит в состав некоторых РНК. [1]

Предполагаемая вторичная структура предшественника тирозиновой тРНК Е. coli. Нуклеотиды, которые обнаруживаются в зрелой тРНК в модифицированной форме, представлены на рисунке с соответствующими модификациями ( Schaeffer К. Р -, Altaian S., Soil D., PNAS, 70, 3626 - 3630, 1973. Показана также часть нуклеотидной последовательности участка гена, кодирующего тРНК и расположенного после ССА-конца. Обратите внимание на участок, обладающий вращательной симметрией второго порядка ( обозначен вертикальными линиями и точкой и на два участка с обращенными нуклеотидными последовательностями. [2]

Метилирование уридина по положению 5 приводит к образованию риботимидина. По этому же положению может быть модифицирован и цитидин. При восстановлении двойной связи между С-5 и С-6 образуется дигидро-уридин. Замещение кислорода в положении 4 на серу дает 4 - тиоурИ1 - дин. [3]

В состав фрагмента ( а), содержащего З - концевую группу тРНК, входят редкие компоненты 1-метилинозин ( положение 39) и риботимидин ( 55), которые встречаются только один раз в данной РНК; они могут быть использованы как отправные точки при воссоздании последовательности нуклеотидов в молекуле. Исследуемый препарат аланиновой тРНК был смесью двух близкородственных соединений, у части молекул остаток уридина в положении 48 был заменен на остаток 5 6-дигидроуридина; при гидролизе образовывалась соответствующая смесь близких олигонуклеоти-дов, которые обычно не разделялись и содержали ( по данным спек-трофотометрического определения) дробное число молей уридина. [4]

Нуклеотилная последовательность и вторичная структура дрожжевой алани-новой тРНК; линии между антипараллельными участками обозначают водородные связи между комплементарными парами оснований ( р-остаток фос-форяой к-ты); молекула содержит семь минорных нуклеозидов: - псевдо-уридин, 1-инозии, Т - риботимидин. Тч / - шгшлька, 3 - У-петля, 4-антикодониая ветвь, 5-дпгидроуридп-ловая ветвь. [5]

Схема вторичной структуры РНК.| Схема биосинтеза РНК на ДНК-матрице. здесь подробно показан только транскрибируемый участок цепи ДНК Звездочка обозначает инициацию транскрипции. Транскрипция имеет направление 5 - 3. Пунктирами показаны места разрывов РНК при щелочном гидролизе. [6]

При его образовании этерификация риботимидина осуществляется по 5 -углеродяо-му атому рибозы. [7]

Ретиааль ( Ретинин) 653, 654 Ретинол ( Витамин AI) 653 ел. Рибоза 361, 362, 365, 782, 789 Риботимидин 748 В-Рибоновая кислота 365 Рибонуклеазы 742, 750, 751, 771, 774, 775 Рибонуклеиновые кислоты ( РНК) 744, 749, 751 ел. [8]

Обычно их называют соответственно дезоксигуанозином, дезокси-аденозином, дезоксицитидином и тимидином. Довольно редко встречающийся рибонуклеозид, в состав которого входят рибоза и тимин, получил название риботимидина. [9]

В случае 2 -дезоксирибонуклеозидов синтетические работы оказались гораздо сложнее, чем для их рибо-аналогов из-за малой доступности 2-дезоксирибозы, так и из-за относительной нестабильности ее производных, необходимых для синтеза гликозидной связи. В результате первым синтетическим достижением в этой области было прямое превращение рибонуклеозидов в соответствующие дезоксирибонуклеозиды, иллюстрируемое на примере трансформации риботимидина в дезоксириботимидин ( 12) схема ( 1) [15], см. также разд. [10]

Нуклеотидная последовательность дрожжевой аланиновой тРНК, определенная Холли и его сотрудниками и изображенная в форме клеверного листа, В дополнение к A, G, U и С использованы следующие символы для модифицированных нуклеозидов. - псевдоуридин, I-инозин, Т - риботимидин, DHU-56 - дигидроуридин, m I-1 - метилинозин, m G-1 - ме-тилгуанозин, ш2С - К2 - диметилгуанозин. Модифицированные нуклеозиды даны на красном фоне. Красные линии между параллельными участками молекулы обозначают комплементарные пары оснований. Антикодон обладает способностью узнавать алаииновые кодоны в мРНК. Другие особенности структуры тРНК отмечены в тексте и на 29 - 4. В РНК G может образовывать пары и с С, и с U, хотя пара G-U не так стабильна, как уотсон-кри-ковская пара G-C.| Обобщенная вторичная структура, характерная для всех тРНК. Если изобразить структурные формулы тРНК с учетом принципа образования максимального числа внутримолекулярных пар, то для всех тРНК они принимают форму клеверного листа. Черные кружки на остове молекулы обозначают нуклеозид-ные остатки, а красные линии проведены между комплементарными основаниями. Положения, занимаемые во всех тРНК одними и теми же основаниями, выделены красным фоном. Размеры тРНК варьируют от 73 до 93 нуклеотидов. Добавочные нуклеотиды встречаются в дополнительной и дигидроуридиловой ветвях. На вершине антикодоновой ветви расположена ан-тикодоновая петля, которая всегда содержит семь неспаренных нуклеотидов. В состав дигидроуридиловой ветви обычно входит до трех остатков DHU. [11]

В некоторых тРНК дигидроуридиловая ветвь состоит всего из трех пар оснований, соединенных водородными связями. Обозначения: Ри-пуриновый нуклеозид, Ру-пиримидиновый нук-леозид, / - псевдоуридин, С - гуанозин или 1 - О-метилгуанозин, Т - риботимидин, DHU-ди-гидроуридин. [12]

ТИМИДЙН, нуклеозид, состоящий из пиримидинового основания тимина и углевода дезоксирибозы. Обнаружен во всех живых клетках в составе ДНК и ти-мидинфосфорных к-т. Нуклеозид тимина и рибозы ( риботимидин, 5-метилури-дин) относится к редким нуклеозидам и обнаружен в составе риботимидиновой к-ты, минорного нуклеотида транспортных РНК. [13]

Пиримидиновые основания соединяются с углеводом своими N-1, а пуриновые - N-9 атомами азота. Нуклеозиды, содержащие аденин и гуанин, называются аде но зи ном или дезоксиаденозином и гуа-нозином или дезоксигуанозином. Нуклеозиды - производные ура-цила и цитозина называются соответственно уридином или дезокси-уридином и цитидином или дезоксицитидином. Дезоксирибопроиз-водное тимина принято называть тимидином, а рибопроизводное - риботимидином. [14]

Страницы: 1