Сильное гидрофобное взаимодействие
Cтраница 1
Сильные гидрофобные взаимодействия возникают также и в складчатых структурах. Немети и Шерага [9] показали, что гидрофобные взаимодействия влияют на температурный переход спираль - клубок. По их теоретическим расчетам, в результате гидрофобных взаимодействий боковых цепей температурный переход полиала-нина, состоящего из 100 аминокислотных остатков, должен быть на 175 выше, чем у полиглицина такой же длины. Экспериментально же было найдено, что поли - Л - аланин, состоящий из 175 остатков, сохраняет а-спиральную конформацию вплоть до 95 С, а полиглицин не существует в неводных растворителях в а-спираль-ной конформации. [1]
Однако при хроматографии ДНФ-аминокислот на смолах типа дауэкс 50W наблюдается сильное гидрофобное взаимодействие хромофора с ароматическими группировками матрицы, что приводит к появлению размытых, почти сливающихся зон. Во избежание этого в буферный раствор добавляют вещества ароматической природы; в частности, хорошие результаты получены в присутствии л-оксибензойной кислоты. Оптимальное разрешение получают при нанесении 0 5 мкмоля ДНФ-аминокислот. Порядок выхода ДНФ-аминокислот следующий: суммарный пик ДНФ-производных кислых и нейтральных аминокислот, им - ДНФ-гистидин, лизин, гистидин, аммиак, е - ДНФ-лизин, аргинин, О-ДНФ-тирозин. [2]
Если у хирального лиганда отсутствует заместитель с длинной алкильной цепью, отсутствуют и сильное гидрофобное взаимодействие с алкилсиликагелем, и закрепление лиганда вследствие физической сорбции. [3]
Соответственно производная Э г / ЗГ будет положительна и мала. При сильном гидрофобном взаимодействии интегрирование до второго минимума дает ощутимый положительный вклад, дальнейшее интегрирование даст небольшой отрицательный вклад. В результате производная будет положительна и явно больше, чем в первом случае. [4]
Вторичная структура может служить блоком в самосборке, если, во-первых, она формируется значительно быстрее, чем третичная, во-вторых, если она существует достаточно долго и, в-третьих, если она достаточно велика и гидрофобна, чтобы включиться в сильное гидрофобное взаимодействие. И а-спирали, и ji - формы удовлетворяют этим требованиям. Для расчета вторичной структуры необходимы параметры равновесия ( величины s, с. [5]
Незначительное торможение наблюдается при введении катионных ( DECS, структура 5 Rt R2 C2H5) и анионных ( NAPAA) гидрофильных полимеров. Анионный полимер с высокой гидрофобностью ( NaPSS) резко замедляет реакцию. Как видно из данных табл. 3.7, введение гидрофобного катионного полимера приводит к сильному гидрофобному взаимодействию катионов красителя и к электростатическому отталкиванию между ними, а добавка гидрофобного анионного полимера - к гидрофильному взаимодействию и электростатическому притяжению. В то же время сильное электростатическое отталкивание между группами ОН обусловливает энергичное вытеснение реагентов. Высокогидрофобная катионная добавка СТАВг обеспечивает ускорение реакции, большее, чем CJ6BzPVP, а анионные добавки NaLS и NaPSS приводят к замедлению примерно того же порядка. Снижение скорости реакции при добавке NaDNA объясняется тем, что в условиях эксперимента DNA является высокогидрофобным анионным агентом. [7]
 |
Порядок элюции обычных и метилированных оснований при их фракционировании на колонке пленочного катионообмснннка Zipax SCX [ Yuki et al., 1979 ]. [8] |
Нуклеиновые основания разделяли на смоле Dowex 50 ( Н), нанося и изократически элюируя их смесь 2 и. В этих условиях практически без задержки с колонки выходил урацил, за ним следовали цитозин, гуанин и значительно позднее - аденин. Очевидно, что цитозин выходил раньше, чем аденин и даже гуанин, за счет того, что пуриновые основания задерживались сильным гидрофобным взаимодействием с полистирольной матрицей. [9]
В соответствии с этим принципиального различия между описанными выше методами и теми методами, которые рассматриваются в этом разделе, не существует. Так, фаза Пиркла, связанная ионной связью с носителем ( см. разд. ХНФ, если она используется в сочетании с неполярными растворителями, так как в этом случае подвижная фаза проявляет очень небольшую тенденцию к вытеснению хирального селектора с сорбци-онных центров. В этих условиях добавки хирального селектора к подвижной фазе не являются обязательными. Если же селектор закреплен на алкилсиликагеле или другой гидрофобной матрице, вследствие наличия сильных гидрофобных взаимодействий ситуация может быть вполне аналогичной, но все же необходимость сохранения постоянной степени покрытия матрицы обычно требует присутствия селектора в подвижной фазе. [10]
В отличие от многих природных соединений ферменты обладают тонкой структурой; от других белков их отличает особая топография молекул, характерная для активной формы фермента. Высокоспецифическая структура нативного фермента способна легко нарушаться под воздействием внешних факторов. У некоторых ферментов нарушение четвертичной структуры часто влечет за собой потерю активности, причем иногда инактивация необратима. Более глубокие изменения, затрагивающие конформацию всей полипептидной цепи, ведут к денатурации. Известны случаи поверхностной денатурации при контакте фер - - мента с некоторыми сорбентами, основной причиной которой является сильное гидрофобное взаимодействие. Возможность инактивации или денатурации следует всегда учитывать при разработке схемы выделения и фракционирования ферментов. [11]
Страницы: 1