Конформационная возможность
Cтраница 1
Многообразие конформационных возможностей затрудняет рассмотрение, и поэтому для изучения собственно инверсии азота используют, например, мссти-ковые соединения, в которых интерконверсия цикла невозможна. [1]
Лучше всего для описания конформационных возможностей молекулы подходит аппарат теории графов. [2]
Циклические тетрапептиды имеют уже значительно больше конформационных возможностей. Минимизируя потенциальную функцию в предположении, что молекула обладает осью симметрии четвертого порядка, эти авторы получили оптимальную конформацию ср 83, ф129, 351 ( ш-деформация 9), что действительно близко к углам вращения а-спирали. Аналогичный расчет с потенциалами разных авторов был проведен для циклотетраглици-на. Эта молекула, как и циклотетрааланин, должна обладать осью симметрии четвертого порядка, причем минимизацией потенциальных функций было показано, что симметричные молекулы действительно имеют наименьшую энергию. [3]
 |
Пример [ ( информационной карты. [4] |
ППЭ дает полную информацию о конформационных возможностях системы. Отметим, что если для химических реакций расчет ППЭ чрезвычайно трудоемок, то для конформационных превращений использование метода атоматомных потенциалов зачастую делает эту задачу вполне разрешимой. Однако трудность наглядного представления много-мерных поверхностей делает их бесполезными для интерпретации онфбрмационного поведения сложных систем. Кроме того, ППЭ и ПНЭ характери - тичны, лишь будучи рассчитанными в канонической ( определяемой с учетом масс атомов) системе Оординат, выбор которой сложен. А вот стационар - ] ые точки, в частности, седловые и точки минимума, ре зависят от избранной системы координат. [5]
ППЭ дает полную информацию о конформационных возможностях системы. Отметим, что если для химических реакций расчет ППЭ чрезвычайно трудоемок, то для конформационных превращений использование метода атом-атомных потенциалов зачастую делает эту задачу вполне разрешимой. Однако трудность наглядного представления многомерных поверхностей делает их бесполезными для интерпретации конформационного поведения сложных систем. [6]
Валиномицин со своим 36-членным циклом обладает прекрасными конформационными возможностями. Из спектральных данных следует, что валиномицин существует в виде равновесной смеси трех основных конформеров. Соотношение конформеров в смеси зависит от растворителя и температуры. Кристаллографические Данные о двух различных модификациях [144, 145] указывают на небольшие различия в конформации кольца, напоминающие предполагаемый конформер в неполярном растворителе. [7]
Стереохимия циклических производных, содержащих несколько гидрааин-ных фрагментов, усложняется вследствие появления больших конформационных возможностей для заместителей. [8]
Однако значение параметров активации для рацемизации оптически активного mpawc - циклооктена [87] несколько затушевывается [84] этими дополнительными конформационными возможностями. [9]
Можно рассматривать с известным приближением такие системы, как модели неизмеримо более гибких и пластичных природных катализаторов - ферментов. По-видимому, слишком строгое и неизменное следование кодовым правилам, определяемым жесткой геометрией взаимодействующих частиц, настолько ограничивает возможности реакций, что биологическая эволюция выдвинула на первый план именно белковые катализаторы, обладающие громадным числом конформационных возможностей, и связала их с такими субстратами, молекулы которых тоже в известной мере способны к деформациям. [10]
Конфигурация 4-метилциклогек-сена известна [100]; была предложена структура переходного состояния для корреляции ее с конфигурациями эфиров. Однако исходный асимметрический центр оказался далек от того участка в молекуле, который ответствен за создание нового хирального звена, а существование ряда конформационных возможностей делало такую модель весьма ненадежной, особенно если иметь в виду, что асимметрическая направленность реакции была так невелика. [11]
Ценная информация о структуре биологических макромолекул может быть получена также при рентгеноструктурных исследованиях ориентированных волокон, в которых образец не является совершенным кристаллом, но длинные оси кристаллических участков ориентированы вдоль волокна. Из-за несовершенной ориентации рентгеновские рефлексы выражены не так четко, и они не так многочисленны, как в случае совершенных монокристаллов. Однако рефлексы, соответствующие той или иной периодичности волокна, все-таки можно зарегистрировать. Они позволяют определить, обладают ли рассеивающие в данном направлении группы периодичностью вдоль волокна или же перпендикулярно ему. Эти сведения без привлечения дополнительных данных недостаточны для однозначного построения структуры кристаллических областей. Обычная процедура исследования заключается в том, что на основе известной структуры ковалентного остова молекулы и всей доступной информации о конформационных возможностях молекулы, полученной другими методами, исследователь пытается определить, а точнее угадать, конформацию молекулы, которой соответствовала бы наблюдаемая рентгенограмма. [12]
Потенциальная производительность и гидрогазодинамическая способность на практике никогда не реализуются, так как оцениваемые таким способом элементарные геологические тела ( прослои, линзы и т.п.) редко работают индивидуально, независимо от других тел. Они, как правило, являются элементами структуры, поэтому их фактическая производительность обусловливается не только ФЕС, но и положением в структуре залежи, влиянием этой структуры. К сожалению, сегодня широко распространены расчеты ради расчетов, основанные на использовании так называемых безадресных моделей, различных способах схематизации залежей и т.п. Это значит, что общепринятый сегодня подход к решению задач проектирования разработки связан с поиском способов, с помощью которых можно было бы абстрагироваться от спациоструктуры залежи. Это есть подход, связанный со снятием структуры, использованием характеристик понижающих, ухудшающих показатели гидрогазодинамического потока в неоднородной среде по сравнению с однородной. Практика показала, что такой подход оказался неплодотворным, что характеристика поля ВТП не является достаточно полной, если не включает в себя данных о ГД-конформации поля ВТП при имеющих место структурах ГК и ТК ГТК, о конформационных возможностях ГТК при той или иной его гиперструктуре. Тенденция к детализации знания о поле ВТП должна стать важнейшей в дальнейшем развитии современной нефтегазовой науки, которая в свою очередь должна дать методы определения набора параметров ГД-конформаций. [13]
Планарность этой связи и возможность возникновения диполя обусловливают ее жесткость. Жесткая пептидная связь существенно ограничивает возможность конформационных переходов в макромолекуле. Боковые радикалы аминокислотных звеньев создают дополнительные стерические затруднения для конформационных переходов. Звенья Gly лишены бокового радикала и не проявляют асимметрии при С0 - атоме. В связи с этим данные звенья в полипептидной цепи играют роль своеобразного шарнира, позволяя остаткам Gly обеспечивать возможность конформационных переходов. Однако содержание Gly в полимерных цепях ограничено: его избыток привел бы к резкому возрастанию гибкости макромолекул. Важной особенностью строения полипептидной цепи является тот факт, что все полярные и неполярные боковые радикалы отделены от Са-атома группой СН2, что обеспечивает увеличение конформационных возможностей полимерной цепи. [14]
Страницы: 1