Группа - гем
Cтраница 1
Группа гема видна почти сбоку в вертикальной щели в молекуле. [2]
 |
Олигомерная молекула гемоглобина ( красные диски-группы гема.| Модель гемоглобина ( по Перутцу. [3] |
Цепи светлые; р-цепи темные; группы гема красные. [4]
Апоцитохром с полностью развернут. Апоцитохром с с отщепленной группой гема совершенно несвернут. Центральное положение гема, как составной части структуры, подчеркивается тем обстоятельством, что эволюционно наиболее хорошо сохраняются те аминокислотные боковые цепи ( если сопоставлять цитохромы с известными последовательностями из 70 источников [509]), которые находятся вблизи атома железа и винильной группы, а также гидрофобные остатки, упакованные вокруг гема. [5]
Одним из веществ, обнаружение которых в метеоритных образцах убедительно подтверждает гипотезу существования внеземной жизни, является порфин ( рис. 20 - 18), а также его производные, порфирины. Один из таких комплексов с железом, имеющий боковые цепи, изображен на рис. 20 - 20 и называется группой гема. Порфириновый комплекс магния с органической боковой цепью, показанный на рис. 20 - 21, представляет собой хлорофилл. [6]
В апоцитохроме &5 имеется такой же жесткий участок связывания гема, как и в гемоглобине. В случае цитохромов Ь базовый набор слишком мал для того, чтобы установить, насколько инвариантны неполярные остатки в специфических положениях, взаимодействующих с группой гема. Структура гемсвязывающего центра может свидетельствовать об определенной свободе, с которой можно расположить образующие полость неполярные остатки. Предварительные данные, основанные на сопоставлении последовательности гемсвязывающего фрагмента Ь2 с третичной структурой & з [557], показывают, что в семействе цитохрома Ь, как и в случае глобинов, сохраняется лишь общая картина неполярных контактов, но не отдельные боковые цепи. [7]
Апомиоглобин имеет богатую спиралями глобулярную структуру, подобную структуре миоглобина. В отличие от неустойчивой напоминающей кокон оболочки гема в цитохроме с в гемоглобине полость гема образована из жестких стабильных а-спиралей. Группа гема здесь не является основным элементом, определяющим укладку цепи: апомиоглобин, например, образует третичную структуру и в отсутствие простетических групп ( гл. Более мягкие структурные требования к взаимодействию гема и белка в гемоглобинах отражает также тот факт, что для членов семейства глобинов [277, 634] инвариантна только общая картина неполярных контактов гема. Структурно эквивалентные положения у них заняты различными аминокислотными остатками. [8]
Это свойство позволяет отличить модификацию боковой цепи от простетической группы, которая может ковалентно присоединяться к боковой цепи, но которая прочно связана невалентными силами также и с белком. Примерами простетических групп, ковалентно присоединяющихся к некоторым белкам, могут служить FAD [160] и группа гема. Для этих белков они, конечно, являются в некоторых отношениях модификациями боковых цепей. Следует отметить, что любая биологическая классификация страдает некоторой неопределенностью. [9]
Это свойство позволяет отличить модификацию боковой цепи от простетической группы, которая может ковалентно присоединяться к боковой цепи, но которая прочно связана невалентными силами также и с белком. Примерами простетических групп, ковалентно присоединяющихся к некоторым белкам, могут служить FAD [160] и группа гема. Для этих белков они, конечно, являются в некоторых отношениях модификациями боковых цепей. Следует отметить, что любая биологическая классификация страдает некоторой неопределенностью. [10]
Страницы: 1