Аминоацильный

Cтраница 2

Чтобы принять участие в синтезе белка, сначала аминокислоты активируются в цитозоле с помощью специфических аминоацил-т РНК-синтетаз. Эти ферменты катализируют образование эфирной связи между аминоацильным остатком и соответствующей тРНК, сопровождающееся расщеплением АТР до AMP и пирофосфата. [16]

На III стадии процесса элонгации необходимо иметь свободный амино-ацильный центр для присоединения следующей аа-т РНК. Для этого благодаря процессу транслокации образовавшийся фрагмент дипептидил-т РНК переносится от аминоацильного на пептидильный центр. [17]

Шаро-стержневая скелетная модель пуромицина ( без водородов, основанная на данных рентгеноструктурного анализа ( по М. Sundaralingam et al. J. Mol. Biol., 1972, v. 71, p. 49 - 70. [18]

Знание конформации реагирующих субстратов в пептидилтрансфе-разном центре рибосомы имеет ключевое значение для понимания молекулярного механизма реакции транспептидации, катализируемой рибосомой. Однако какие-либо прямые сведения о тех конформа-циях, в которых 3 -концы тРНК и примыкающие аминоацильные остатки реагируют друг с другом, отсутствуют. [19]

Пуромицин представляет собой З - дезокси - З - амино - М - диметил-аденозин, ацилированиый по 3 -аминогруппе остатком О-метил-тирозина. Структурно он очень близок концевому фрагменту амино-ацил - тРНК, ио благодаря значительно меньшему объему быстрее связывается с аминоацильным ( акцепторным) участком 50S ( или 60S) субчастицы рибосомы. После ацилирования саязаниого пуро-мицина по аминогруппе пептидилтрансферазой образующийся фор-ми л метиоиилпептиди л пуромицин из-за отсутствия кодон-антико-донного взаимодействия мгновенно отщепляется от рибосомы. Монро в 1964 г. и чрезвычайно широко используется в биохимии. Для ее протекания необходимо наличие у аналогов пуромицина L-конфигурации и ароматического кольца в боковой цепи. Отсутствие избирательности пуромицина по отношению к рибосомам про - и эукариотов, очевидно, объясняет его довольно высокую токсичность. [20]

Можно не сомневаться, что наблюдаемое различие в скоростях реакций частично обусловлено тем, что гидроксильная группа рибозы легче образует анион, чем вода. Тем не менее вклад, который вносит в увеличение скорости реакции близость соседней к ацетилу гидроксильной группы, должен быть значительным. Миграция протекает существенно быстрее в случае высокореакционных аминоацильных производных. [21]

С тех пор были определены последовательности более 100 тРНК из разных источников, и оказалось, что, несмотря на значительные различия первичных структур, все тРНК имеют сходную вторичную структуру типа клеверного листа. Эта структура характеризуется пятью ответвлениями ( лепестками), в составе которых имеется одноцепочечный участок и двухцепочечный стебель. Каждому ответвлению присвоено свое название либо по структурному, либо по функциональному признаку: участок, включающий З - кон-цевое звено тРНК, к которому присоединяется аминокислота, получил название аминоацильного ( АА; содержащий в петле анти-кодон - антикодонового ( АС); участок, в петле которого содержится общая для всех тРНК последовательность Т С - Т - участка; участок, содержащий дигндроуридины - D-участка. Наконец, фрагмент структуры, расположенный между Т - и АС-ответвлениями, имеет для всех тРНК различные размеры н называется вариабельным V-участком. [22]

Так, М - ацетил - А 8-вазопрессин ( I) [2223] ( соединения с римской нумерацией см. в табл. 16) и Ь1 - ацетил - Ьу58 - вазо-прессин ( II) [470] не влияют на кровяное давление у крыс в дозах до 200 и 100 мкг соответственно; оба соединения оказывают слабое ингибирующее действие. Выше отмечалось, что удаление концевой аминогруппы окситоцина ( дезаминооксито-цин) приводит к повышению биологической активности. У дезамино - Аг § 8-вазопрессина ( XXXVI) [2737] прессорная активность практически не меняется, а антидиуретическая - возрастает до 1300 / мг ( по сравнению с Arg8 - вазопрессином), что представляет собой наивысшую величину среди всех гормонов нейрогипофиза и их аналогов. Замещение концевой аминогруппы Ьу58 - вазопрессина аминоацильным или пептидильным остатком приводит к иному эффекту, чем в случае окситоцина. Например, ( О1у - Су5) 4-окситоцин не проявляет окситотической или вазопрессорной активности и ингибирует действие окситоцина на кровяное давление у птиц, a ( Gly-Cys) 1 - Ьуз8 - вазопрессин ( XXVII) [2651] сохраняет некоторую прессор-ную и антидиуретическую активность ( 15 и 10 - 40 / мг соответственно); последняя носит пролонгированный характер. [23]

Трансфераза I - растворимый белковый фактор, который наряду с другими факторами обеспечивает условия биосинтеза белковых полипептидных цепей, связанных с рибосомой. Трансфераза I выполняет функцию аминоацил-т РНК-связывающего фактора. В присутствии ГТФ она связывает аминоацил-т РНК с рибосомой. Если пептидильный участок рибосомы содержит пептидил-т РНК, то последняя образует пептидную связь с аминоацил-т РНК и при переносе пептидильной группы не требуется наличия растворимого белкового фактора или ГТФ. Удлинившаяся при этом пеп-тидил - тРНК связывается с аминоацильным участком рибосомы. [24]

В это же время инициирующая формилметионин-т РНК связывается с IF-2 и ГТФ. Это связывание происходит с помощью фактора IF-1, который способствует соединению мРНК с инициирующим комплексом, состоящим из малой субъединицы, формилметионин-т РНК, IF-2, IF-3, ГТФ. Белковый фактор IF-2 способствует соединению большой и малой субъединиц рибосомы. После присоединения большой субъединицы высвобождаются все инициирующие факторы, ГДФ и неорганический фосфат, т.е. процесс идет с затратой энергии. Смысл всех этих операций заключается в том, что мРНК соединяется с инициирующей ( формил) метионин-т РНК в рибосоме единственно возможным способом, определяющим точное положение рамкИ считывания ко-донов мРНК на инициирующем кодоне. В работающей рибосоме есть два участка связывания транспортных РНК ( тРНК): А-участок ( аминоацильный), имеющий сродство к аминоацил-т РНК, и Р - уча-сток ( пептидильный), имеющий сродство к пептидил-т РНК. [25]

Страницы: 1 2