Единственная молекула
Cтраница 3
Следует отметить, что источником восстановительного потенциала, необходимого для создания углеродного скелета жирной кислоты с одинарными связями, служит NADPH. Первая, причем неожиданная, особенность этой реакции состоит в том, что роль непосредственных предшественников семи из восьми двух-углеродных единиц молекулы пальмитиновой кислоты играют трехуглеродные остатки малоновой кислоты. Единственная молекула ацетил - СоА, необходимая для синтеза жирной кислоты, служит затравкой. [32]
В результате того что при моделировании используется неподвижная основная цепь белка, резкость максимумов рассчитанной плотности оказывается преувеличенной. Поэтому области теплового движения кристаллографически обнаруженных молекул и молекул, положение которых определяется методами моделирования, находятся в удовлетворительном согласии. Единственная молекула воды, со всех сторон окруженная белком, имеет как наиболее низкое значение температурного фактора, так и самое узкое распределение вычисленных плотностей. [33]
Вирусы с () РНК-геномами относительно просто устроены, и это их большое достоинство. Однако при естественных условиях заражения в клетку часто попадает лишь одна молекула вирусной () РНК. Эта единственная молекула должна выдержать конкуренцию за компоненты белок-синтезирующего аппарата с преобладающими силами клеточных мРНК да еще и сохраниться, чтобы послужить матрицей для репликации вирусного генома. Но зато такие системы приобретают очень большое преимущество - попавшая в клетку единственная вирусная частица способна наработать огромное количество молекул мРНК - Если речь идет о вирусах эукариот, то опять кажется разумным обеспечить образование нескольких видов мРНК, даже если родительский геном - это единая молекула. [34]
Вирусы с () РНК-геномами относительно просто устроены, и это их большое достоинство. Однако при естественных условиях заражения в клетку часто попадает лишь одна молекула вирусной () РНК. Эта единственная молекула должна выдержать конкуренцию за компоненты белок-синтезирующего аппарата с преобладающими силами клеточных мРНК да еще и сохраниться, чтобы послужить матрицей для репликации вирусного генома. [35]
Вирусы с () РНК-геномами относительно просто устроены, и это их большое достоинство. Однако при естественных условиях заражения в клетку часто попадает лишь одна молекула вирусной ( - f) PHK. Эта единственная молекула должна выдержать конкуренцию за компоненты белок-синтезирующего аппарата с преобладающими силами клеточных мРНК да еще и сохраниться, чтобы послужить матрицей для репликации вирусного генома. Если речь идет о вирусах эукариот, то опять кажется разумным обеспечить образование нескольких видов мРНК, даже если родительский геном - это единая молекула. [36]
При поглощении этой энергии пигменты-реакционные центры теряют электроны. Следовательно, Р7оо и Р 0 являются энергетической ловушкой и служат для отведения электронов из фотопоглощающего ансамбля. Это единственные молекулы ансамблей, которые могут превращать световую энергию в химическую. [37]
Для оценки величин взаимодействий белок - вода менее трудоемким способом были проведены следующие приближенные вычисления. На основании предположения, что молекула белка обладает уникальной фиксированной структурой, определяемой методами рентгеновской кристаллографии, рассчитываются взаимодействия между белком и единственной молекулой воды в отсутствие других молекул растворителя. После этого для данной простой системы можо рассмотреть поочередно все положения и ориентации единственной молекулы воды относительно белка. Рассчитанные значения энергии, представленные в виде трехмерной карты, весьма информативны в отношении описания пространства, занятого в кристалле растворителем. Принималось, что одна треть объема кристалла заполнена растворителем. [38]
Доведенная до своего логического конца идея Мильса рядом авторов интерпретируется в виде представления о том, что в основе всей биологической эволюции лежит одна единственная хкральная молекула. Такая молекула неизбежно должна была быть либо () -, либо ( -) - антиподом, а в результате ее превращений и возник якобы далее весь органический мир на Земле. В таком рассуждении, несмотря на его логичность, есть все же оттенок теологический: недаром автор одного из обзоров [42] употребляет по этому поводу выражение молекулярный Адам, намекая на то, что в этой схеме бог-отец заменен единственной молекулой, сотворившей весь мир. [39]
Доведенная до своего логического конца идея Мильса рядом авторов интерпретируется в виде представления о том, что в основе всей биологической эволюции лежит одна единственная хиральная молекула. Такая молекула неизбежно должна была быть либо () -, либо ( -) - антиподом, а в результате ее превращений и возник якобы далее весь органический мир на Земле. В таком рассуждении, несмотря на его логичность, есть все же оттенок теологический: недаром автор одного из обзоров [42] употребляет по этому поводу выражение молекулярный Адам, намекая на то, что в этой схеме бог-отец заменен единственной молекулой, сотворившей весь мир. [40]
В молекуле LIV конформация полукресла, как легко видеть из анализа пространственных моделей, уже невозможна. Остается выбрать одну из трех показанных конформаций. Теоретические расчеты и электронографическое исследование показывают [164], что конформация с плоским шестичленным кольцом ( LIVa) на этот раз является наиболее выгодной. По-видимому, это единственная молекула, для которой было обнаружено совершенно плоское циклогексановое кольцо. [41]
Фактически большинство элементарных стадий бимолекуляр-ны ( происходят при столкновении только двух молекул), не считая возможного взаимодействия с растворителем. Активные промежуточные соединения обычно образуются при геометрически и электростатически благоприятных столкновениях из частиц, концентрация по крайней мере одной из которых относительно высока. Поскольку предпочтительны пути реакции с минимальными затратами энергии, слабые связи имеют тенденцию к разрыву, а сильные - к образованию или сохранению. Бимолекулярные реакции, в которых происходит образование единственной молекулы, довольно редки ( особенно в газовой фазе) из-за трудности отвода энергии образования связи. Обычно разрыв одних и образование других связей происходят одновременно. [42]
Как было показано выше, основной изомер в большинстве случаев - плоский транс-изомер. Однако тогда, когда такой вывод делается не на основании изучения микроволнового спектра, он не является строгим. Результат, полученный для молекулы а-хлоракролеина, звучит диссонансом среди описанных выше результатов и требует подтверждения. Вместе с тем заметим, что а-хлоракролеин - это единственная молекула из а-галоидзамещенных акролеина, для которой имеются какие-либо экспериментальные результаты, и вполне может оказаться, что а-замеще-ние специфично для молекулы акролеина. [43]
Стабильность молекулы зависит от химических связей ее атомов. Как упоминалось раньше, именно квантовая физика пролила свет на первоначально весьма туманную природу химических связей. Кристалл ( подобный алмазу) является регулярным расположением атомов ( атомов углерода в случае алмаза), периодическим в трех независимых пространственных направлениях. Здесь связи распространяются между всеми атомами, и таким образом кристалл является единственной молекулой. Стабильность твердых тел является стабильностью кристаллов, и если модель Дельбрука в основном верна, то стабильность генов основывается на тех же квантовомеханических основах. Однако, в то время как в кристалле те же самые строительные кирпичи повторяются периодически, каждый атом в гене имеет свои специфические неизменяемые место и роль. Однако Шредингер говорит о гене как об апериодическом кристалле и приписывает ему высшую степень порядка и организации, чем у периодического кристалла. [44]
Многие мелкие репликоны используют альтернативную стратегию стабильного наследования. Они, по-видимому, не имеют механизма упорядоченной сегрегации, но поддерживаются в высоком числе копий. Высокая копийность обеспечивает относительно стабильное наследование репликона при случайном распределении молекул по дочерним клеткам при делении. Естественно, для этого способа принципиально важным является строгое восстановление ко-пийности, чтобы единственная молекула ДНК успела быстро размножиться до характерного для нее числа копий до начала следующего деления клетки. [45]
Страницы: 1 2 3 4