Cтраница 4
Чтобы расшифровать нуклеотидную последовательность целой молекулы ДНК, сначала ее фрагментируют с помощью рестрикти-рующей эндонуклеазы. Во второй аликвоте исходную ДНК расщепляют в других местах, используя другую рестриктирующую эндонуклеазу, и получают второй набор фрагментов. После того как секвенирование всех фрагментов второго набора завершено, сравнение двух наборов дает возможность найти участки перекрывания, необходимые для сборки фрагментов первого набора в правильном порядке. В результате может быть установлена нуклеотидная последовательность интересующей нас природной ДНК. Иногда, для того чтобы устранить неясности в некоторых участках последовательности, оставшиеся после первых двух расщеплений, приходится анализировать третий или четвертый наборы фрагментов. [46]
Более удобными для генетических исследований и широкомасштабного секвенирования часто оказываются контиги из небольших фрагментов ДНК, чем из крупных. Для построения контигОв определенных районов хромосом или целых хромосом нередко используют космид-ные библиотеки. Обычно перекрывающиеся кос-мидные клоны идентифицируют методом геномной дактилоскопии. Для этого из каждого клона экстрагируют ДНК и обрабатывают ее рестриктазой. Полученные фрагменты метят, разделяют при помощи электрофореза и визуализируют радиоавтографическими методами. Каждый клон порождает специфический набор фрагментов - уникальный отпечаток его ДНК; у перекрывающихся клонов один или несколько фрагментов совпадают. [47]
Разработан диалоговый режим работы системы РАСТР. Обмен информацией между человеком и ЭВМ осуществляется через алфавитно-цифровой дисплей. Программа производит опрос работающего, одновременно указывая форму ответа. Требуется информация о видах экспериментальных спектров, имеющихся в наличии, о их признаках и спектральных параметрах. После ввода всей спектральной информации и брутто-формулы вещества оператор указывает режим построения импликаций - логических соотношений между признаками спектра и структурой соединения. Оператор имеет возможность вносить и них любые изменения: исключать или добавлять сведения к библиотечным фрагментам, убирать какие-либо импликации или добавлять новые. В результате решения системы согласованных логических уравнений на дисплей выдаются наборы фрагментов, удовлетворяющие спектрам и химической информации. [48]