Пуриновая нуклеозида
Cтраница 1
Пуриновые нуклеозиды не затрагиваются, но уридин быстро и в мягких условиях ( рН 10) распадается до 5-изооксазолона и рибозилмочевины; при дальнейшем действии гидроксиламина из рибозилмочевины образуются мочевина и оксим рибо-зы. Таким образом, оказывается возможным довольно специфическое изменение или удаление оснований без особого вреда для целостности цепи РНК. [1]
Пуриновые нуклеозиды типа инозина X, полученного из гуанозина IX действием азотистой кислоты, при действии йодистого метила подвергаются метилированию по обоим азотам шестичленного цикла, что исключает связь с ними гликозидного углерода. [2]
О пуриновых нуклеозидах см. далее в разд. [3]
В настоящее время трудно оценить влияние природы остатка сахара на легкость раскрытия имидазольного цикла в различных пуриновых нуклеозидах. [4]
Простые эфиры, конфигурация 182 Протеазы 626 Прочность связи 247 Псевдотрошш ( г ] тропин) 150, 382 Пуриновые нуклеозиды 180 ел. [5]
В более ранней работе 273 утверждалось, напротив, что в реакцию с триэтиленмеламином вступают только пиримидиновые, но не пуриновые нуклеозиды. [6]
В литературе имеются также данные, которые можно рассматривать как косвенные указания на возможность внутримолекулярного образования водородных связей и в пуриновых нуклеозидах с участием N-3 гетероциклического ядра и гидроксила при С-2 рибозы. К их числу относятся некоторые различия в УФ-спектрах51 и спектрах ЯМР 3853 пуриновых рибо - и 2 -дезоксйрибонуклео-зидов. [7]
В условиях, указанных в табл. 10.8, гидролиз обладает некоторой специфичностью59, поскольку фосфодиэфирные связи между пиримидиновыми нуклеозидами расщепляются быстрее, чем между пуриновыми нуклеозидами ( см. стр. [8]
Приведенные в табл. 6 - 1 результаты позволяют предположить, что специфичность обусловлена присутствием и расположением функциональных групп, обнаруженных лишь в пиримидиновых производных, в соответствии с постулатом [125], согласно которому образование водородной связи между карбонильным кислородом при атоме Q пиримидинового кольца и 2 -гидроксильной группой сахара усиливает нуклеофильный характер этой гидроксильной группы ( и может вполне объяснить любые различия в конформации сахара в пуриновых нуклеозидах по сравнению с пиримидиновыми нуклео-зидами), облегчая таким образом нуклеофильную атаку атома фосфора и образование нуклеозид-2 3 -циклофосфата. Некоторым подтверждением этой концепции может служить большая устойчивость к химическому гидролизу пуриновых полинуклеотидов по сравнению с пиримидиновыми полинуклеотидами. [9]
Расчеты показали, что в пиримидиновых нуклеозидах пространственные затруднения при вращении вокруг гликозидных связей возникают в основном из-за взаимодействия боковых групп при углеродных атомах углеводного остатка со связями С2О и СА-Н основания. Вращение в пуриновых нуклеозидах ограничено возникновением укороченных контактов с атомом Ng шести-членного кольца. Однако при использовании уменьшенных ван-дер-ваальсовых радиусов cpCN может принимать любые значения, лежащие в пределах между сын - и ант-конформациями. [10]
По мере повышения рН скорость этой реакции падает. Согласно этому критерию пуриновые нуклеозиды, а также тимидин и псевдоури-дин 107 при действии гидроксил-амина в широком интервале значений рН ( 6 - 12) не разрушаются или разрушаются очень медленно. [12]
Так, атом N3 пуринового кольца, аминогруппа у С2 пиримидинового кольца и аминогруппа у С5 имидазольного кольца - все они могут располагаться близко к атому кислорода кольца сахара, облегчая, таким образом, перенос протона. В соответствии с этой концепцией пуриновые нуклеозиды и 5-амино - 1 - 3 - D-рибофуранозилимидазолы легко гидр о лизуются, а изоцитидин гидролизуется значительно быстрее, чем цитидин. Устойчивость природных пиримидиновых нуклеозидов может быть обусловлена малой способностью карбонильного атома кислорода у С2 к прото-низации. Незначительные различия в устойчивости гликозидной связи в родственных пуриновых нуклеозидах являются, вероятно, результатом различного расположения зарядов и наличия тауто-мерных форм протонизированных оснований. [13]
Ультрафиолетовые спектры поглощения ксантозина отличны от спектров 7-метилксантина ( а также от спектров 1 - или 3-метил-ксантина) и они довольно близки к спектрам 9-метилзамещенных ксантина. Эти результаты ясно показывают, что пуриновые нуклеозиды представляют собой 9-рибозилпурины; это справедливо также для дезокси-аденозина и дезоксигуанозина, так как ультрафиолетовые спектры этих веществ почти идентичны со спектрами аденозина и гуанозина. При периодатном окислении этого нуклеозида образуется диальде-гид, идентичный диальдегиду, полученному из аденозина. [14]
Очевидно, что многие нуклеозиды являются интермедиатами в биосинтезе н расщеплении нуклеотидов и полинуклеотидов. В дополнение к так называемым спонгонуклеозидам ( термин, применяемый к модифицированным пуриновым нуклеозидам, полученным из карибской губки Cryptotethya crypta), которые являются производными арабинозы, многие антибиотики являются производными нуклеозидов, часто имеющих модифицированные углеводные остатки; они будут детально обсуждаться позднее. Все коммерчески доступные образцы основных нуклеозидов получены этим путем. Для выделения больших количеств таких нуклеозидов наиболее целесообразно применение относительно грубого фракционирования, основанного на различной растворимости, и методов ионного обмена. Для выделения малых количеств модифицированных нуклеозидов либо из природного источника, либо полученных в результате химического синтеза, пригодны многочисленные более эффективные методы, и они будут обсуждаться отдельно. Наконец, следует помнить, что выделение нуклеозидов часто осуществляют дефосфорилированием нуклеотидов [25], выделение и разделение которых не будет рассматриваться в настоящей главе. [15]
Страницы: 1 2