Образование - двойная спираль
Cтраница 3
В свете этих данных образование трехмерной сетки из линейных молекул каррагинана, обусловливающей геле-образование, трактуется следующим образом. В сильно разбавленном растворе ( или при достаточно высокой температуре), когда межмолекулярные взаимодействия малы, форма цепей аппроксимируется конформацией беспорядочного клубка. В более концентрированных растворах ( или при охлаждении) начинается образование двойных спиралей, связывающих участки разных молекул. Некоторая произвольно выбранная ( и достаточно длинная) молекула может при этом образовывать несколько таких участков связывания и не с одной, а с несколькими молекулами. [31]
 |
Образование спирального комплекса из иолирибоцитидиловой ки. [32] |
Важный вопрос, который необходимо было решить с помощью модельных полимеров, это определение структурной возможности образования двойных спиралей Крика-Уотсона из одной нити полирибонуклеотида и второй нити полидезоксирибонуклеотида. Ответ отнюдь не очевиден, так как атом кислорода в рибозе требует около 3 А лишнего места и трудно понять, возможна ли комбинированная спираль по чисто стерическим соображениям. С другой стороны, если РНК в клетке реплицируется с ДНК ядра, то образование двойных спиралей Крика-Уотсона должно происходить. [33]
Важную группу полисахаридов составляют гликозаминогли-каны, к которым относятся гиалуроновая кислота, хондроитин-сульфаты и кератансульфат. Эти конформации представляют собой группу левых спиралей, упакованных антипараллельно и отличающихся в основном степенью растянутости. Наиболее сжатой является одна из конформаций гиалуроновой кислоты, в которой одна молекула закручена вокруг другой с образованием двойной спирали [13]; во всех остальных случаях молекулы упакованы бок о бок. Ко времени опубликования работы [ 16 определение строения ( Рс-фрагмента иммуноглобулина G) не было доведено до конца, однако уже можно было сделать ряд важных выводов, которые будут рассмотрены ниже. [34]
Следовательно, в двойной или тройной спиралях можно не принимать во внимание петли. В данных экспериментальных условиях полиуридиловая кислота, по крайней мере частично, образует двойную спираль. Следовательно, предложенное выше решение, подтвержденное в случае образования двойной спирали, верно также и в случае образования тройной спирали при кооперативной адсорбции на линейной цепи. [35]
Именно нуклеиновые кислоты, а не белки, способны выполнять эту роль [4-6], поскольку однонитевые нуклеиновые кислоты могут использовать спаривание оснований для выстраивания комплементарной последовательности нуклео-тидов. При объединении выстроенных нуклеотидов две нити могут образовывать энергетически выгодную двойную спираль Уотсона - Крика. В следующем цикле, после развертывания двойной спирали, комплементарная нить может репродуцировать исходную. Оба фактора, точный отбор последовательности путем спаривания оснований и энергетически выгодное образование двойной спирали, безусловно, способствовали автокаталитическому воспроизведению. Напротив, исходить из белка вместо нуклеиновой кислоты было бы значительно сложнее с точки зрения единой организационной схемы, поскольку взаимного опознавания аминокислот не существует. [36]
Дебаевский радиус экранирования изменяется обратно пропорционально корню квадратному из ионной силы рас. Увеличение радиуса экранирования вызывает увеличение объема статистического клубка полинуклеотида ( или / г2) по двум причинам. Во-лервых, если радиус станет настолько большим, что соседние фосфатные группы вдоль цепи смогут взаимодействовать, то этот фрагмент становится жестким. Во-вторых, диаметр цепи при этом увеличивается, значительно увеличивая эффект исключенного объема. Вне области рН от 5 до 9 при ионизации нуклеотидных оснований заряды вызывают ослабление сил, действующих между основаниями, и препятствуют образованию двойной спирали. [37]
Одноцепочечная кольцевая ДНК - тип структурной организации ДНК. Одно-цепочечную структуру таких ДНК подтверждают следующие наблюдения. Нагревание растворов этих ДНК не сопровождается переходом спираль-клубок. В отличие от двухцепочечной ДНК эта ДНК реагирует с формальдегидом, поскольку аминогруппы ее оснований оказываются свободными. Молярные соотношения оснований в ней не соответствуют известным правилам Чаргаффа для двухцепочечной ДНК-в частности, не выполняется молярная эквивалентность А и Т и Г и Ц, лежащая в основе образования двойной спирали. ДНК замкнута в кольцо, подтверждается тем, что она практически не чувствительна к экзонуклеазам, а поэтому не содержит З - гидроксильного конца. [38]
Хотя спираль нативной молекулы ДНК имеет более 103 внт-ков, расчет показывает, что раскручивание спирали происходит всего лишь за несколько секунд. В опытах с ренатурацией ДНК охлаждение раствора длится час и более, и, следовательно, процесс ренатурации можно считать равновесным во всей области изменения температуры. Для восстановления двойных спиралей при медленном охлаждении требуется, чтобы вновь соединились цепи, комплементарные друг другу. В растворе гетерогенной ДНК могут также встретиться и соединиться друг с другом и некомплементарные цепи, но из-за несоответствия их нуклеотидного состава константа равновесия для таких агрегатов будет значительно меньше, чем для двойной спирали, образованной комплементарными цепями. Поэтому преимущественно должно происходить специфическое образование двойных спиралей из комплементарных цепей. Это подтверждают и эксперименты по трансформации. Оптимальная температура для восстановления трансформирующей активности примерно на 25 ниже температуры перехода нативной ДНК бактерий. [39]
Роль водородных связей аденин - тимин и гуанин - цитозин в образовании двойной спирали. [40]
Страницы: 1 2 3