Циклическая пептида

Cтраница 3

Молекула актиномицина D ( актиномицина С1) содержит плоский феноксазоновый хромофор, несущий две карбоксильные группы. Обе эти группы соединены с одинаковыми циклическими пептидами, состоящими из остатков L-треонина, D-валина, L-пролина, саркозина ( N-метилглици на) и L-ме-тилвалина. [31]

По размеру молекулы и своим свойствам пептиды стоят между высокомолекулярными белками и аминокислотами. Наиболее распространены линейные пептиды, однако известны также циклические пептиды, молекулы которых могут иметь различные размеры. Циклические пептиды образуются из линейных, когда пептидная связь связывает амино - и карбоксильную функцию N - и С-концевых аминокислот. [32]

Большое значение, которое имеют защитные группировки в синтезе пептидов, является основной причиной того, что им наряду с методами создания пептидной связи уделяется наибольшее внимание в настоящей монографии. Завершают первый том главы V-X, в которых рассматриваются циклические пептиды, депсипептиды, пептои-ды и проблемы рацемизации. [33]

Особого внимания заслуживает вращение вокруг связи С - N или, точнее говоря, энергия, связанная с потерей пептидной группой Са - С - N - Са плоского строения. Как показывает цикл работ, проведенных недавно группой Рамачандрана [42 - 44], деформации не только возможны, но неизбежны в малых циклических пептидах - без них не может произойти замыкание циклов. [34]

Особого внимания заслуживает вращение вокруг связи С / - N ( co) или, точнее говоря, энергия, связанная с потерей плоскостности пептидной группы С - С - N - Са. Как показывает цикл работ, проведенных недавно группой Рамачанд-рана [74 - 76], ю-деформации не только возможны, но и неизбежны в малых циклических пептидах - без них не можег произоити замыкание циклов. [35]

Сочетание продуктов превращения аминокислот с продуктами метаболизма уксусной и мевалоновой кислот приводит к еще большему увеличению числа возможных для алкалоидов структур. Интересно, что в биосинтезе растительных алкалоидов, в отличие от биосинтеза микробных алкалоидов, в качестве промежуточных соединений не используются простые циклические пептиды. [36]

Основной принцип пептидного синтеза. [37]

Вторая аминокислота Б ( аминокомпонент) атакует активированный карбоксильный компонент аминогруппой с образованием пептидной связи. Незащищенная ами-нофункция карбоксильного компонента А тоже может реагировать, что приводит ( рис. 2 - 4) к нежелательным побочным продуктам - линейным и циклическим пептидам. Из этого следует вывод, что для однозначного течения пептидного синтеза следует временно блокировать все функциональные группы, не участвующие в образовании пептидной связи. [38]

По механизму действия продуцируемые сно-рообразующими бактериями антибиотики разделяются на три группы. Группа эдеинов, представляющих собой пептиды с сильно основными свойствами, специфически подавляет синтез ДИК. Группа бацитрацинов и родственных им антибиотиков представляет собой циклические пептиды, которые угнетают синтез оболочки клеток. В обширную группу бациллярных антибиотиков включают грамицидины, поли-миксины и родственные им соединения, которые специфически блокируют синтез структурных компонентов или функцию клеточной мембраны. [40]

Насколько известно автору, не выделено циклических гомодет-ных трипептидов и лишь немногие природные тетрапептиды полностью охарактеризованы. Восстановление дидегидрофенилаланинового остатка приводит к стерео-специфичному образованию D-изомера УУ-метилфенилаланина, и оба остатка УУ-метиламинокислот принимают в кристаллической решетке дигидротентоксина конформацию, соответствующую цис-тп-тидным связям. Имеются также дополнительные данные как кристаллографические, так и результаты исследования растворов, что пролин и yV - метиламинокислоты в циклических пептидах часто принимают цис-расположение амидных связей, и на этом основании строится взаимосвязь структуры и функции микробных пептидов. Преимущество ц с-расположения амидных связей, особенно в коротких пептидах, состоит в значительном уменьшении напряжения кольца, достигаемого при этом. Такая структура - первая среди всех известных природных или синтетических циклотетрапептидов, причем каждая из пептидных единиц существенно отличается от плоскорасположенной. Другой интересной особенностью этой молекулы является наличие в ней остатков ранее не найденных L-a - аминодекановой кислоты и a - метилаланина, редко встречающихся в небольших пептидах. [41]

Его действие включает образование высокоустойчивых комплексов с ДНК, что препятствует этой кислоте проявлять свое биологическое действие. По этой схеме феноксазоновый хромофор внедряется между соседними парами оснований G-C ДНК, где остатки гуанина принадлежат различным цепям ДНК, и две аминогруппы остатков гуанина образуют специфические водородные связи с обоими циклическими пептидами, находящимися в узком желобе спирали. Эта модель согласуется с известными данными и представляет собой важное достижение в молекулярной биологии. [42]

Пиохеллин - сидерофор из бактерии синегнойная палочка ( Pseudomonas aeruginosd) - имеет структуру 6.684. Здесь одно из гетероциклических колец восстановлено до тиазолинового, другое - до тиазолидинового. Известно немалое число природных молекул, в состав которых входят три и четыре тиазольных кольца. Часто к ним добавляются оксазольные гетероциклы. К одному относятся соединения, в которых гетероциклические фрагменты связаны друг с другом углерод-углеродной связью. Другой тип представлен циклическими пептидами, сконструированными из уже упомянутых аминокислот общей формулы 6.677. Оба типа являются продуктами метаболизма морских беспозвоночных, синезеленых водорослей и бактерий. Они обладают сильной и разносторонней биологической активностью. Так, миксобактерии рода Polyan-gium синтезируют антигельминтные тенгазолы 6.685, содержащие четыре тиазоловых и одно оксазоловое кольцо. [43]

Страницы: 1 2 3