Cтраница 2
Вращение углеродных атомов вокруг сг-связи не является вполне свободным и сопровождается изменением свободной энергии молекулы. Геометрические формы, которые принимает молекула при изменении положения в пространстве составляющих ее атомов, происходящем без разрыва ковалентных связей, называются конформациями, а раздел стереохимии, изучающий зависимость реакционной способности от кон-формации - конформационным анализом. В принципе возможно бесконечное множество конформаций, но обычно рассматривают конформации, соответствующие экстремальным значениям свободной энергии. Остальные конформации являются промежуточными между этими экстремальными конформациями. В популяции молекул данного вещества преобладают молекулы, имеющие наиболее стабильные конформации, отвечающие минимуму свободной энергии. Молекула вступает в реакции не обязательно в своей наиболее стабильной конформации, но знание послед - ней весьма существенно, поскольку позволяет оценить энергию, необхо - димую для достижения переходного состояния. [16]
Использование клеточной ДНК для определения последовательности оснований осложняется, помимо двуспиральной природы нитей, еще двумя серьезными проблемами. Обе проблемы связаны с большим размером хромосомной ДНК. Это значит, что каждая цепь в двойной спирали ДНК содержит 20О ООО оснований. Сохранить целостность отдельного линейного полинуклеотида с таким числом оснований - задача чрезвычайно трудная. Даже термическая деградация может вызвать такое число случайных разрывов цепи, что популяция молекул хромосомной ДНК будет слишком гетерогенной для анализа последовательности. [17]
По форме кривых рассеяния в принципе можно определить, имеет ли РНК в растворе форму сферы, стержня или беспорядочного клубка. К сожалению, компактная конфор-мация РНК при той концентрации противоионов, которая обычно используется при измерении светорассеяния ( 0 01 М или выше), не позволяет идентифицировать ее форму этим методом. Однако некоторую информацию о форме молекул можно получить, если измерить радиус инерции ( Rg) как функцию молекулярного веса ( М) и затем определить, какое из соотношений - M / R3g ( сфера), M / Rg ( стержень) или M / R2g ( беспорядочный клубок) - является постоянным. При определении постоянства любого из этих соотношений необходимо иметь достаточно нолидисперсную систему, которую можно получить за счет беспорядочных разрывов связей в популяции молекул, характеризовавшейся первоначально узким распределением по размерам. [18]
В этом случае молекулы Asp заряжены в целом отрицательно; они практически не будут задерживаться на максимально отрицательно заряженном обменнике и выйдут в свободном объеме колонки. Положительный заряд Lys в среднем равен - - J-1 и в несколько раз выше, чем у Gly. Это означает, что действительно положительно заряженные молекулы будут явно преобладать в популяции молекул Lys. В популяции молекул Gly при рН 3 5 подавляющее число молекул электрически нейтрально - они будут слабо задерживаться катиони-том, поскольку положительный и отрицательный заряды цвиттерио-на глицина расположены близко друг к другу. Небольшая часть молекул Gly, обусловливающая все же заметный средний заряд для всей популяции, несет единичный положительный заряд и должна задерживаться на катионите. Но если число таких заряженных молекул невелико, то в силу динамического равновесия ионизации и эквивалентности всех молекул популяции каждая из них пребывает в заряженном состоянии лишь непродолжительное время. [19]
В результате ассоциации количество каналов в локальном участке мембраны, стимуляция которого предшествует спайковому разряду, возрастает. Время пребывания рецептивного белка в активированном состоянии ограничено. Спустя некоторое время этот белок возвращается в исходное состояние и спайковый разряд, служащий подкреплением, уже неспособен присоединить канал к рецептору. Время пребывания белка в активированном состоянии определяет интервал между условным и безусловным раздражителем, обеспечивающим ассоциацию. Схематически это выглядит следующим образом. Медиатор, наносимый или естественно поступающий на мембрану, действует на два типа белковых рецепторов. Одни рецепторы уже связаны с каналами натриевой проводимости и при взаимодействии с медиатором создают ВПСП. Одновременно медиатор действует на другую популяцию молекул рецептивного белка, которые с натриевыми каналами не связаны. [20]
Считают, что смысловые последовательности для кодирования составляют лишь небольшую долю ДНК, это так называемая фибриллярная ДНК - Глобулярная ДНК, которой приписывают регуляторную функцию, пребывает в комплексе с хромосомными белками гисто-новой и пег исто но во и природы. Глобулярная ДНК может быть закручена сама на себя с образованием двойной двухцепочечяой спирали наподобие скрученной шпильки. В результате раскручивающего усилия в петле шпильки находится неспаренная одно-цепочечная ДНК - В такой структуре довольно длинные участки ДНК могут содержать ничего не значащую последовательность нуклеотидов. Эти участки чередуются с более короткими со специфической последовательностью нуклеотидов. Для такого чередования, видимо, характерны определенные, регулярно повторяющиеся интервалы. Например, денатурированная линейная двухцепочечная ДНК бактериофага Т2 при медленном отжиге образует кольцевые молекулы, что происходит вследствие того, что популяция молекул фаговой ДНК состоит из набора молекул с циклическими перестановками. [21]