Присоединение - аминокислота
Cтраница 1
Присоединение аминокислоты к 3 -концу тРНК, катализируемое амино-ацил - тРНК - синтетазой, сопряжено с расщеплением АТФ. [1]
Сама по себе реакция присоединения аминокислот к РРНК обратима. [2]
Ограничения метода: 1) неполное присоединение С-конце-вой аминокислоты к бензильным группам полимера может приводить к образованию примесей, например при синтезе пента-пептида А1 - А2 - А3 - А4 - А5 может быть образована цепь А2 - А3 - А4 - А5 при реакции второй аминокислоты с оставшейся в первой стадии бензильной группой. Эта реакция конкурирует со стадией Б; 2) неполное присоединение N-защищенной аминокислоты к свободной аминогруппе ( стадия Б) может привести к образованию сокращенных пептидов ( например, А1 - А2 - А3) и неправильной последовательности ( например, А1 - А2 - А4 - А5); 3) отсутствие аналитических методов определения примесей, которые могут применяться без отделения пептида от полимера. Такое определение может быть очень расточительным, требовать много времени и само по себе приводит к распаду продукта. [3]
Эта последовательность играет существенную роль при присоединении аминокислоты. [4]
Реакция с N-карбоксиангидридами аминокислот широко применяется для присоединения соответствующих аминокислот к белкам. [5]
На первой стадии превращений аминокислот ( катализируемых пири-доксалем или родственными ему соединениями) как в химических, так и ферментативных системах происходит присоединение аминокислоты к карбонильной группе катализатора с образованием основания Шиффа, которое можно обнаружить по характерной для него желтой окраске, соответствующей второму из двух максимумов поглощения вблизи 330 и 410 нм. Обычно полагают, что строение этого промежуточного соединения соответствует структуре LVI, и в таком виде ее до сих пор часто приводят. Реакция аминов с З - оксипиридин-4 - альдегидом приводит к продуктам, которые также имеют желтую окраску, и их спектр поглощения похож на спектры соединений пиридоксаля с аминокислотами. [6]
Окиси можно брать только такие, которые при нагревании в водном растворе в течение 3 - 4 часов гидратируются водой в минимальной степени, что обеспечивает протекание основной реакции присоединения аминокислоты. Метод бариевых солей аминокислот имеет преимущества перед реакцией получения оксиалкиламинокислот из эфнров аминокислот и а-окисей. Он более прост в препаративном отношении. Исключается стадия приготовления эфиров аминокислот. [7]
Он открыл ключ генетического кода путем расшифровки триплетов оснований, из которых состоят нуклеотидные цепи ДНК и РНК. Каждая комбинация кодирует присоединение определенной аминокислоты к цепочке белка. Ниренберг расшифровывал неизвестные комбинации, синтезируя ДНК со встроенной известной последовательностью нук-леотидов и определяя, какая аминокислота в белке изменилась. В 1968 году он был удостоен Нобелевской премии по физиологии и медицине вместе с Робертом У, Холли и Харом Кораной. [8]
В настоящее время допускают возможность присутствия ковалентных связей между липидной и белковой компонентами в липопротеинах. Были высказаны предположения о присоединении аминокислот и пептидов к глицерофосфолипидам посредством фосфамидной и ацилфос-фатной связей. [9]
Кривые титрования показали, что в реакцию с ангидридом вступила примерно треть аминогрупп и что в основном глицин присоединяется в виде полипептида. Это, повидимому, является первым случаем присоединения незамещенных аминокислот или пептидов к нативным белкам с образованием пептидных связей в таких мягких условиях, при которых белок не денатурируется. [10]
Синтез М - конце-вого пентапептида ( Н 1 - 5) [2386] был осуществлен, исходя из дипептида Form-L-Leu-D-Dab ( Cbo) - OMe ( A 1 - 2) путем ступенчатого присоединения аминокислотных остатков с помощью азидного метода. В противоположность обычно применяемому в пептидном синтезе способу присоединения аминокислот с С-конца в данном случае ступенчатое наращивание пептидной цепи осуществляли, начиная с N-концевого остатка. Все промежуточные пептиды, полученные с помощью карбодиимидного метода, в отношении чистоты и выхода уступали соответствующим пептидам, синтезированным азидным методом. Пептиды со свободными карбоксильными группами были получены как щелочным гидролизом соответствующих эфиров, так и непосредственно с помощью ангидридного метода путем конденсации с солями соответствующих низших свободных пептидов. [11]
Ограничения метода: 1) неполное присоединение С-конце-вой аминокислоты к бензильным группам полимера может приводить к образованию примесей, например при синтезе пента-пептида А1 - А2 - А3 - А4 - А5 может быть образована цепь А2 - А3 - А4 - А5 при реакции второй аминокислоты с оставшейся в первой стадии бензильной группой. Эта реакция конкурирует со стадией Б; 2) неполное присоединение N-защищенной аминокислоты к свободной аминогруппе ( стадия Б) может привести к образованию сокращенных пептидов ( например, А1 - А2 - А3) и неправильной последовательности ( например, А1 - А2 - А4 - А5); 3) отсутствие аналитических методов определения примесей, которые могут применяться без отделения пептида от полимера. Такое определение может быть очень расточительным, требовать много времени и само по себе приводит к распаду продукта. [12]
Экспериментальные наблюдения с использованием меченых атомов указывают на прямое участие РНК-переносчика в синтезе белка. Так, например, неоднократно отмечалась взаимосвязь между скоростью присоединения аминокислот к Р - РНК и скоростью белкового синтеза. Далее было отмечено накопление комплексов Р - РНК с аминокислотами в случае прекращения белкового синтеза, наоборот, при снятии факторов, тормозящих синтез, происходило перемещение меченых аминокислот с Р - РНК на белок. [13]
Такова в общих чертах схема синтеза белка in vivo; рые детали, например роль белковых факторов элонгации, опущены. Очевидно, что синтез белка - очень сложный процесс; его основу составляет активация карбоксильной группы с после-упорядоченным присоединением аминокислот на направ - ( организующей) матрице, которая делает практически образование неправильной последовательности или побочные реакции. [15]
Страницы: 1 2