Расщепление - фосфодиэфирная связь
Cтраница 1
Расщепление фосфодиэфирных связей, особенно в ряду поли-рибонуклеотидов, может происходить под действием разнообразных реагентов в широком интервале значений рН ( в том числе и близких к нейтральному) и при различных температурах. Поэтому знание границ устойчивости фосфодиэфирных связей при работе с биологически активными нуклеиновыми кислотами и полинукле-отидами особенно важно. [1]
 |
Гидролиз рибонуклеозид-3, 5 -циклофосфатов в 0 2 н. растворе Ва ( ОН2 ( 100 С, 30 мин 40. [2] |
Механизм расщепления фосфодиэфирных связей в нуклеозид-3 5 -циклофосфатах под действием кислот и оснований, вероятно, аналогичен механизму расщепления этих связей в нуклеозид-2 3 -циклофосфатах под действием тех же агентов ( см. стр. Он может включать атаку нуклеофильным реагентом атома фосфора и разрыв связи Р - О; расщепление связи Р - О при С-5 происходит с большей скоростью, чем связи Р - О при С-3 40, возможно, ввиду их стереохимической неэквивалентности. [3]
Более общим методом расщепления фосфодиэфирных связей в ДНК является щелочной гидролиз молекул полинуклеотида, из которых тем или иным способом удалены какие-либо основания. [4]
Эти данные позволили сделать вывод, что расщепление фосфодиэфирных связей при кислотной деградации ДНК происходит по негликозилированным дезоксирибозильным остаткам, образующимся в результате отщепления пуриновых оснований ( см. гл. При этом фосфодиэфирные связи у негли-козилированного дизоксирибозильного звена расщепляются как по 3 -, так и по Б - положениям. Было также показано122, что 3 - и 5 -монобензиловые эфиры пуриновых дезоксинуклеотидов в условиях кислотного гидролиза отщепляют пурин и бензилфосфат, в то время как соответствующие пиримидиновые производные в этих условиях относительно устойчивы. [5]
НУКЛЕАЗЫ, ферменты класса гидролаз, катализирующие реакции расщепления фосфодиэфирных связей в полинуклео-тидной цепи нуклеиновых к-т с образованием моно - и олигонуклеотидов. Концевые мононуклеотиды отщепляются экзо-нуклеазами, расщепление внутри поли-нуклеотидной цепи осуществляется эндо-нуклеазами. [6]
NaOH при 37 С в течение 26 ч приводит к расщеплению фосфодиэфирных связей у дезоксирибозилацетальных звеньев по механизму с участием ОН-группы при С-4, аналогичному механизму щелочного расщепления РНК ( см. стр. [7]
Фосфолипаза С ( фосфатидилхолин - холинфосфогидролаза, 3.1.4.3) - фермент, катализирующий расщепление фосфодиэфирной связи с образованием диацил-глицерина и фосфорного эфира азотистого основания. Ее выделяют из различных бактериальных источников, причем ферменты из разных объектов проявляют различную специфичность по отношению к субстрату. Так, фосфолипаза С из бактерий использует в качестве субстрата различные молекулярные типы фосфолипидов-глицеридов. [8]
Если же щелочной деградации подвергалось ациклическое N-гликозидное производное 5 -фосфодезоксирибозилил - ( 3 - 5) - ти-мидина, то расщепление фосфодиэфирной связи должно было действительно идти по механизму циклизации гидроксильной группы при С-4 ( см. стр. [9]
Рибонуклеозид-3 5 - и дез-оксирибонуклеозид-3 5 -циклофосфаты ( об их синтезе см. 38 - 40) под действием кислот и оснований претерпевают расщепление фосфодиэфирной связи, которое во многих случаях, в зависимости от условий реакции и природы основания и углеводного остатка, сопровождается гидролизом N-гликозидной связи ( стр. [10]
Однако при действии диазометана на ряд динуклеозидмонофосфатов ( например, UpU, ApU) в водных растворах при рН 8 происходит расщепление фосфодиэфирной связи, возрастающее пропорционально времени реакции и избытку диазометана. Среди продуктов реакции были обнаружены209 нуклеозид-2 3 -циклофосфаты и метиловые эфиры нуклеозид-2 ( 3) - фосфатов, возникающие, вероятно, при распаде метиловых эфиров динуклеозидмонофосфатов. [11]
Соли и гидроокиси многих тяжелых металлов, среди которых есть представители всех групп периодической системы элементов ( табл. 10.10), катализируют расщепление фосфодиэфирных связей в РНК, причем некоторые из них катализируют также и гидролиз фосфомоноэфирных связей ( см. стр. [12]
 |
Гидролиз 5 - О-ацил - 2 3 - О-изопропилиденуридинов IV в водном растворе при 20 С30. [13] |
Как уже отмечалось выше, первичным продуктом ацетилирования нуклеотидов является смешанный ангидрид нуклеотида и уксусной кислоты, внутримолекулярный алко-голиз которого может приводить в случае олигорибонуклеотидов к изомеризации или расщеплению фосфодиэфирной связи. Хотя нуклеофильность фосфодиэфиров значительно ниже, чем у моно-эфиров, опасность таких побочных процессов при ацилировании олигорибонуклеотидов вполне реальна. Вместе с тем при проведении реакции в присутствии триэтиламина или тетраэтиламмонийацетата количественное ацетилирование гидроксильных групп не сопровождается сколько-нибудь заметной изомеризацией или деградацией фосфодиэфирной связи. [14]
Хотя в настоящее время применяются достаточно мягкие условия получения апуриновых кислот ( такие, как гидролиз [392] при 37 и рН 1 6 или обработка [393] ионообменными смолами), все же при этом имеет место также расщепление фосфодиэфирных связей, продукты получаются с гораздо меньшей длиной цепи и имеют молекулярный вес [394, 395] от 3500 до 15000 по сравнению с молекулярным весом в несколько миллионов, характерным для исходных полимеров. Как и при гидролизе в нейтральных растворах, главной причиной расщепления цепи является легкое отщепление фосфата из негликозидных звеньев дезоксирибозы. [15]
Страницы: 1 2