Сверхспираль

Cтраница 1

Сверхспирали с т 0 образуются в искусственных условиях при расплетании двойной спирали в ковалентно-замкнутых ДНК ( из природных источников) под действием внешних факторов ( см., например, стр. [1]

Количество сверхспиралей изменяется при щелочном титровании ДНК или при интеркалировании в нее водорастворимых ароматических красителей. Это изменение можно легко обнаружить по изменению скорости седиментации [37] кольцевой ДНК или непосредственно при электронной микроскопии. Прекрасный образец последней ( рис. 22.1.4) показывает изменения между препаратом кольцевой ДНК из раствора с низким содержанием соли со 128 перекрестами и препаратом той же ДНК, полученной из раствора с высоким содержанием соли, содержащей только 22 перекреста. [2]

Модель сверхспирали пригодна как для параллельных, так и для антипараллельных ас-спиралей. Все приведенные выше соображения отвечают параллельным и антипараллельным а-спиралям. Однако способу упаковки, приведенному на рис. 5.11 6, удовлетворяет только параллельное расположение; поскольку связь С - Ср а-спирального остатка не перпендикулярна оси а-спирали, а ориентирована под углом около 45 в направлении, обратном ходу спирали, то боковые цепи имеют ту же ориентацию. Для устранения стерических отталкиваний между боковыми цепями требуется относительный сдвиг спиралей вдоль контактной линии примерно на 1 А. Если, например, инвертировать показанную на рис. 5.11, в спираль с остатками abode, отталкивания между боковыми цепями остатков аи d устраняются при перемещении спирали на 1 А вниз. [3]

Устройство сверхспирали хроматина зависит от природы и, в частности, от конформаций гистонов и негистоновых белков. [4]

Схема цепочки нуклеосом, образующих хроматиду. а - шаг спирали 50 нм, б - радиус спирали 13 им, в - нуклеосомы, г - ДНК. [5]

К сворачиванию ДНК в сверхспираль приводит, по-видимому, именно нейтрализация отрицательных зарядов фосфатных групп положительными зарядами гистонов. Наличие 8 или 9 различных гистонов в нуклеосомах обеспечивает возможность большого их структурного многообразия. [6]

Схема образования сверхспиральных структур в циклической Коиалентно-замкнутой ДНК при а р ( текст. [7]

При этом число витков т сверхспиралей ( обоих типов) равно числу вновь образовавшихся витков двойной спирали. [8]

При р а образуется левовинтовая тороидальная или правовин-товая самозакручивающаяся сверхспираль. [9]

Гипотеза эта возникла потому, что было прямо доказано: для того чтобы начать удваиваться, молекуле ДНК обязательно надо закрутиться в сверхспираль, но для самого процесса репликации сверхспираль вовсе не нужна. Более того, иногда перед репликацией одна из нитей кольцевой замкнутой ДНК рвется, причем этот разрыв делает специальный белок и только в том случае, если ДНК сверх-спирализована. Получается какая-то бессмыслица - клетка затрачивает усилия, чтобы превратить ДНК в сверхспираль с помощью одного белка ( ДНК-гиразы) для того, чтоиы другой белок эту сверхспирализацию немедленно ликвидировал. [10]

Электронные микрофотографии плазмид, выделенных из двух видов бактерий. А. Плазмида pSClOl из Е. coli, которая придает клеткам устойчивость к тетрациклину. Б. Плаз-миды из Neisseria gonorrhoeae - бактерии, вызывающей гонорею. Большинство молекул находится в релаксированном состоянии. На примере скрученных сверхспиральных плазмид ( одна из них в центре фотографии видно, насколько эффективной может оказаться компактная уда-ковка кольцевой ДНК в результате отрицательных поворотов. [12]

Линейные ДНК не образуют сверхспираль до тех пор, пока оба конца молекулы не зафиксированы. Сверхспираль-ность играет важную роль во многих процессах, происходящих с участием ДНК. Некоторые белки и ферменты не связываются с ДНК, если она находится не в сверхспиральной форме. Ферменты, называемые топоизомеразами, могут регулировать степень сверхспиральности, увеличивая или уменьшая число сверхвитков. [13]

Последнее утверждение может вызвать недоумение. Ведь кажется, что сверхспираль на рис. 23 правая, а не левая. Это один из парадоксов, с которыми приходится сталкиваться при изучении сверхспирализации. [14]

Рентгеноструктурные данные показывают, что каждый отдельный полипептидный участок цепи имеет форму спирали, на один виток которой приходится три аминокислотных остатка. Молекула коллагена состоит из трех таких спиралей ( так называемых а-спиралей), сплетенных в сверхспираль и связанных между собой поперечными водородными связями. Компактные остатки глицина, занимающие каждое третье положение элементарных спиралей, поочередно внедряются в сердцевину составной спирали, в то время как другие, более объемистые аминокислотные остатки ориентированы наружу. [15]

Страницы: 1 2 3