Cтраница 2
В данной главе мы рассмотрим различные типы взаимодействий, кратко останавливаясь на теоретических представлениях и на экспериментальных фактах, подтверждающих эти представления. Взаимодействия оснований друг с другом будут рассмотрены отдельно; эффекты, связанные с взаимодействием зарядов фосфатных групп, - в разделах, посвященных конкретным чертам вторичной структуры нуклеиновых кислот. [16]
В нуклеиновых кислотах остатки, участвующие в образовании водородных связей с комплементарными гетероциклами, имеют, как правило, резко сниженную реакционную способность по сравнению со свободными гетероциклами. Поэтому в этенопроизводные легко превращаются остатки, находящиеся в однонитевых участках, и существенно труднее - остатки, образующие двуспиральную структуру. Реагенты, различающие одно - и двунитевые структуры полинуклеотидов, широко используются для детального изучения вторичной структуры нуклеиновых кислот, в частности для выявления шпилечных структур. В табл. 7.7 приведены некоторые реагенты, широко применяемые для изучения пространственной структуры белков и нуклеиновых кислот методом химической модификации. [17]
Во многих случаях водородные связи соединяют группы, принадлежащие остову полипептидной цепи ( например, в структурах типа складчатого слоя, описанных в разд. Вторичной структурой обладают также нуклеиновые кислоты и коллаген. Молекула, имеющая форму хаотического клубка, не имеет вторичной структуры. Примером вторичной структуры нуклеиновых кислот и белков могут служить спиральные формы. Хотя вторичная структура часто стабилизируется водородными связями, наличие водородных связей в молекуле не является необходимым условием ее образования. Например, в спиральной структуре полипроли-на II вообще нет водородных связей ( разд. [18]
В ДНК две антипараллельные цепи полинуклеотидов завернуты в спираль и соединены друг с другом водородными связями, образующимися между гетероциклами оснований. Макромолекула РНК представляет собой однотяжную спираль, вторичная структура которой определяется внутримолекулярными взаимодействиями. Для того чтобы лучше понять вторичную структуру нуклеиновых кислот, были приготовлены синтетические полинуклеотиды. Эти модельные соединения широко исследованы почти теми же средствами, что и синтетические полипептиды, моделирующие структуру белков. [19]
При обработке в тех же условиях цетавлоновой соли предварительно денатурированной ДНК реагировало 2 % гуаниновых и 14 % цитозиновых остатков. Для уяснения различия в реакционной способности оснований в составе нуклеиновых кислот при бромировании и иодировании необходимы дополнительные исследования. Следует, однако, отметить, что как при бромировании, так и при иодировании нуклеиновых кислот не наблюдается количественного галоидирования составляющих оснований даже при избытке гало-идирующего агента. Возможно, что это является следствием существования какой-то вторичной структуры нуклеиновых кислот в органических растворителях. [20]