Cтраница 2
Частичный кислотный гидролиз, проводимый обычно разбавленными минеральными кислотами на холоду или при нагревании, приводит к разрыву гликозидных связей и отщеплению углеводных фрагментов; пептидные цепи в этих условиях, как правило, устойчивы. Этим путем трудно получить мелкие гликопептиды, содержащие узловую гликопептидную связь, однако метод имеет важное значение для получения олигосахарид-ных фрагментов гликопротеинов. [16]
ДНК, состоит из цепеобразных молекул, в которых остатки фосфорной кислоты чередуются с остатками углевода ( рибозы в РНК и дезоксирибозы в ДНК), причем к углеводным фрагментам присоединены органические основания: аденин ( А), цитозин ( Ц), ти-мин ( Т), гуанин ( Г) в ДНК и аденин, гуанин, цитозин и урацил ( У) в РНК. [17]
В гликопротеинах преобладает белковый фрагмент, в связи с чем они имеют ряд структурных особенностей, отличающих их от полимеров первой группы. Углеводные фрагменты этих соединений наиболее часто представлены поли - и олигосахаридами нерегулярного строения. Степень полимеризации моносахаридов в цепях невелика. В гликопротеинах подчелюстной железы быка и овцы углеводная простетическая группа представлена дисахаридом, в овальбумине - октасахаридом, в орозомукоиде найден декасахарид, в фетуине содержится 17 углеводных остатков. Типичными моносахаридными звеньями в этих веществах являются аминосахара, галактоза, фукоза и нейраминоеая кислота, присоединенная к концам углеводных фрагментов. [18]
Некоторые из них сульфированы и являются сильными кислотами. Углеводные фрагменты Полисахарид-белковых комплексов имеют регулярное строение. [19]
Углеводная часть может составлять от не менее одного до более восьмидесяти процентов общего веса гликопротеида. Поскольку углеводные фрагменты, присоединенные к определенному месту белка, могут варьировать, гликопротеид редко относится к гомогенному типу молекул. Первый пример из табл. 10.3 показывает, что вязкость и гидрофильные свойства углеводных фрагментов важны для функции многих гликопротеидов. [20]
Очень многие из описанных выше реакций замещения можно проводить также и с соответствующими нуклеозидами, если, конечно, условия ( например, сильно кислотные или основные среды) не вызывают расщепления гликозидной связи. Наличие углеводного фрагмента, по-видимому, не оказывает существенного влияния на легкость нуклеофильного замещения. Активация, особенно атомов хлора, достигается при превращении пуринов в их Диоксиды, однако существеннее становятся и побочные реакции раскрытия кольца ( см. разд. [21]
Очень многие из описанных выше реакций замещения можно проводить также и с соответствующими нуклеозидамн, если, конечно, условия ( например, сильно кислотные или основные среды) не вызывают расщепления гликозитной связи. Наличие углеводного фрагмента, по-видимому, не оказывает существенного влияния на легкость нуклеофильного замещения. V-оксиды, однако существеннее становятся и побочные реакции раскрытия кольца ( см. разд. [22]
В качестве углеводного фрагмента выступают остатки D-рибозы или 2-дезокси - Ь - рнбозы. Фосфорная группа этерифицирует гидроксиль-ную группу при атоме С-5 углеводного фрагмента в одних нуклеотида. [23]
Эта группа гликопротеинов включает фолликулостимулирующий гормон, лютеинизирующий гормон, хорионический и менопаузаль-ный гонадотропины человека, гонадотропин сыворотки жеребых кобыл и тироидстимулирующий гормон. Первичная структура углеводных фрагментов этих гликопротеинов еще не определена из-за сложности отделения достаточного количества чистого гормона от очень похожих ( по химическим и физическим свойствам) гормонов и других макромолекул, включая гликопротеины, присутствующие в окружающей среде. [24]
Хроматографический сорбент с АГП был получен на основе си-ликагеля с размером пор 300 А, на котором белок был иммобилизован путем изменения его функциональных групп и последующего сшивания, осуществляемого таким образом, чтобы образовавшиеся агрегаты были достаточно большими и могли удерживаться в порах. АГП содержит пять углеводных фрагментов, на долю которых приходится - 45 % его молекулярной массы. Окислением периодатом натрия первичные спиртовые группы этих углеводных фрагментов превращаются в альдегидные. Закрепление модифицированного белка на силикагеле проводится путем повышения рН буферного раствора, что вызывает его сшивание через образование оснований Шиффа. [25]
Интересная группа соединений образуется как бы на границе существования двух важных классов соединений-липидов и углеводов. В зависимости от соотношения липидных и углеводных фрагментов, эти соединения определяют как гликолипиды ( в самом общем случае), выделяя в них группу липо-полисахаридов. В природе эти соединения распространены очень широко - они обнаружены в растениях, животных и микроорганизмах. В последнем случае, для микроорганизмов, характерно присутствие липо-полисахаридов, которые играют важную роль в их жизнедеятельности: участвуют в формировании клеточных мембран, в транс-мембранном транспорте различных соединений, являются эндотоксинами, антигенами, рецепторами бактериофагов. [26]
Молекулы РНК не ассоциируют в пары с образованием аналогичной двойной спирали. Значительный объем дополнительной гидроксильной группы в углеводном фрагменте ограничивает конформационную гибкость полинуклеотидной цепи РНК. Главным образом эта гидроксильная группа определяет способность фермента различать ДНК и РНК. Внутри молекулы РНК могут образоваться короткие стержнеобразные двойные спиральные структуры за счет свертывания частей одной и той же нуклеотидной цепи. [27]
Так, 291 обычно вызывает однонитевые разрывы, для 293 типичными являются двунитевые, а для дайнамицина А ( 294) наблюдаются оба типа повреждений ДНК. На характер действия антибиотика влияет также природа углеводных фрагментов молекулы. [28]
Ковалентно связанная углеводная часть определяет величину, вязкость и местонахождение многих гликопротеидов. В единственном гликопротеиде с известной структурой белке IgG Kol миеломы [543] углеводный фрагмент имеет фиксированное расположение и выполняет, по-ви-димэму, чисто структурную функцию. Вероятно, это относится к большинству гликопротеидов. [29]
В настоящее время получены доказательства, что это действие осуществляется через так называемые гормональные рецепторы, под которыми понимают химические структуры соответствующих тканей-мишеней, содержащие высокоспецифические участки ( углеводные фрагменты гликопротеинов и ганглиозидов) для связывания гормонов. Результатом подобного связывания является инициация рецепторами специфических биохимических реакций, обеспечивающих реализацию конечного эффекта соответствующего гормона. Рецепторы гормонов белковой и пептидной природы расположены на наружной поверхности клетки ( на плазматической мембране), а рецепторы гормонов стероидной природы-в ядре. Общим признаком всех рецепторов независимо от локализации является наличие строго пространственного и структурного соответствия между рецептором и соответствующим гормоном. [30]