Конформация - тип
Cтраница 3
По своей форме кривые денатурации таких полимеров аналогичны кривым второго цикла денатурации необратимо денатурированного двухцепочечного полинуклеотида, обозначенным на фиг. Промежуточными состояниями в большинстве процессов денатурации являются, по-видимому, конформации типа IV - весьма сильно дезориентированные клубки, все еще удерживаемые один около другого очень короткими комплементарными участками, идентичными по своему характеру тем, какие присутствуют обычно в нативных структурах. У ДНК с поперечными ковалентными связями или у кольцевых ДНК некоторые участки всегда остаются спиральными, и денатурация в этих случаях является обратимой до тех пор, пока не затронуты эти поперечные связи ( кривая В на фиг. При тепловой денатурации и денатурации под действием высоких значений рН или некоторых органических растворителей были идентифицированы также промежуточные формы типа / / ( фиг. В такой форме молекула содержит как полностью упорядоченные, так и разупорядоченные участки и сохраняет способность при соответствующем изменении условий немедленно принимать полностью упорядоченную исходную конформацию. [31]
Представляется вероятным, что для некоторых форм замещающих реагентов Y конформации типа VIII могут стерически оказаться более выгодными, чем конформации типа IX, и, следовательно, в этих случаях возможно проявление активирующего действия ортонитрогруппы в переходном состоянии. [32]
Действительно, уже рассмотрение моделей [86] показывает, что если четыре угла р, %, cpj i и tyi i находятся в области разрешенных конформаций, то атомы Cai i и Cai i не подходят близко один к другому. Примерно то же мы видели при рассмотрении развернутых форм трипептидов, в которых конформаций типа RR, RB, BR и ВВ оказывались почти равновероятными. [33]
 |
Вычисленные ( линии и измеренные ( точки зависимости In Fsl от i / T для н-алка-нов С - Св. [34] |
Это уменьшение вызывается удалением части атомов разветвленной молекулы от поверхности адсорбента даже в положении минимума потенциальной кривой. Расчеты для цикланов - циклопентана ( с учетом некомпланарности цикла), циклогексана ( для конформации типа кресла) и адамантана привели также к хорошему согласию с газохроматографи-ческими определениями на графитированной термической саже с однородной поверхностью. [35]
Аналогично, если в значение рКа для соединения XXIV внести поправку на присутствие двух ж-метильных групп, то получится приведенное значение рКа 7 87, близкое к величине 7 68, указанной для XXIII. Для соединения XXIV стерически наиболее выгодна конформация типа II, а для жесткой системы XXIII закреплена конформация типа I. [36]
Представляется вероятным, что для некоторых форм замещающих реагентов Y конформации типа VIII могут стерически оказаться более выгодными, чем конформации типа IX, и, следовательно, в этих случаях возможно проявление активирующего действия ортонитрогруппы в переходном состоянии. [37]
По-видимому, этот угол обеспечивает благоприятное расположение метильной группы и атома хлора друг относительно друга. В конформации типа IX такой угол нельзя создать для обеих СН3 - групп ( заняв благоприятное положение относительно одной из СН3 - групп, атом хлора окажется слишком сближенным со второй группой СН3), что и делает конформацию типа IX менее выгодной. [38]
Липскомб и сотрудники [ 49г ] определили кристаллическую структуру соединения XVI и установили, что оно обладает конформацией типа II. Эти же авторы [ 49г ] провели расчеты по методу ЛКАО-МО на модели XVI, в которой метальные группы были замещены на атомы фтора ( XVII), при сохранении гибридизации атома азота и общей кон-формации молекулы. Эта конформация типа II была сравнена с конформацией типа I, в которой была сохранена та же гибридизация по азоту, а группы F2N повернуты на 90 вокруг N - S-связи. Различие в суммарной орбитальной энергии показало, что конформация типа II является более устойчивой, и эта устойчивость обеспечивается d - орбитальными взаимодействиями. [39]
При вращении относительно хр -, /) 3-связи ( напр. IV, а конформации типа VI соответствуют наивысшей энергии. Конформации V представляют промежут. Если три заместителя у яр3 - атома одинаковы ( нитрометаи, толуол), то имеется симметричный шестикратный барьер, описываемый ф-лой И ( ф) ( Н6 / 2) ( 1 - соябф); устойчива также заслоненная конформация. [40]
Липскомб и сотрудники [ 49г ] определили кристаллическую структуру соединения XVI и установили, что оно обладает конформацией типа II. Эти же авторы [ 49г ] провели расчеты по методу ЛКАО-МО на модели XVI, в которой метальные группы были замещены на атомы фтора ( XVII), при сохранении гибридизации атома азота и общей кон-формации молекулы. Эта конформация типа II была сравнена с конформацией типа I, в которой была сохранена та же гибридизация по азоту, а группы F2N повернуты на 90 вокруг N - S-связи. Различие в суммарной орбитальной энергии показало, что конформация типа II является более устойчивой, и эта устойчивость обеспечивается d - орбитальными взаимодействиями. [41]
Представление о последовательных уровнях макромолекулярной организации было впервые выдвинуто Лпндерштрем-Лангом применительно к белкам и затем обобщено Дж. Под и е р-вичной структурой белка понимают общее число пептидных связей в М, и характер чередования боковых радикалов аминокислотных остатков. Как известно, Ь - полипептиды способны принимать упорядоченные конформации типа сс-спирали, кросс - [ 5-формы и др. Последовательность упорядоченных и неупорядоченных участков белковой цени ( однозначно предопределенную первичной структурой - см. ниже) называют вторичной струк аурой. [42]
Формулы Хеуорса подразумевают плоское строение кольца. Это приблизительно верно лишь для фуранов. Рентгеноструктурные исследования моносахаридов показали, что пиранозы существуют в виде кресловидной конформации ( аналогично конформации типа кресла для циклогексана), причем такой, в которой максимально возможное число объемистых заместителей ( четыре) распо ложены экваториально. [43]
Конформация углеводного цикл в может быть определена квк функция всех торсионных углов т0 - А. Однвко для более простого и наглядного описания конформации рассматривают отклонения определенных втомов от плоскости, образуемой тремя или четырьмя другими атомами. Если четыре его атомв лежат в плоскости, а пятый выведен из нее, то такие конформации называются конформациями типа конверт и обозначаются Е или V. Дальнейшее определение конформации основывается нв взаимном расположении атома C ( S) и атома ( или втомов), выведенного из плоскости цикла. Если атом п [ С ( 2) или С ( З) 1 выведен из цикл в в ту сторону, с которой нв ходите я атом С ( 5), то конформация называется эндо, в если отклонен в сторону, противоположную атому С ( 5) - экзо-коиформвцией. [44]
Островная структура, построенная из комплексных катионов [ СоЕп2 Sarc ] 2, анионов J - и молекул воды. Координация атома Со октаэдрическая. В координационную сферу входят три биден-татных лиганда: две молекулы этилендиамина и одна саркосинатная группа. Этилендиаминовые лиганды имеют гош-строение и образуют конформацию типа / С / С. [45]
Страницы: 1 2 3 4