Нативная конформация

Cтраница 1

Нативная конформация ( если иметь в виду четвертичную структуру) может поддерживаться еще и ионами металлов и простетическими группами. [1]

Нативная конформация молекулы белка определяется как ко-валентными, так и нековалентными связями или нековалентными взаимодействиями. [2]

В данном случае восстановление нативной конформации не требует наличия никаких дополнительных структур. Какие же модели свертывания полипептидной цепи в соответствующую конформацию являются наиболее вероятными. Одной из распространенных гипотез самоорганизации белка является гипотеза расплавленной глобулы. В рамках этой концепции выделяют несколько этапов самосборки белков. [3]

Дисульфидные группы выполняют важные функции по поддержанию нативной конформации белковой молекулы. Локализация положений дисульфидных связей является обязательным этапом при определении первичной структуры белков. [4]

Модель пространственной структуры рибонуклеазы А. [5]

Большое значение имело открытие, что при реокисле-нии восстанавливается нативная конформация и вместе с этим полная биологическая активность фермента. [6]

Для свертывания необходимы промежуточные состояния, не входящие в нативную конформацию. Наиболее неожиданный результат заключается в том, что свертывание не есть последовательное все большее и большее приближение к нативной структуре, но что для него необходимы состояния ПА и Пв, которые не входят в окончательную нативную структуру. [7]

Ясно, что при сравнении построенного начального расположения с нативной конформацией среднеквадратичное отклонение должно существенно зависеть от выбора характерного размера многогранника - длины ребра А. Существует некоторое оптимальное расположенние - спиралей, наиболее близкое к нати - вному. Ему соответствует длина ребра А при увеличении длины ребра спирали удаляются друг от друга и от реального расположения1, при уменьшении ребра среднеквадратичное отклонение должно возрастать, а спирали оказываются в стерически запрещенных конформациях. [8]

Свободная энергия процесса удаления молекулы растворителя. [9]

Шерага рассмотрел теоретические аспекты проблемы глобулы [4, 121] в предположении, что нативная конформация поли-пептидиой цепи в растворе отвечает минимуму функции, равной сумме потенциальных энергий всех внутримолекулярных взаимодействий и свободной энергии всех взаимодействий белка с растворителем. [10]

Представляет огромный интерес вопрос о природе тех сил, которые стабилизируют нативную конформацию белков. Выяснить его прямым исследованием структуры глобулярных протеинов очень трудно. И это вполне естественно, ибо для понимания природы сил, стабилизирующих нативную макроструктуру, необходимо знать, как эту структуру можно разрушить. [11]

Еще более убедительны опыты, демонстрирующие приобретение растущим пептидом на рибосоме иммунологической специфичности, присущей нативной конформации готового белка. Так, рибосомы, несущие растущие цепи р-галактозидазы, реагируют с антителами против готового фермента еще задолго до завершения трансляции мРНК и освобождения белка. Используемые антитела были специфичны к третичной структуре: денатурация рибосомосвязанного материала путем нагревания полностью разрушала его способность реагировать с антителами. [12]

Неконсервативные замены, как, например, введение отрицательного заряда в гидрофобную внутреннюю часть, несовместимы со стабильностью нативной конформации белка, поскольку при этом потери свободной энергии оказываются порядка 10 ккал / моль, что приближается к значению А0общ перехода свернутая - развернутая цепь ( разд. Примером может быть аномальный гемоглобин Вены [494], в котором замена Tyr-130 - Asp в a - цепи приводит к большим конформационным перестройкам, в результате которых отрицательный заряд компенсируется положительным. [13]

Структура РНазы образована одной полипептидной цепью с молекулярной массой 13683, в состав которой входят четыре дисульфидные связи, способствующие стабилизации нативной конформации. На основании химических рентгеноструктурных данных было показано, что из четырех остатков гистидина два - His-12 и His-119 - особенно пространственно сближены и необходимы для проявления ферментативной активности. [14]

Так же обстоит дело и nppi синтезе РНК in vitro с участием ДНК-зависимых РНК-полимераз, если ДНК высокомолекулярна и сохраняет свою нативную конформацию, а катализирующий реакцию фермент выделен в достаточно мягких условиях. [15]

Страницы: 1 2 3 4