Нативная конформация

Cтраница 2

Поддержание величины е в смесях на уровне их значений для водных растворов, однако, само по себе еще не обеспечивает сохранение нативной конформации многих белков, необходимой для проявления ферментативной активности. В водно-метанольных растворах, например даже в условиях, когда 8 80, наблюдается необратимое ингибирование таких ферментов, как дегидрогеназы и редуктазы. Такое поведение ферментов характерно для смесей глицерина с водой. [16]

Белки, ренатурация ( отжиг) - процесс, обратный денатурации, состоит в повторном хаотическом свертывании хаотичной белковой молекулы ( денатурированной) в нативную конформацию. Материальной основой для ренатурации является специфическая аминокислотная последовательность в молекуле белка, так как нативная его конформация возникает в результате взаимодействия аминокислотных остатков между собой и с растворителем. Ренатурация возможна только при обратимой денатурации. [17]

А / ч - их вклад в свободную энергию перехода, а - численный параметр, зависящий от степени доступности растворителю групп данного типа в нативной конформации. Величины AF находят из данных о растворимости аминокислот в воде и в растворе мочевины данной концентрации. [18]

Скорость ферментативной реакции зависит от концентрации субстрата ( субстратов), рН, температуры, присутствия активаторов или ингибиторов, природы буфера, его ионной силы и др. Ряд факторов оказывает влияние на стабильность фермента, вызывая необратимые-изменения его нативной конформации. Подробное исследование стабильности ферментов описано ниже. [19]

Если, например, полностью развернуть молекулу рибонуклеа-зы путем восстановления четырех ее дисульфидных мостиков меркаптоэта-нолом в 8 М мочевине, а затем вызвать реокисление таких развернутых молекул в контролируемых условиях, то молекулы ( от 95 до 100 %) вновь приобретают нативную конформацию, что подтверждается восстановлением не только физических свойств, но и ферментативной активности. Этот опыт схематически представлен на фиг. В табл. 20 приведены данные по рена-турации некоторых белков. Во всех случаях, за исключением инсулина, степень восстановления нативных структур значительно превышает величину, которой следует ожидать, исходя из статистических соображений. Эти данные вовсе не означают, однако, что процесс образования дисульфидных связей в белках может протекать in vivo без направленного катализа. [20]

Сохранение нативной конформации белковой молекулы - обязательное условие ее специфического функционирования Г Конформация белка - это термин более широкий, чем термин структура белка. Первый используется тогда, когда имеют в виду одновременно вторичную и третичную структуру полипептидной цепи. При заданных физиологических условиях конформация белка является энергетически наиболее выгодной, такой, которая характеризуется минимальной свободной энергией. [21]

Сказанное здесь не следует понимать в том смысле, что ферментативная активность и другие свойства белков могут быть объяснены только на основании знания пространственной структуры: на самом деле фермент-субстратные взаимодействия достаточно сложны, и вряд ли какая-либо одна теория сможет охватить все разнообразие явлений, связанных с биологическими функциями белков. Однако сохранение нативной конформации всегда необходимо для того, чтобы белок мог функционировать. [22]

Схема реакц. камеры секвенатора. [23]

Интерпретация карт электронной плотности молекулы значительно облегчается при знании аминокислотной последовательности. Необходимое условие кристаллизации-сохранение нативной конформации, к-рая часто реализуется лишь в условиях, приближенных к физиологическим. С помощью обычного рентгеновского излучения проводить анализ таких гигантских образований сложно. В этих случаях используют синхротронное рентгеновское излучение, интенсивность к-рого может быть на два порядка выше. Вследствие этого резко сокращается время эксперимента по регистрации дифракц. При изучении двухмерных кристаллов используют электронную микроскопию н электронографию. [24]

С точки зрения важной роли растворителя в процессах складывания молекулы белка отсутствие влияния дегидратации на конформацию вызывает удивление. Возможно, что стабильность нативной конформации при пониженном содержании воды имеет кинетическую природу, вследствие чего конформаци-онные изменения оказываются подавленными. [25]

Для реализации такого подхода необходимо выбрать протеолитический фермент и подобрать условия, при которых полипептидная цепь исследуемого белка будет гидролизоваться только по наиболее доступным пептидным связям. Важным условием ограниченного протеолиза является сохранение нативной конформации белка. Поэтому при выделении белка следует избегать действия денатурирующих агентов. [26]

Полирибосома. А. Пять рибосом одновременно считывают информацию, содержащуюся в молекуле мРНК, передвигаясь по ней от 5 - к З - концу. Б. Электронная микрофотография полирибосомы из прядильной железы тутового шелкопряда. мРНК, кодирующая фиброин шелка, транслируется одновременно большим числом рибосом. По мере движения рибосом к З - концу мРНК полипептидные цепи становятся все длиннее. В. Схема, поясняющая электронную микрофотографию Б. [27]

В какой-то момент-во время синтеза полипептидной цепи или после его завершения-белок самопроизвольно принимает свою нативную конформацию ( разд. [28]

Книга Шульца и Ширмера Принципы структурной организации белков - первая в мировой литературе монография, в которой рассматриваются общие вопросы пространственного строения белков и на этой основе их биологические функции. Основное достоинство книги - широкий охват рассматриваемых вопросов, причем главное внимание направлено на механизм свертывания полипептидной цепи в нативную конформацию белка и на структурно-функциональную зависимость. Обсуждение различных аспектов структурной проблемы белка проведено на высоком профессиональном уровне. [29]

Количество контактов у - спиралей в II белках. Заштрихованная область. соответствует спиралям, у которых есть по два значимых контакта с другими. [30]

Страницы: 1 2 3 4