Нативная конформация

Cтраница 3

Полученные данные показывают, что, как правило, определения а-спираль тесно взаимодействует с двумя другими. Это также жидетельствует против модели полностью автономной укладки пар ширалей на ранних этапах процесса самоорганизации и позволяет тредположить, что формирование нативной конформации, в том чи-ле - попарные взаимодействия, происходят, видимо, после эта - ias на котором все - спирали образуют квазисферическую глобу-чу контакты гидрофобными поверхностями экранируют их от воды. [31]

Все белки, которые были обследованы в присутствии очень высоких концентраций гуанидингидрохлорида, не содержали остаточных нековалентно связанных структур. Если все существующие дисульфидные связи были разорваны, то каждая полипептидная цепь полностью раскручивалась до конфигурации линейного статистического клубка, так что никакие структурные элементы нативной конформации при этом не сохранялись. Радиус инерции беспорядочно изгибающейся полипептидной цепи является функцией только числа аминокислотных остатков в цепи, а следовательно, функцией молекулярного веса цепи независимо от ее состава. [32]

Другой путь поиска следов структуры в несвернутых полипептидных цепях состоит в расщеплении нативных полипептидных цепей и в проверке с помощью специфичных антител, который из фрагментов принимает свою нативную конформацию. Согласно уравнению (3.2), это отвечает невыгодному изменению свободной энергии приблизительно на 4 ккал / моль. Стабильные фрагменты, которым соответствуют высокие значения / (, наиболее вероятно представляют нуклеации свертывания. [33]

В свою очередь трехмерная структура белковой молекулы также содержит информацию, но уже совершенно нового типа, а именно функциональную, которую акад. Как будет показано далее, все биологические свойства белков ( каталитические, гормональные, антигенные и др.) связаны с сохранностью их третичной структуры, которую принято называть нативной конформацией. Любые воздействия ( термические, физические, химические), приводящие к нарушению этой конформации молекулы ( разрыв водородных и других нековалентных связей), сопровождаются частичной или полной потерей белком его биологических свойств. [34]

Дифференциальные ИК-спектры карбоангидразы быка в присутствии. [35]

Иодацетат реагирует с гистидином, входящим в пептидный фрагмент, упоминавшийся в разд. Имеется ряд доказательств [65, 66] того, что эта реакция происходит в активном центре: а) параллельно с образованием 3-карбоксиметилгистидина теряется эстеразная активность; б) иодацетат ивактивирует карбоангидразу необратимо только тогда, когда присоединяется к ней как обратимый ингибитор; в) сульфиды предотвращают необратимое ингибирование; г) для быстрой дегидратации необходима нативная конформация фермента; в присутствии 8 М мочевины быстрая реакция с гистидином уже не наблюдается. [36]

Трехмерная структура белка определяется невалентными взаимодействиями между аминокислотными остатками цепи, а также между этими остатками и растворителем ( гл. Однако поскольку нативная конформация может не отвечать глобальному энергетическому минимуму, то расчет энергии всех возможных конформаций цепи может не привести к правильному ответу. [37]

Денатурации рибонуклеазы А. [38]

Эти опыты показывают, что программа самосборки белка закодирована в его первичной структуре. За этим сравнительно медленным процессом следует быстрое сворачивание цепи в нативную структуру. На первых этапах ренатурации белков, в поддержании нативной конформации которых участвуют дисульфидные мостики, образуются промежуточные производные с правильными и неправильными дисуль-фидными связями. [39]

Растворимая глицеральдегид-3 - фосфатдегидрогеназа из дрожжей при инкубации на холоде в присутствии АТФ и хлористого натрия диссоциирует на димеры и теряет свою активность. Диссоциация тет-рамера иммобилизованной глицеральдегид-3 - фосфатдегидрогеназы позволяет получить связанные с матрицей димеры и исследовать их свойства. Стабилизирующее действие носителя приводит к получению димеров, сохранивших нативную конформацию. [40]

По данным Г. П. Шумакович и Б. А. Кузнецова, скорость денатурации превышает 10 с-1. Только в случае фос-форилазы имеет место небольшая задержка поверхностной денатурации ( более чем на 5 с), что объясняется последовательными процессами денатурации двух субъединиц, одна из которых временно оказывается во втором слое. При этом, в отличие от Берга и других исследователей, которые высказывали мнение о сохранении нативной конформации белка ( или небольшой обратимой денатурации) при адсорбции на ртутном капающем электроде, Кузнецовым показано, что и в случае адсорбции белков в условиях полярографических исследований на капающем электроде ( время 0 5 - 7 с) имеют место такие же процессы, как и на стационарном электроде. [41]

Сигнальная гипотеза - схема протекания процесса биосинтеза секреторных белков. [42]

Сигнальный пептид, состоящий обычно из 15 - 20 гидрофобных аминокислот, вступает через рибосомный рецепторный белок во взаимодействие с эндоплазматическим ретикулумом и начинает локально-специфический синтез белка. Еще до завершения синтеза он отщепляется сигнальной пептидазой от остальной цепи. Полипептидная цепь секреторного белка выводится через систему каналов эндоплазматического ретикулума и вслед за этим сворачивается в нативную конформацию. [43]

По данным Рихардса [219], рибонуклеаза А при обработке бактериальной протеазой субтилизином расщепляется между остатками А1а - 20 и Ser-21 на так называемый S-nenmud ( 1 - 20) и S-белок с последовательностью 21 - 124, содержащей 4 дисульфидных мостика. Оба компонента после разделения показывают ничтожную биологическую активность. S-пептид и S-белок с помощью невалентных связей собираются в так называемую рибонуклеазу S, обладающую пространственной структурой, близкой к нативной конформации. [44]

Рибосомные белки характеризуются в основном глобулярной компактной конформацией, с развитой вторичной и третичной структурой. Одно время широко распространилось убеждение, что рибосомные белки являются особенными, не похожими на обычные глобулярные белки; сообщалось об их сильно вытянутой или сильно рыхлой конформации, иногда разветвленной по всей рибосомной субчастице. Однако скоро стало понятно, что рыхлые конформации изолированных рибосомных белков представляют собой артефакт, являющийся следствием низкой стабильности их нативной конформации вне рибосомы. Конформация рибосомных белков стабилизируется при взаимодействии с РНК и друг с другом. [45]

Страницы: 1 2 3 4