Структурный домен
Cтраница 1
Структурные домены четко ограничены на картах электронной плотности. Анализ карт электронной плотности, рассчитываемых в ходе рентгеноструктурного анализа, показал, что многие белки состоят из нескольких глобулярных областей, довольно слабо связанных между собой. Эти области, четко ограниченные на картах распределения электронной плотности, получили несколько неопределенное название структурные домены. Очевидно, что определение домена весьма нестрого и здесь может возникать много спорных ситуаций. Среди глобулярных белков четко определенные домены были обнаружены в иммуноглобулинах. Схематически они изображены на рис. 4.2, в; в этом случае домены располагаются вдоль полипептидной цепи, как жемчужины в ожерелье. [1]
Структурные домены, по-видимому, служат единицами свертывания белка. Корреляция между близкими по цепи остатками дает основание рассматривать домены как такие участки цепи, которые свертываются независимо друг от друга. [2]
Структурные домены четко ограничены на картах электронной плотности. Анализ карт электронной плотности, рассчитываемых в ходе рентгеноструктурного анализа, показал, что многие белки состоят из нескольких глобулярных областей, довольно слабо связанных между собой. Эти области, четко ограниченные на картах распределения электронной плотности, получили несколько неопределенное название структурные домены. Очевидно, что определение домена весьма нестрого и здесь может возникать много спорных ситуаций. Среди глобулярных белков четко определенные домены были обнаружены в иммуноглобулинах. Схематически они изображены на рис. 4.2, в; в этом случае домены располагаются вдоль полипептидной цепи, как жемчужины в ожерелье. [3]
Структурные домены, по-видимому, служат единицами свертывания белка. Корреляция между близкими по цепи остатками дает основание рассматривать домены как такие участки цепи, которые свертываются независимо друг от друга. [4]
Поскольку структурные домены, по-видимому, являются единицами свертывания, то симметричное расположение доменов, наблюдаемое в роданезе ( рис. 5.17, а) и иммуноглобулинах ( табл. 5.3), объяснимо. Можно предположить, что в симметрически связанных сверхвторичных структурах домены образуются преимущественно на начальной стадии процесса свертывания, так как они сами по себе достаточно стабильны. Последующая агрегация создает симметрию. Симметричные сверхвторичные структуры обнаружены в виде ( За ( 3а ( 3-звена дегидрогеназы ( рис. 5.12, б и 5.17, б), в виде flafl - звеньев триозофосфатизомеразы и пируват-киназы ( рис. 5.17, д), а также в виде ( 3-зигзагов в полости ( 3-струк-туры Ser-протеаз ( рис. 5.17, г) и в виде антипараллельных пар a - спиралей в гемеритрине. [5]
Такие самозавершенные структурные домены, с прочным спариванием их 5 - и 3 -концов, являются важнейшим конформаци-онным мотивом обеих высокополимерных рибосомных РНК. [7]
Возможно, что такой структурный домен является функциональной единицей. Доменная организация ДНК сохраняется, по всей ероятности, также в интерфазном хроматине. [9]
Возможно, что такой структурный домен является функциональной единицей. Доменная организация ДНК сохраняется, по всей вероятности, также в интерфазном хроматине. [10]
 |
Распушенная метафазная хромосома, полученная путем удаления Гистонов при высокой концентрации соли ( а. такой же препарат, обработан-нуклеазой. белковый остов остается, петли гидролизуются ( б. [11] |
Возможно, что такой структурный домен является функциональной единицей. Доменная организация ДНК сохраняется, по всей роятности, также в интерфазном хроматине. [12]
Подразделение глобулярных белков на структурные домены приблизительно одинаковой величины и присутствие одинаковых структурных доменов в разных белках привели к гипотезе, согласно которой большинство белков сконструировано как модульные системы из структурных доменов в качестве модулей ( см. также разд. В соответствии с такой гипотезой не следует придавать слишком большого значения всей полипептидной цепи, а концентрировать внимание на функциональных и, насколько возможно, структурных доменах. [13]
Не существует принципиальных различий между агрегированием структурных доменов и агрегированием глобулярных белков. [14]
Обычно активные центры ферментов включают части всех структурных доменов глобулярного белка. Субстраты и кофакторы обычно присоединяются к разным доменам. Кроме того, этот домен обнаружен на N-конце трех дегидрогеназ и одной киназы [230- 233, 235], а также на С-концевой половине четвертой дегидрогена-зы [234] и в средней части фосфорилазы [236], что указывает на возможность дупликации соответствующего гена и его переноса в другое место генома. [15]
Страницы: 1 2 3