Структурный домен

Cтраница 2

Глобулярные белки состоят из одного или большего числа структурных доменов. Глобулярным белком принято называть продукт свертывания одиночной полипептидной цепи. В связи с этим глобулярные белки обычно состоят из одного или большего числа структурных доменов. В некоторых случаях ( Ser-протеазы, иммуноглобулины, роданеза и др.) домены настолько подобны, что можно предположить дупликацию гена. [16]

Наличие корреляции между близкими в цепи остатками способствует выявлению структурных доменов. Такой способ был количественно оценен для химотрипсина, деление которого на два домена не очень ясно проявлялось на карте электронной плотности. [17]

Генноинженерная конструкция, кодирующая рекомби-нинтный белок цинковые пальцы - эндонуклеаза рестрикции Fold. [18]

Существует весьма интересный класс белков, в молекуле которых присутствуют уникальные структурные домены, связывающие атомы Zn2, - так называемые цинковые пальцы. Эти белки связываются со специфической нуклеотидной последовательностью, встраиваясь своим ос-спиральным участком в большую бороздку двойной спирали. Так, белок Zif268 из клеток мышей содержит три цинковых пальца, каждый из которых взаимодействует с определенным кодоном ДНК. Поскольку эти пальцы связываются с ДНК независимо друг от друга, их можно объединить в составе одного пептида таким образом, чтобы связывание происходило с определенным сайтом. Это позволяет создавать нук-леазы, расщепляющие ДНК в уникальных сайтах, объединив нуклеотидные последовательности, кодирующие цинковые пальцы, с частью гена неспецифичной нуклеазы Fokl бактерии Flavobacterium okeanokoites. После очистки реком-бинантного белка N-концевые остатки гистидина были удалены обработкой тромбином. [19]

Активный центр такого функционального домена обычно расположен на границе двух структурных доменов. [20]

Подразделение глобулярных белков на структурные домены приблизительно одинаковой величины и присутствие одинаковых структурных доменов в разных белках привели к гипотезе, согласно которой большинство белков сконструировано как модульные системы из структурных доменов в качестве модулей ( см. также разд. В соответствии с такой гипотезой не следует придавать слишком большого значения всей полипептидной цепи, а концентрировать внимание на функциональных и, насколько возможно, структурных доменах. [21]

Сферическая область материнского кристалла единичного радиуса после двой-никования превращается благодаря послойному относительному сдвигу s в эллипсоид вращения. К1 - плоскость двойникования, fli - направление сдвига, Кг - второе круговое сечение эллипсоида, - угол наклона большой оси эллипсоида по отношению к плоскости K.| Расположение атомов в плоскости сдвига кальцита. слева - материнская часть, справа - двойник. Строение границы показано условно. ОЕ - плоскость двойникования, ОБ и ОВ - плоскости спайности, ВС и В С - ребра ромбоэдров материнского и сдвойникованного кристаллов, 1 - углерод, 2 - кальций, 3 - кислород. Стрелки показывают направления двойникующих усилий. [22]

Компоненты двойника могут различаться своими физическими свойствами, что облегчает экспериментальное исследование двойниковой структуры и дает возможность определить связь структурных доменов ( двойников) с доменами другого типа. [23]

К титанат стронция претерпевает несегнетоэлектрический структурный фазовый переход, решетка приобретает слабое тетрагональное искажение 0 01 %, кристалл разбивается на двойниковые области - структурные домены и становится одноосным. [24]

Сравнение контуров рибосомной 30S субчастицы и ее изолированной 16S РНК в компактной форме по данным электронной микроскопии. [26]

Тогда, зная локализацию обоих концов 16S РНК на 30S субчастице и локализацию ряда рибосомных белков на первичной структуре 16S РНК и на поверхности 30S субчастицы ( см. следующую главу), можно идентифицировать видимые ветви, или доли, Y-образной РНК с ее тремя структурными доменами, выводимыми из первичной и вторичной структуры. По-видимому, нижняя ветвь буквы Y представляет собой 5 -концевой домен I, формирующий тело 30S субчастицы. Верхняя длинная ветвь Y-образной РНК является, скорее всего, 3 -проксимальным доменом III, входящим в состав головки 30S субчастицы. Верхняя короткая ветвь Y может быть серединным доменом II и участвовать в образовании боковой лопасти ( платформы) 30S субчастицы. [27]

Белки могут конструироваться с использованием модульных систем. Важная роль структурных доменов как основных единиц следует из сравнения трехмерных белковых структур. В разных белках встречаются одни и те же структурные домены, обнаруживаемые по характеристическому свертыванию цепи. [28]

Схематическое изображение регуляции экспрессии активности гена у эукариот. [29]

Более подробно в структурном и функциональном отношении у эукариот изучена группа белков, получивших название белков-активаторов транскрипции. Эти белки имеют специфические структурные домены для связывания с другими, но определенными регуляторными нуклеотидными последовательностями в молекуле ДНК. В частности, они содержат домен, специфически связывающийся с ДНК, и один или несколько доменов, необходимых для активирования или взаимодействия с другими регуляторными белками. Среди этих белков - активаторов транскрипции имеются белки, содержащие богатые глутамином домены ( до 25 %) и богатые пролином домены. [30]

Страницы: 1 2 3