Cтраница 1
Биологически активные молекулы могут существовать в виде различных кон-формаций, которые отличаются друг от друга степенью доступности углеводородных фрагментов для молекул растворителя. Экспонирование углеводородных участков по отношению к растворителю приводит к перестройке близко расположенных молекул воды с образованием более льдообразной структуры. Такая перестройка должна сопровождаться, как указывалось выше, большим отрицательным изменением энтропии и положительным вкладом в свободную энергию. Благодаря этому льдообразная структура, образование которой требует значительного уменьшения энтропии, не возникает. [1]
Сложные биологически активные молекулы ( напр. [2]
Многие биологически активные молекулы, а также ряд их синтетических аналогов содержат способные к ионизации группы. В молекулах нуклеиновых кислот такими группами являются кислотные фосфатные группы главной цепи, кислотные и основные группы пуриновых и пиримидиновых остатков. В белковых молекулах способны ионизоваться концевые карбоксильные и аминные группы полипептидных цепей и боковые группы ряда аминокислот, входящих в состав белков. [3]
Все разнообразие биологически активных молекул и их аналогов, которые могут быть использованы в качестве лигандов, не поддается перечислению. Тем не менее имеет смысл назвать некоторые ( иногда очень широкие, а иногда ограниченные) группы веществ и даже индивидуальные вещества, чаще других используемые в качестве лигандов. Всем им свойственна определенная биоспецифичность - индивидуальная или групповая. Под первой будем понимать строгую взаимную специфичность ( сродство) двух молекул, например антигена и антитела; под второй - такой вид биоспецифического взаимодействия, когда лиганд может связывать целую группу родственных в этом смысле веществ. Примером может служить никотинаденин-нуклеотид, взаимодействующий со всеми ферментами, для которых он является коферментом. [4]
Установление строения биологически активных молекул, обеспечивающих такое взаимодействие, - важная задача химии природных соединенй. Как замечает Шойер [12], химия природных соединений всегда полна неожиданностей как в том, что касается архитектуры молекул, так и в том, что касается биологического механизма их образования. Природа остается огромным каталогом моделей. Успешное познание этих моделей невозможно без тесного сотрудничества биологов и химиков. [5]
Но теперь мы знаем, что многие биологически активные молекулы или их предшественники содержат подобные напряженные циклы как важные структурные элементы. [6]
Удельное вращение плоскости поляризации света энантиоме-рами многих биологически активных молекул часто мало; поляриметрические методы не всегда достаточно чувствительны, чтобы обнаружить следы изомера, сопутствующего большому избытку антипода. Такой анализ может иметь важное значение по нескольким причинам. При получении биологически активных пептидов влияние изомерных примесей кумулятивно: присутствие 1 % п-аминокислоты в каждой из аминокислот, вошедшей в 10-членный пептид, приведет к неактивному на 10 % соединению. Другая область, представляющая значительный интерес, относится к обнаружению внеземной жизни. Уникальной особенностью макромолекул биологического происхождения является их способность различать и избирательно включать определенные оптические изомеры. Неудивительно, что, несмотря на трудность разделения оптических изомеров на обычных жидких фазах, ГХ уделялось значительное внимание как быстрому способу их разделения и идентификации. Особенно успешными оказались два следующих подхода: ( а) применение оптически активных жидких фаз и ( б) введение в разделяемые соединения второго асимметрического центра. [7]
Для того, чтобы сравнительно сложные формулы биологически активных молекул не затрудняли первые шаги в изложении материала, мы начинаем с обзора роли простых соединений и микроэлементов, не вдаваясь в детали химизма их действия. От свойств воды, органических кислот, углеводов читатель постепенно переходит к структурам белков и полинуклеиновых кислот. [8]
Возможности использования инфракрасной спектроскопии для определения конформации биологически активных молекул лучше всего, пожалуй, проиллюстрировать на примере исследования дихроизма инфракрасного излучения применительно к фибриллярным структурам. [9]
Только в таком состоянии они распознают и связывают биологически активные молекулы. [10]
Одним из наиболее хорошо изученных примеров взаимодействия между биологически активными молекулами может служить образование связанных водородными связями пар пури-новых и пиримидиновых остатков в двойных спиралях ДНК. Водородные связи образуются также между различными полипептидными цепями, как это имеет место, например, в случае коллагена и шелка. [11]
Фосфатная связь играет очень большую роль в химии многих биологически активных молекул. [12]
Структурный фрагмент 2 / / - пирона входит в состав множества биологически активных молекул [1-3], в том числе и природного происхождения, таких как: 5 6-де-гидрокаваин А, мультифоресин - С В, димененсин - А С и многих других. [13]
Особенно большим и подчас определяющим является влияние межмолекулярных взаимодействий на конформации биологически активных молекул. [14]
Таким образом, очищенная РНК-репликаза вируса QP может осуществлять синтез новых биологически активных молекул QP-РНК. Используя в качестве матрицы инфекционную () - цепь РНК вируса, очищенная репликаза способна синтезировать комплементарную ( - ) - цепь, которая затем в присутствии того же фермента может служить матрицей для образования полностью инфекционной Qp-PHK, идентичной с исходной () - нитью. [15]