Остатки - триптофан
Cтраница 2
Параллельное изучение методом флуоресценции природного нейротоксина и его химически модифицированных производных, содержащих дансильные и спиновые метки, позволило охарактеризовать микроокружение остатков триптофана н введенных меток и определить ряд внутримолекулярных расстоянии. [16]
 |
Поглощение некоторых металлопротеидов в видимой области спектра. [17] |
Следует помнить, что белки вообще неустойчивы к действию интенсивного УФ-облучения, кроме того, в этих условиях может идти фотоокисление остатков триптофана. Следовательно, при обнаружении белков энергия облучения и время экспозиции должны быть по возможности минимальными. [18]
В отличие от Мр - группы продукты, получаемые при расщеплении Jpt - аминокислот или пептидов при действии Ш, не алкилирувт остатки триптофана. В связи с этим можно думать, чтс fyp - защита найдет применение в синтезе триптофансодержздих, пептидов. [19]
Лабильность триптофана при обычном кислотном гидролизе является существенным препятствием при изучении последовательности аминокислот в пептидах; до настоящего времени не было найдено удовлетворительного способа для превращения остатков триптофана в более стабильные производные. Реакция, предложенная для объяснения расщепления под влиянием N-БС, предусматривает циклизацию с образованием f - лактона. На следующей схеме показан ход реакции на модели - этиловом эфире N-карбо-бензокситриптофилглицина. [20]
Примечания, ( а) - терминальные аминогруппы, аминогруппы остатков лизина, гуанидиновые группы остатков аргинина; ( б) - имидазольные группы остатков гистидина, индольные группы остатков триптофана; ( в) - терминальные карбоксильные группы, карбоксильные группы остатков глутаминовой и ас-парагиновой кислот; ( г) - фенольные группы остатков тирозина, гидроксильные группы остатков серина; ( д) - меркаптогруппы остатков цистеина; ( е) - альдегидные группы углеводов. [21]
БСИ, детально исследованный группой Вйткопа, применяется для решения различных задач [68-72], а именно: а) для расщепления соседней с остатком триптофана пептидной связи при определении первичной структуры белков; б) для определения содержания триптофана; в) для классификации различных состояний остатков триптофана. В соответствующих условиях [73] этот реагент лишь частично модифицирует остатки триптофана в белках. [22]
БСИ, детально исследованный группой Вйткопа, применяется для решения различных задач [68-72], а именно: а) для расщепления соседней с остатком триптофана пептидной связи при определении первичной структуры белков; б) для определения содержания триптофана; в) для классификации различных состояний остатков триптофана. В соответствующих условиях [73] этот реагент лишь частично модифицирует остатки триптофана в белках. [23]
Спектрофотометрическое обнаружение белков и пептидов в растворах заключается в измерении поглощения при длине волны, соответствующей максимальному поглощению. Большинство белков содержит остатки тирозина, фенилаланина и в меньшей степени остатки триптофана, характеризующиеся максимумом поглощения в коротковолновой части спектра. В этой же части спектра располагаются полосы поглощения, характерные для пептидной связи, а-спирали пептидной цепи, дисульфидных связей, остатков цистина и др. На практике наибольший интерес представляет широкая полоса поглощения в области 275 - 280 нм, характерная для остатков тирозина и триптофана. Поглощение белков в области выше 280 нм сильно зависит от рН среды, что связано с ионизацией гидроксильных групп остатков тирозина в сильнощелочной среде, вызывающей изменение коэффициента экстинкции и сдвиг максимума поглощения в более длинноволновую часть спектра. [24]
 |
Молярная экстинкция в максимумах поглощения для компонентов. [25] |
Это относится к спектрофото-метрическому определению нуклеиновых кислот в области 260 нм, в которой поглощает каждый гетероцикл, и к Определению белков в области 200 нм, в которой поглощает каждая пептидная связь. В средней УФ-области у белков поглощение происходит в первую очередь за счет остатков триптофана и в меньшей мере за счет остатков тирозина, число которых в составе полимерной молекулы невелико и резко варьирует от белка к белку. Поэтому при использовании этой области для спектрофотометрической детекции белков целесообразно пользоваться молярными величинами для биополимера в целом. Максимум поглощения у триптофансодержащих белков находится вблизи 280 нм. Поэтому иногда соотношение поглощения фракции при 260 и 280 нм используют для того, чтобы оценить, какая группа биополимеров - белки или нуклеиновые кислоты - преобладает во фракции. [26]
 |
Спектры КД полн - Ь - лнзнна в водных растворах в а-спиральной ( 1, Р - структурной ( 2 и неупорядоченной ( 3 конформациях. [27] |
Преимуществом спектров комбинационного рассеяния является то, что они мо гут быть сняты как для образцов в твердом состоянии, так и в самых разнообразных растворителях, в том числе в обычной и тяжелой воде. Этот метод дает информацию не только о вторичной структуре, но и об элементвх третичной структуры: о конфигурации дисульфид-иых связей, участии боковых цепей остатков тирозина в водородных связях, об экспонированном ( доступном для растворителя) или спрятанном в белковой глобуле положении остатков триптофана. Микроокружение аромвтических остатков в белках исследуется методом флуоресценции. Для этих целей используются также анв-лиз спектров КД в области 250 - 300 нм и дифференциальные УФ-спектры, получаемые при изменении рН водной среды, температуры или состава растворителей. По спектрам КД следят за кон-формационными превращениями белкоа и пептидов а процессе их функционирования, а также проверяют, сохранилась ли натианая конформация при изменении условий окружающей среды или при химической модификации природного соединения. [28]
 |
Спектральные изменения при окислении N-ацетилтриптофана под. [29] |
При использовании этого реагента дальнейшее окисление вообще не идет даже при высоких концентрациях Н2О2, поэтому таким путем определяют четкие изобестические точки. Применяющийся для этой цели диоксан должен быть очищен от более реакционноспособных органических перекисей. В некоторых белках остатки триптофана окисляются этим реагентом ступенчато. По-видимому, это указывает на скачкообразные конформационные изменения белковой молекулы в процессе окисления остатков триптофана. [30]
Страницы: 1 2 3 4