Cтраница 1
Невалентные взаимодействия оценивались весьма сложным и спорным образом, но полученные значения по порядку величины сопоставимы с результатами более поздних работ. [1]
Невалентное взаимодействие отклоняет связи М - Хакв в сторону атома Хтранс. [2]
Типы взаимодействий, важных для белковых структур а. [3] |
Невалентные взаимодействия были открыты Ван-дер - Ваальсом ( 1873 г.), пытавшимся объяснить отклонение поведения реального газа от закона идеального газа. Взаимодействия между валентно-несвязанными атомами имеют огромное значение для биологических организмов; в частности, они ответственны за спонтанное свертывание полипептидных цепей и цепей нуклеиновых кислот, а также спонтанное образование мембран. [4]
Невалентные взаимодействия оценивались в этой работе весьма сложным и спорным образом, но полученные значения по порядку величины сопоставимы с результатами других работ. [5]
Типы взаимодействий, важных для белковых структур а. [6] |
Невалентные взаимодействия были открыты Ван-дер - Ваальсом ( 1873 г.), пытавшимся объяснить отклонение поведения реального газа от закона идеального газа. Взаимодействия между валентно-несвязанными атомами имеют огромное значение для биологических организмов; в частности, они ответственны за спонтанное свертывание полипептидных цепей и цепей нуклеиновых кислот, а также спонтанное образование мембран. [7]
Величину невалентных взаимодействий трудно измерить и столь же трудно рассчитать. Кроме того, в стабилизацию белка важный вклад энтропийного характера вносит окружающая среда. Поэтому необходимо рассматривать систему в целом, учитывая белок и растворитель. [8]
Расчет невалентных взаимодействий между сахаром и основанием в уридине, цитидине, аденозине и гуанозине показал соответствие с конформациями, определенными в кристалле-для первых трех нуклеозидов выгодны анты-конфор-мации, а гуанозин наиболее устойчив в син-конформации. Исходя из этих величин, можно предположить, что пиримидиновые нуклеозиды и нуклеотиды находятся в анга-конформации, а пуриновые могут иметь или син - или анты-конформацию. [9]
Конформационная карта полиизобутилена, полученная минимизацией энергии по валентным углам главной цепи. [10] |
Для описания невалентных взаимодействий использовались потенциалы Скотта и Шерага [49] ( см. раздел 2 гл. [11]
Таблицы потенциалов невалентных взаимодействий приведены в Приложении. [12]
Большое значение имеет невалентное взаимодействие для стереохимии аддуктов Дильса-Альдера, содержащих более двух конденсированных колец. В качестве примера рассмотрим реакцию бицикло - [2,2,1] - гептена с циклопентадиеном [ уравнение ( 19) на стр. На рис. 9 изображена взаимная ориентация реагентов, необходимая для образования этих изомеров. Рассмотрение объемных моделей молекул показывает, что в целом переходное состояние р более компактно, чем три других переходных состояния. [13]
Оказывается, потенциалы невалентных взаимодействий, полученные из различных физико-химических данных, не дают значений барьеров вращения малых молекул, совместимых с опытными. При этом рассчитанные барьеры были примерно вдвое меньше экспериментальных, а в этане и метилсилане они получались равными нулю. Таким образом, для правильного описания барьеров вращения необходимо еще что-то, кроме атом-атом потенциалов, зависящих только от расстояний между атомами. [14]
Исходной схемой при анализе невалентного взаимодействия лигандов является модель несжимаемой сферы: предполагается, что все лиганды находятся на одинаковых расстояниях от центрального атома, и отыскивается то расположение лигандов на поверхности сферы, при котором суммарная энергия их отталкивания становится минимальной. Результат, естественно, зависит от принимаемого закона отталкивания. [15]