Изменение - кон-формация
Cтраница 3
Пример использования бирадикалов в молекулярной биологии дан в работе [22], в которой исследованы спектры ЭПР нерва омара, меченного бирадикальной меткой. В зависимости от температуры, вязкости и других условий наблюдали сильные изменения спектров, которые свидетельствуют об изменении локальных кон-формаций и локальных движений. Интересно, что возбуждающий электрический потенциал не влиял на спектр ЭПР метки; отсюда был сделан вывод, что метка находится в жидкостноподобных, гидрофобных частях нерва и потому не чувствительна к конформаци-онным изменениям нерва, проводящего возбуждающий импульс. [31]
 |
Диэлектрическая релаксация смолы ПФ-069 в уайт-спирите при 25 С. [32] |
Можно предположить, что эти изменения связаны только с молекулами, находящимися в таком взаимодействии, которое характерно для молекул в самой смоле, т.е. обусловлено наличием в растворах ассоциатов молекул. Снижение диэлектрической восприимчи-вости Х, которое происходит за счет сильного изменения е, можно объяснить повышением подвижности молекул смолы при увеличении содержания растворителя и переориентации диполей в направлении их взаимной компенсации, обусловливающей для этой части молекул снижение реакции на внешнее электрическое поле. При таком изменении кон-формации молекул определенную роль играют водородные связи. [33]
Кроме того, в литературе имеются данные [ Ham E. Аналогично можно представить, что МЭА и АПАЭТФ могут соединяться ковалентными связями с молекулами ПГЕ2, а вновь образующиеся соединения уже не будут связываться с рецепторами для простагландинов. Частичная потеря связывания в этих условиях может отражать изменение кон-формации макромолекул участка связывания под действием АПАЭТФ и МЭА, следствием чего является довольно значительная диссоциация комплекса ПГЕа - рецептор. Ранее было отмечено, что ПГЕг аащищает мембранные белки от действия соединений, реагирующих с их SH - и SS-группами. [34]
Установлено, что физическое старение может происходить в широкой области температур, лежащих ниже температуры стеклования. Обычно эта область простирается от температуры стеклования до температуры а-пе-рехода. При отжиге в области температур ниже температуры стеклования происходит изменение кон-формации макромолекул ПВХ. [35]
Атака аниона идет преимущественно в а-положение, отщепление протона от а-метиленовой группы приводит к илидообразной промежуточной ступени. Эта переходная форма представляет собой пятичленное кольцо, все составляющие которого должны быть расположены в одной плоскости. При такой форме наиболее выгодно ис-аф-элиминирование, так как оно не требует изменения кон-формации. Реакция протекает стереоспецифично, но конфигурация продукта зависит от конформации, выгодной для конкретного сульфида в переходном состоянии. [36]
Кроме прямого действия гидратации, исследованного в чистом виде на модельных системах, имеется еще и косвенное действие гидратации. В водной среде часть групп сложной полиэлектролитной молекулы может иметь гидрофобные свойства. Стремление этих групп уменьшить число возможных контактов с водной средой приводит, с одной стороны, к изменению кон-формации полимерной молекулы и, с другой стороны, к изменению структурных свойств воды в непосредственной близости. Это гидрофобное взаимодействие играет важную роль в образовании нативной структуры молекул глобулярных белков. [37]
Вследствие малочисленности имеющихся данных посторонние молекулы не всегда химически близки к полимерам. Однако мы видим, что при температурах значительно выше Tg, как это имеет место для полиизобутилена п натурального каучука, коэффициенты трения о и i для звена цепи и для посторонней молекулы соответствующих размеров очень близки по величине. Это показывает, что мономерный коэффициент трения почти полностью обусловлен силами, необходимыми для расталкивания в стороны окружающих цепей и лишь в незначительной степени связан с преодолением препятствий изменениям кон-формации цепи, в которой локализовано мономерное звено. [38]
Поскольку в случае цепных молекул асимметрия формы существует всегда, способность каждого конкретного полимера образовывать мезофазы определяется гибкостью цепи. Гибкость является таким свойством цепи, которое не может быть описано непосредственно. Она определяется способностью соседних повторяющихся звеньев цепи свободно ориентироваться независимо друг от друга. Уменьшение гибкости приводит к изменениям кон-формации цепи, а следовательно, и ее размера. Поскольку размер цепи можно определять методами рассеяния, при использовании этих методов может быть охарактеризована жесткость цепи. [39]
Этот выбор определяется, в первую очередь, условиями растворимости и сохранности материала препарата. Эти соображения могут диктовать рП и ионную силу буфера, наличие в нем мочевины и детергентов. Во-первых, такое воздействие может проявляться в изменениях кон-формации или плотности упаковки макромолекул, диссоциации белков на субъединицы, диссоциации кофакторов от ферментов и др. Во-вторых, следует проверить устойчивость материала матрицы к выбранному значению рП и диссоциирующим добавкам. [40]
Расчет дибензила интересен в том отношении, что ни структура молекулы, ни структура кристалла не предсказываются с удовлетворительной точностью, если проводить минимизацию энергии напряжения молекулы и энергии решетки кристалла по отдельности, и лишь совместное рассмотрение внутри - и межмолекулярных взаимодействий приводит к правильному результату. Конечно, нельзя думать, что расчет для какой-либо конкретной пространственной группы, в частности той группы, которая была обнаружена экспериментально, является доказательством, что для углов а, отличных от 72, энергия должна быть выше. Существующая техника расчетов не позволяет провести подобную процедуру, и потому приходится ограничиваться предположением, что изменения кон-формации молекулы могут реализоваться в пределах заданной пространственной группы. [41]
Многоступенчатый механизм ферментативного катализа - фактор, определяющий высокую активность биологических катализаторов, работающих при температурах 0 - 40 С. Химическое превращение связано с изменением структуры реагирующих веществ, т.е. с достаточно большой ядерной реорганизацией и соответственно значительной энергией активации. При каждом же превращении С, в С, , происходит небольшое изменение ядерной конфигурации, не связанное с преодолением высокого активационного барьера. Дополнительным обстоятельством, облегчающим такой многоступенчатый переход, является возможность сохранить энергию экзотермической стадии от теплового рассеяния ( в форме энергии изменения равновесной кон-формации белка) и использовать ее при прохождении эндотермической стадии. [42]
На рис. 2.29 приведена зависимость внутренних напряжений и адгезии от концентрации ацетатных групп. Однако величина адгезии меняется немонотонно и не коррелирует с нарастанием внутренних напряжений. До концентрации ацетатных групп 20 % понижение напряжений сопровождается нарастанием адгезии, а при последующем увеличении концентрации этих групп адгезия уменьшается. Можно было предположить, что это связано с изменением кон-формации макромолекул в растворе. [44]
Все это требует определенного времени, и установление равновесия ( релаксация) достигается не сразу. Например, для полимера в высокоэластическом состоянии время релаксации при конформационных изменениях равно 10 - 4 - 10 - 6 сек, а время релаксации при перемещении самих макромолекул и надмолекулярных структур очень велико и составляет сутки и месяцы. Примером может служить врлокно, являющееся ориентированным полимером. В обычных условиях его молекулы очень долго не перейдут в равновесное неориентированное состояние; поэтому такие процессы релаксации обычно даже не учитываются. Однако это волокно достаточно упруго, так как при растяжении и сокращении проявляются быстрые релаксационные процессы изменения кон-формаций. [45]
Страницы: 1 2 3 4