Субстрат - тип
Cтраница 3
Эндодинамические сукцессии приводятся в действие особыми законами, механизмы которых до сих пор во многом невыяснены. Известно, что на абсолютно безжизненном субстрате типа песчаных дюн или затвердевшей лавы рано или поздно расцветает жизнь. Первопоселенцами на безжизненном субстрате являются лишайники и корковые водоросли. Далее типы сообществ в данном пространстве последовательно сменяют друг друга, постепенно усложняясь и увеличивая видовое разнообразие, формируя так называемый сукцессионный ряд, состоящий из последовательных стадий, отмечающих смену одного сообщества другим. Завершается все установкой в экосистеме динамического равновесия, когда она меняется очень незначительно. Экосистемы на этой стадии называются климаксными ( от греч. Весь сукцессионный ряд может занять до сотен и даже до тысяч лет, что связано с необходимостью накопления питательного вещества в субстрате. Так, наступление климаксного состояния для южной тайги с момента формирования занимает 90 лет. [31]
Понятие о гетеролитической диссоциации органических соединений существенно шире, чем это следует из представления о реакциях типа SN. Это связано с возможностью существования субстратов типа Е - Y, в которых либо электроположительная уходящая группа Е - несет отрицательный заряд, либо электроотрицательная уходящая группа - Y-положительный заряд, либо заряжены и та и другая. [32]
Эту теорию наиболее широко использовали при рассмотрении реакций, катализируемых химотрипсином. Было постулировано, что для субстратов типа R1CONHCHR2COR3 на ферменте существуют центры связывания pi, р2: ( з, которые взаимодействуют с RI, R2, RS соответственно. В случае хорошего субстрата имеет место правильное попарное соответствие групп субстрата и центров на ферменте; в случае плохого субстрата возникают неправильные взаимодействия, приводящие к непродуктивному связыванию. Хорошо известный факт, что производные D-аминокислот гидролизуются очень медленно или вообще не гидролизуются под действием химотрипсина, хотя их константы связывания очень близки к константам, наблюдаемым для соответствующих ь-субстратов, является, по-видимому, следствием непродуктивного связывания. Можно допустить, что неспецифический субстрат укрепляется на активном центре в нескольких положениях и только некоторые из них ведут к гидролизу. Высокоспецифичный ь-субстрат связывается правильно и быстро претерпевает гидролиз, в то время как соответствующий D-субстрат связывается преимущественно неправильно, так что он почти никогда не находится в положении, обеспечивающем гидролиз. С другой стороны, поскольку трудно объяснить очень низкую скорость гидролиза ацетил-фермента просто малой вероятностью конформации, которая ведет к гидролизу, необходимо допустить, что специфический ь-субстрат может вызвать конформационное изменение фермента, которое облегчает гидролиз за счет правильной ориентации каталитических групп или индуцирования напряжения, в то время как в-субстраты вызывают конформационное изменение, которое затрудняет реакцию. [33]
Аналогичным образом можно определить Кз и / Ci в опытах с использованием аз2 и kai в качестве субстратов и раздельно aai и kaz в качестве ингибиторов. Образование тупикового комплекса между одним из субстратов типа ka и свободным ферментом, хотя и осложняет ситуацию, но существенно не мешает анализу. [34]
За последние годы наблюдается быстрое развитие представлений о механизме функционирования металлоферментов, а именно: удалось установить место и последовательность протекания реакций в активном центре, а также найти ключи к пониманию некоторых механизмов. Важное место занимает гидролиз ( или гидратация) субстратов карбонильного и фосфорильного типа, таких, как СО2, эфиры карбоновых кислот, эфиры и риды фосфорной кислоты и пептиды. По-видимому, не удивления тот факт, что для функционирования большинства таких систем требуется ион двухвалентного металла. [35]
Реакции, катализатором которых служит кислота, зависят от енолиза-ции. Енолы достаточно нуклеофильны для того, чтобы ацилироваться высоко реакционноспособными субстратами типа продуктов присоединения трех-фтористого бора к ангидриду кислоты. [36]
Проведенное рассмотрение показывает, что даже такой плохо реагирующий субстрат, каким является карбоксилат-ион, может реагировать с ферментом в виде более реакционной свободной кислоты, образуя ацилфермент. Гораздо большие спектральные изменения при ацилировании и деацилировании обнаруживают менее специфические субстраты типа производных цинна-моила, фуроила или бензоила, которые также реагируют с химотрипсином, образуя ацилфермент. [37]
Поскольку эта реакция подчиняется правилу Марковни-кова, то только ацетилен приводит к альдегиду. В реакции алкинов типа RC CH почти исключительно получаются метилкетоны, но субстраты типа RC CR обычно приводят к обоим возможным продуктам. [38]
 |
Строение тема и его связь с белком в цитохромер450. [39] |
Другая группа субстратов связывается с геминной группировкой фермента. Эти субстраты имеют спектры различия с максимумом при 420 нм и называются субстратами 2-ого типа. [40]
 |
Строение тема и его связь с белком в цитохромер450. [41] |
При связывании субстрата 2-ого типа с шестой координационной связью железа тема, последнее переходит из высокоспинового в низкоспиновое состояние. Кроме субстратов 1-ого и 2-ого типов, имеются обратные субстраты, при низких концентрациях они подобны субстратам 1-ого типа, а при высоких - 2-ого типа. Некоторые вещества образуют необратимые комплексы с железом цитохрома р45о и это приводит к инактивации фермента. [42]
При реакции между нуклеофилом и элект-рофилом образуется субстрат типа EY. При нуклеофильном или электрофильном замещении происходит замещение электроотрицатель -, ной или электроположительной уходящих групп в субстрате типа EY, соответственно. При гетеролизе субстрат типа EY расщепляется на соответствующие нуклеофил и элект рофил. [43]
В настоящей главе реакции классифицируются на основе природы атакующего атома нуклеофила и порядок рассмотрения следующий: О, S, N, галогены, Н, С. Для данного нуклеофила реакции классифицируются по типу субстратов и по природе уходящей группы. Рассмотрение субстратов алкилыюго типа предшествует обычно обсуждению ацильных производных. Нуклеофильное замещение у атома серы обсуждается в конце главы. [44]
При реакции между нуклеофилом и элект-рофилом образуется субстрат типа EY. При нуклеофильном или электрофильном замещении происходит замещение электроотрицатель -, ной или электроположительной уходящих групп в субстрате типа EY, соответственно. При гетеролизе субстрат типа EY расщепляется на соответствующие нуклеофил и элект рофил. [45]
Страницы: 1 2 3 4