Терминация
Cтраница 3
В эукариотах имеется единственный фактор терминации, называемый RF. Его мономерная форма имеет молекулярную массу около 50000 - 60000 дальтон, но, по-видимому, он обычно присутствует в виде димера с молекулярной массой около 120000 дальтон. RF способен узнавать все три терминирующих кодона ( UAA, UAG и UGA), взаимодействует с ГТФ и вместе с рибосомой проявляет ГТФазную активность. [31]
Уже говорилось, что факторы терминации узнают терминирующий кодон, установленный именно в А-участке рибосомы. Прежде всего, кодонзависимое связывание RF возможно только после транслокации пептидил-т РНК из А-участка в Р - участок. В экспериментах in vitro можно прямо связать триплет AUG и инициатор-ную F-Met - tRNA с Р - участком вакантной рибосомы, а затем добавить RF и триплет UAA ( или UAG, или UGA); последние связываются и индуцируют гидролиз F-Met - tRNA в Р - участке с освобождением свободного формилметионина. Довольно очевидно, что в указанном случае терминирующий триплет и RF попадают в вакантный А-участок. Тот факт, что супрессорная аминоацил-т РНК с EF-TU и ГТФ, несущая антикодон, комплементарный терминирующему кодону, конкурирует с RF в процессе трансляции, тоже говорит об А-участке как месте связывания RF. Такие ингибиторы А-участка рибосомы, как тетрациклин и стрептомицин, ингибируют кодонзависимое связывание факторов терминации с рибосомой. EF-G, стабильно связанный с рибосомой ( например, в присутствии фусидовой кислоты), мешает как связыванию комплекса Aa - tRNA EF-TU GTP, так и RF с рибосомой. Белок прокариотической рибосомы L7 / L12, образующий боковой стержень на 50S субчастице, способствует как связыванию факторов элонгации, так и RF. Данные по ингибированию кодонзависимого связывания RF антителами к индивидуальным рибосомным белкам подтверждают, что место связывания RF сильно перекрывается одновременно с А-участком и участком связывания факторов элонгации. [32]
Фактор инициации IF-2 и фактор терминации RF тоже конкурируют как с EF-TU, так и с EF-G за место посадки. [34]
РНК, а ускоряет их терминацию, дестабилизуя транскрипционный комплекс. [35]
Возможно, что кодонзависимое связывание фактора терминации каким-то образом делает пептидилтрансферазный центр рибосомы просто доступным для воды, которая является для него хорошим субстратом; в результате перенос пептида происходит на воду, тем более что конкурирующая аминогруппа аминоацил-т РНК в данной ситуации отсутствует. Например, это могло бы быть достигнуто в результате некоторого раздвигания рибосомных субчастиц или легкого раскрывания ( разрыхления) большой субчастицы, несущей пептидилтрансферазный центр. [36]
В прокариотах имеются три белка, участвующих в терминации и обозначаемых как RF-1, RF-2 и RF-3. [37]
Помимо смены промоторов на поздней стадии меняется и эффективность терминации. Поздние мРНК в среднем заметно длиннее ранних и весьма гетерогенны по длине. Частично эта гетерогенность связана с неэффективной терминацией, а частично обусловлена посттранскрипционными изменениями. Так, к 5 -концу транскрипта данного позднего гена могут быть присоединены нуклеотидные последовательности [ в том числе и поли ( А) ], происходящие из транскриптов других ( в том числе и весьма далеко расположенных) генов. [38]
Взаимодействуя с, терминирующим кодоном и рибосомой, факторы терминации ( RF-1 и RF-2 прокариот или RF эукариот) как бы имитируют посадку аминоацил-т РНК в А-участок транслирующей рибосомы. Однако вместо последующей атаки сложноэфирной связи пептидил-т РНК аминогруппой аминоацил-т РНК имеет место атака той же связи молекулой воды. [39]
Помимо смены промоторов на поздней стадии меняется и эффективность терминации. Поздние мРНК в среднем заметно длиннее ранних и весьма гетерогенны по длине. Частично эта гетерогенность связана с неэффективной терминацией, а частично обусловлена посттранскрипционными изменениями. Так, к 5 -концу транскрип-та данного позднего гена могут быть присоединены нуклеотидные последовательности [ в том числе и поли ( А) ], происходящие из транскриптов других ( в том числе и весьма далеко расположенных) генов. [40]
Помимо смены промоторов на поздней стадии меняется и эффективность терминации. Поздние мРНК в среднем заметно длиннее ранних и весьма гетерогенны по длине. Частично эта гетерогенность связана с неэффективной терминацией, а частично обусловлена посттранскрипционными изменениями. Так, к 5 -концу транскрипта данного позднего гена могут быть присоединены нуклеотидные последовательности [ в том числе и поли ( А) ], происходящие из транскриптов других ( в том числе и весьма далеко расположенных) генов. [41]
Здесь К1п - константа инициации, к - константа терминации; со-состояние свободной рибосомы, не ассоциированной с мРНК; - состояние, в котором рибосома транслирует J - й кодон; W-длина транслируемой части мРНК в кодонах. [42]
Транскрипция РНК протекает в три стадии: инициация, элонгация и терминация. [43]
В норме в клетках отсутствуют тРНК с антикодона-ми, комплементарными сигналам терминации. При связывании фактора освобождения с рибосомой происходит гидролиз связи между последней тРНК и полипептидом, свободная тРНК, полипептидная цепь и мРНК отсоединяются от рибосомы. Рибосома диссоциирует на субъединицы, которые могут вновь участвовать в трансляции. [45]
Страницы: 1 2 3 4