Топоизомераза
Cтраница 3
Теминым ( США) открыта ревертаза - фермент, синтезирующий ДНК и позднее еще целые классы ферментов, работающих на ДНК, и в том числе рестриктазы, узнающие последовательности нуклеотидов в ДНК, и топоизомеразы, ответственные за топохимические свойства ДНК. [31]
Экспериментальная зависимость дисперсии распределения по числу зацеплений нитей кольцевой ДНК от числа сегментов в цепи ДНК приведена на рис. 4.10. В отличие от топоизомераз типа 1, которые разрывают и воссоединяют только одну из нитей двойной спирали, существуют топоизомеразы типа 2, которые рвут и сшивают сразу обе нити молекул ДНК. [32]
Все эти проблемы разрешаются прц. Способность бактериальной топоизомеразы II - ДНК-гиразы - отрицательно сверхспирализовать ДНК в АТР-зависимой реакции не только снимает вопрос о вращении всей непрореплицировавшейся части ДНК, но и облегчает действие хеликаз, поскольку отрицательная сверхспирализация, которую гираза создает перед вилкой, способствует расплетанию ДНК. [33]
Все эти проблемы разрешаются присутствием в клетке топоизомераз ( см. гл. Способность бактериальной топоизомеразы II - ДНК-гиразы - отрицательно сверхспирализовать ДНК в АТР-зависимой реакции не только снимает вопрос о вращении всей непрореплицировавшейся части ДНК, но и облегчает действие хеликаз, поскольку отрицательная сверхспирализация, которую гираза создает перед вилкой, способствует расплетанию ДНК. [34]
Все эти проблемы разрешаются присутствием в клетке топоизомераз ( см. гл. Способность бактериальной топоизомеразы II - ДНК-гиразы - отрицательно сверхспирализовать ДНК в АТР-зависимой реакции не только снимает вопрос о вращении всей непрореплицировавшейся части ДНК, но и облегчает действие хеликаз, поскольку отрицательная сверхспирализация, которую гираза создает перед вилкой, способствует расплетанию ДНК. [35]
Это не означает, что действие фермента не сопровождается никакими химическими превращениями. Во-первых, топоизомераза II требует для своей работы затраты энергии, а создание супервитков сопровождается гидролизом АТФ, т.е. фермент является АТФазой. Во-вторых, детальный механизм ее действия включает введение разрыва в одну из полинуклеотидных цепей и воссоединение разорванных фрагментов после их перемещения относительно второй цепи, приводящего к возникновению супервитка. [36]
По-видимому, правы были те, кто занял выжидательную позицию. Похоже, что топоизомеразы решают все подобные проблемы. Во всяком случае, они способны сог-дать в клетке такие условия, при которых нити и впрямь как бы туннелируют друг сквозь друга. Как все это происходит реально в клетке - еще предстоит выяснить. Пока ясно одно - основной аргумент критиков двойной спирали, которым они пользовались многие годы, потерял силу. [37]
Производные 4-хинолон - З - карбоновой к-ты-хиноло-ны имеют широкий спектр антимикробного действия; их степень активности зависит от хим. структуры. В микробной клетке ингибируют топоизомеразы и синтез ДНК. Высокой активностью и наиб, широким спектром действия обладают 6-фторхинолоны, напр, ципрофлоксацин ( II), офлоксацин ( III), пефлоксацин ( 1У) - бесцв. Эти в-ва особенно важны при лечении инфекций, вызванных штаммами, устойчивыми к др. лек. Однако они отрицательно влияют на рост хрящевой ткани, поэтому в педиатрич. [38]
Способность белков образовывать узлы вызвала большой интерес. Прежде всего, она позволила понять, как работают топоизомеразы и, в частности, важнейший фермент этого класса - гираза. Ведь завязать кольцевую замкнутую ДНК в узел невозможно, не разорвав двойную спираль. Но мало просто разорвать цепь. Нужно еще протащить через образовавшуюся щель другую часть молекулы, а потом заделать щель. [39]
В отличие от топоизомераз-I, меняющих Lk ДНК на любое целое число, топоизомеразы - П меняют Lk только на четное число. [40]
Эти ферменты принимают участие в формировании пространственной структуры ДНК бактерий при ее репликации. При этом ДНК-гираза катализирует расплетение нитей ДНК ( отрицательную суперспирализацию), а топоизомераза IV влияет на разъединение ( декатенацию) замкнутых кольцевых молекул ДНК. [41]
Связывается топоизомераза, скорее всего, со спиральными участками, раскусывает одну нить, после чего вокруг целой нити может начаться свободное вращение одной части молекулы относительно другой. При этом снимается внутреннее напряжение - происходит релаксация. Далее топоизомераза вновь сшивает разорванную нить, закрепляя новое состояние молекулы. [42]
Открытие топоизомераз заставило усомниться в том, что сверхспирализация никчемна в биологическом смысле. Ведь, если есть ферменты, меняющие топологию, то, значит, сама топология клетке не совсем безразлична. [43]
Имеются различия и в состоянии ДНК транскрибируемых и нетранскрибируемых участков генома. Так, неактивная в транскрипции ДНК в большей мере метилирована, в то время как содержание 5-метилцитозина существенно меньше в транскрибируемых генах и особенно в их регуляторных последовательностях. При действии топоизомеразы I на неактивный хроматин количество супервитков не меняется, что свидетельствует о том, что эта ДНК находится в релаксированном состоянии, в ней нет торзионных напряжений, которые бы снимались под действием топоизомеразы I. Возможно, что в активном хроматине возникают такие торзионные напряжения, которые облегчают связывание регуляторных белков и работу РНК-полимер азы. [44]
Страницы: 1 2 3 4