Дезоксигуанозин

Cтраница 3

Существуют две преимущественные конформаций ( анты и сын) для вращения вокруг гликозидной связи, соединяющей атом N9 пурина ( или NI пиримидина) с атомом d рибозы. Лнгы-кон-формация отвечает наиболее растянутой форме нуклеотида и встречается в большинстве исследованных нуклеотидов и нуклео-зидов, а также в полинуклеотидах. Сын-конформация обнаружена в кристаллах дезоксигуанозина и в некоторых минорных нуклеотидах, встречающихся в тРНК - Стерически разрешенные области значений угла х ( см. рис. 8.3) разнятся для Cz-эндо - и Сз-эндо-конформаций сахара. [31]

Исходный стандартный раствор может храниться по крайней мере 6 месяцев, а рабочие растворы - не более 3 недель. Для точных измерений концентрацию ДНК в стандарте следует определять по фосфору. В качестве стандартов удобно использовать также дезоксирибо-зу, дезоксиаденозин, дезоксигуанозин или пуриновые монодезоксинуклео-тиды. Скорость развития окраски для разных соединений различна. Исключение составляют те случаи, когда образец, в котором определяют концентрацию ДНК, а следовательно и стандарт обработаны кислотой; при этом окраска достигает максимальной интенсивности примерно за 7 час. [32]

В некоторых случаях, однако, в качестве побочных продуктов удается выделить и О-метильные производные, возникающие за счет замещения у экзоциклического атома кислорода. При метилировании уридина и тимидина такие продукты не обнаружены, но для некоторых производных этих соединений, например для 1 - ( р - /) - арабинофуранозил) - 5-фторурацила 112, они были выделены. При метилировании дезоксигуанозина диазо-метаном в эфире одним из продуктов реакции является 2-амино - 6-метокси - 9 - ( р - Ь-2 - дезоксирибофуранозил) - пурин из. [33]

Идеализированная схема секвени-рования ДНК в геле и определенная последовательность. [34]

На третьем этапе проводится электрофорез всех четырех проб в полиакрила-мидном геле. Для того чтобы условия разделения были идентичными во всех четырех пробах, пробы наносят на один гель и разделяют на четырех параллельных дорожках этого геля. Разделение, как уже говорилось в § 7.1, проходит по длине, и положение каждого фрагмента, детектируемое радиоавтографически, дает его длину, а тем самым и положение соответствующего мономера в исходной цепи. Таким образом, на одной дорожке, если речь идет о ДНК-фрагменте, определяется положение всех остатков тимидина, на другой - всех остатков дезокси-цитидина, на третьей - всех остатков дезоксигуанозина и на четвертой - всех остатков дезоксиаденозина. В сумме это дает положение в исходном полинуклео-тиде всех мономеров, а это и означает, что определяется его первичная структура. Эта структура в один прием считывается с геля, причем при достаточной длине дорожки геля одновременно может быть определено расположение сотен мономерных звеньев. [35]

При соединении пуринового или пиримидинового основания с рибозой или дезоксирибозой образуются соответствующие нуклеозиды. Присоединение углеводов к азотистым основаниям в обоих типах нуклеиновых кислот осуществляется через гликозидную связь, и, таким образом, нуклеозиды являются гликозидами пуриновых и пиримидиновых оснований. В этих соединениях гликозидная связь возникает между первым углеродным атомом рибозы или дезоксирибозы и азотом пуринового основания в девятом положении или азотом пиримидинового основания в третьем положении. При соединении адени-на с рибозой образуется аденозин, гуанин дает гуанозин, цитозин - ц и т и д и н, а урацил - уридин. При соединении с дезоксирибозой образующиеся нуклеозиды соответственно носят названия дезоксиаденозин, дезоксигуанозин, дезоксицитидин, а тимин, соединяясь с дезоксирибозой, дает тимидин. [36]

Комплементарные взаимодейст - системе ферментов репарации ДНК-по. [37]

Система репарации не является абсолютно совершенной, и с некоторой частотой возникают наследуемые изменения в структуре ДНК, подобно описанным при рассмотрении действия азотистой кислоты. Вещества, способствующие возникновению мутаций, называют мутагенами. В качестве еще одного примера мутагена можно привести 5-бромдезокси-уридин ( рис. 45), который, будучи добавлен в среду для выращивания микроорганизмов или эукариотических клеток или при введении в живые организмы, может превращаться под действием ферментов в соответствующий нуклеотид и участвовать в процессе репликации. У бромдезоксиуридина по сравнению с ури-дином и тимином таутомерное равновесие между кето - и гидроксиформами в значительно большей мере смещено в сторону последней, хотя кетоформа остается доминирующей. Как видно из рис. 45, кетоформа сохраняет сродство к адени-ну, поэтому фрагменты бромдезоксиуридина преимущественно включаются в участки, на которых должен находиться дезокситимидин. Однако получающиеся матрицы из-за повышенного содержания гидрокситаутомера при участии в построении комплементарной цепи могут способствовать отбору в точке нахождения фрагмента бромдезоксиуридина не аденилового, а гуанилового нуклеотида. При последующем цикле репликации цепь, содержащая фрагмент дезоксигуанозина, будет способствовать отбору цитидилового нуклеотида, в результате чего образуется пара G-C. На схеме также показано, что с определенной вероятностью остаток дезоксигуанозина может отобрать не цитидиловый, а бромдезоксиуридиловый нуклеотид. [38]

Страницы: 1 2 3