Конформация - белок
Cтраница 3
Рентгенограммы комплексов ДНК с полилизином или полиаргинином аналогичны рентгенограммам, получаемым для головок сперматозоидов. По-видимому, конформация белка, находящегося в комплексе с ДНК, определяется структурой ДНК в отличие от комплексов РНК - белок, в которых структура РНК определяется конформацией белка. [31]
Большинство исследований, описанных выше, было выполнено на частично гидратированных порошках белка или пленках. Необходимо сравнить конформации белка в этом состоянии и в растворе. [32]
Мы убедились также в том, что локальные изменения в структуре белка ( разд. Более отдаленные изменения конформации белка, наблюдаемые на проксимальной стороне порфирина в гемоглобине, по-видимому, связаны ( или запускаются) со смещением железа по нормали к плоскости порфиринового кольца. В пентакоординационном комплексе Fe11, например, атом железа смещен примерно на 75 пм от плоскости в сторону гистидинового лиганда. Степень смещения центрального атома зависит от ионного радиуса металла ( а следовательно, от степени окисления и в еще большей мере от спинового состояния), от прочности связи с аксиальным лигандом и возмущающего влияния со стороны белка. [33]
Таким образом, мы ограничимся обсуждением координационной химии тех белков, для которых на основе рентгеноструктурного анализа высокого разрешения получено детальное описание структуры и стереохимии вероятных металл-лигандных центров. Другие аспекты структуры и конформации белков обсуждаются в цитируемых работах. [34]
На основании этих данных можно полагать, что анионный центр активной поверхности холинэстераз выполняет не только якорную функцию при взаимодействии с катионной головкой ацетилхолина ( см. также стр. Это взаимодействие сопровождается изменениями конформации белка в районе активного центра в направлении, благоприятствующем образованию других связей с молекулой субстрата, необходимых для каталитического эффекта. [35]
 |
Спектры ЭПР НЬ ( СО4 ( сплошные линии и метгемоглобина. [36] |
Изучение зависимости Ж от t позволяет исследовать конформационные изменения в макромолекулах. Установлено, что метка чувствует две конформации белка при его оксигена - Ции. Варьируя метки, удалось показать наличие локальной области в молекуле НЬ, имеющей структуру, которая зависит от состояния оксигенации более чем одного тема. [37]
Реже предполагается, что такие изменения обусловлены конформационными факторами, несмотря на то что по сравнению с нативными ферментами устойчивость аффинных лиганов к тепловой инактивации или денатурирующим агентам явно указывает на конформационные изменения или предрасположенность к таковым в результате связывания фермента с носителем. Среди различных физико-химических методов, разработанных для исследования конформации белков в растворе, наиболее легко приложимым для конформационных исследований иммобилизованных белков является, по-видимому, флуоресцентный метод, для которого и интенсивность, и характер спектра зависят от окружения флуоресцирующих групп и реагируют на изменения этого окружения. [38]
В этой главе рассмотрены пути подхода к решению задачи предсказания пространственной структуры белка. В то же время определенное внимание будет уделено интерпретации конформаций реальных белков в свете теории ближайших взаимодействий и возможности обобщения полученных результатов на структуру белка в целом. [39]
Знак эффекта изменяется на противоположный, если вместо поли - Ь - глутаминовой кислоты использовать поли - В-глутаминовую кислоту. Исследования, проводимые в этом направлении, помогут связать конформацию белков и их конформационные переходы с биологической активностью белков. [40]
Вышеупомянутый остов - это не что иное, как цепь с боковыми цепями аминокислот. Поэтому молекула субстрата может меняться в пределах, предопределяемых конформацией белка. [41]
Спектроскопические методы, и особенно методы ДОВ и КД, несомненно играют важную роль в изучении биополимеров. Поскольку в настоящее время имеются монографии и обзорные статьи по конформации белков, по нуклеопротеинам, рибосомам, вирусам, липопротеинам, мембранам и другим макромолекулам [17-21, 433, 563, 587, 594], в этой книге будут упомянуты только наиболее важные положения и некоторые результаты, полученные недавно. [42]
Трудность в интерпретации таких изотопных эффектов заключаются в том, что они могут быть результатом незначительных обратимых конформационных изменений фермента, которые возникают при замене обычной воды как растворителя на окись дейтерия. Хотя удалось показать, что большие или необратимые изменения в конформации белка [84] при такой замене растворителя не происходят, возможность существования небольших или обратимых эффектов означает, что наличие изотопного эффекта дейтерия может служить лишь указанием на возможность, а не доказательством существования общеосновного катализа в ферментативной реакции. Это справедливо как для третичных аминов, так и для первичных и вторичных и означает, что удаление протона от нуклеофильного реагента в переходном состоянии не имеет существенного значения и что действие электронооттягивающих заместителей проявляется в уменьшении нуклеофильной способности за счет уменьшения электронной плотности на реакционном центре. С другой стороны, реакция спиртов с эфирами при нейтральных значениях рН обнаруживает обратную чувствительность к заместителям, а именно увеличение реакционной способности при повышении кислотности спирта. [43]
Протонная помпа в хлоропластах может играть по крайней мере троякую роль. Во-первых, за счет изменения рН внутри хлоропластов могут происходить изменения конформации белков ламелл и растворимых белков, что должно отразиться на их функциях. Во-вторых, сильное повышение концентрации протонов в хлоропластах приводит к изменениям в обмене ионов ( катионов и анионов) с окружающей средой. [44]
Сохранение нативной конформации белковой молекулы - обязательное условие ее специфического функционирования Г Конформация белка - это термин более широкий, чем термин структура белка. Первый используется тогда, когда имеют в виду одновременно вторичную и третичную структуру полипептидной цепи. При заданных физиологических условиях конформация белка является энергетически наиболее выгодной, такой, которая характеризуется минимальной свободной энергией. [45]
Страницы: 1 2 3 4