Атом-атом
Cтраница 2
 |
Рибозофосфатная ница в конформацпонных метрах Э, и со. [16] |
Индийские авторы [28] исследовали методом атом-атом потенциалов конформаций дннуклеозидфосфата, представляющего собой два нуклеозидных остатка, соединенные фосфорноэфирными связями. Конформационная карта ( ф, г з), согласно их расчету, имеет семь сравнимых по глубине минимумов, причем выбор глобального минимума практически полностью определяется параметризацией - выбором парциальных зарядов, постоянной к и имманентных потенциалов связей Р - О. [17]
Разумеется, трудно ожидать, что атом-атом потенциалы объяснят все тонкости, связанные с конформацией олиго - и полинуклео-тидов в растворах; наибольшие затруднения, естественно, возникнут при учете гидрофобных взаимодействий и конфигурационной энтропии. Поэтому в ряде случаев более грубые модели, в частности комбинаторные, могут иметь больший успех. [18]
Выше мы подробно рассмотрели применение схемы атом-атом потенциалов к вычислению оптимальной геометрии молекул и энтальпий атомизации. [19]
Атактические ( нерегулярные) полимеры 317 Атом-атом взаимодействия модели 96 - 99 Атом-атом потенциалы 68 ел. [20]
Мы рассмотрели далеко не все известные в литературе атом-атом потенциалы и не все методы их определения и уточнения. Можно ли дать рекомендации относительно того, какие потенциалы лучше всего использовать в расчетах конформаций органических молекул. По-видимому, нет; категорические рекомендации пока еще представляются преждевременными. [21]
В этой и последующих главах рассмотрено приложение схемы атом-атом потенциалов к макромолекулам - синтетическим и природным. Там, где это возможно, приведены и результаты квантово-механических расчетов. [22]
Кроме параметров элементарной ячейки и энергии решетки, метод атом-атом потенциалов дает возможность вычислить все термодинамические функции, тензор упругости, частоты колебаний решетки и ряд других важных характеристик органических кристаллов. [23]
Добавив энергию электростатических взаимодействий к энергии напряжения, вычисляемой с помощью атом-атом потенциалов, получим для U ( a) и dU / da кривые, показанные на рис. 2.2 пунктиром. [24]
Атактические ( нерегулярные) полимеры 317 Атом-атом взаимодействия модели 96 - 99 Атом-атом потенциалы 68 ел. [25]
К сожалению, ограниченный объем книги не позволяет нам проанализировать возможности применения атом-атом потенциалов в этой области науки. [26]
В работе [174] термодинамические свойства воды вычислялись с помощью метода Монте-Карло на основе атом-атом потенциалов Китайгородского. [27]
На рис. 8.3 приведена конформационная карта метиламида N-ацетилглицина [47], рассчитанная с использованием атом-атом потенциалов. При построении этой карты вместо параметров Полин-га - Кори были использованы валентные углы, найденные минимизацией потенциальных функций по независимым гео метрическим параметрам. [29]
Помимо критерия допустимых контактов в конформационном анализе ди - и полисахаридов широко использовались и атом-атом потенциалы. [30]
Страницы: 1 2 3 4