Олигонуклеотида

Cтраница 2

Одноцепочечные олигонуклеотиды из - 17 - 24 звеньев используют в качестве прай-меров при секвенировании ДНК и проведении ПЦР. [16]

Химический синтез олигонуклеотидных праймеров, содержащих в определенных сайтах разные нуклеотиды. В данном случае в сосуде с G-фосфо-рамидитом ( 94 % содержатся также фосфорамидиты А ( 2 %, С ( 2 % и Т ( 2 %, так что в результате реакции образуется смесь олигонуклеотидов, в которых в тех сайтах, где должен находиться G, присутствуют А, С или Т. [17]

Частично вырожденные олигонуклеотиды могут быть встроены в ген-мишень разными способами. Один из подходов состоит в следующем. [18]

Олигонуклеотид, олигомер ( Oligonucleotide) Короткий ( 6 - 10 нуклеотидов) сегмент одноцепочечной ДНК. [19]

Олигонуклеотид с З - концевой фосфатной группой может резко увеличивать скорость ферментативной полимеризации, не включаясь в состав продукта реакции и не влияя на последовательность мономеров в нем. В этом случае говорят, что олигонуклеотид действует как инициатор. Механизм действия инициаторов не выяснен; единственный надежно доказанный случай такого функционирования олигонуклеотида - реакция, катализируемая поли-нуклеотидфосфорилазой. [20]

Олигонуклеотид A-C-C-G - является единственным продуктом TI - РНК-азного гидролиза, который начинается с А-С - и эта же последовательность имеется на 5-конце фрагмента, содержащего 3-конец 5S РНК, что позволяет сделать вывод о перекрывающейся последовательности между средним и 3 -концевым фрагментами. [21]

Олигонуклеотид неизвестной структуры расщепляется двумя способами: Хи Y, различающимися по специфичности. При расщеплении по способу X образуются три олиго-нуклеотида, а по способу Y - два. Структуры всех полученных фрагментов устанавливаются соответствующим методом. Далее проводится сопоставление структур олигонуклеотидов Y со структурами X с целью нахождения частично совпадающих ( перекрывающихся) последовательностей и реконструкции таким образом исходной цепи. Поскольку каждый полученный олигонуклеотид представляет собой блок, из суммы которых строится исходная структура, метод называется методом перекрывающихся блоков. [22]

Олигонуклеотидами называют полимеры, в которых несколько нуклеозидов ( до 20) соединены друг с другом фосфодиэфирными связями; более длинные цепи называют полину клеот идами. [23]

Некоторые олигонуклеотиды наиболее удобно получать расщеплением соответствующих полимеров. Это относится к гомогенным олигорибонуклеотидам. Xp) nYp, которые легко получить, расщепляя продукт полимеризации ррХ и ppY ( под действием полинуклеотидфосфорилазы) нуклеазой, специфичной к остатку Yp. [24]

Такие олигонуклеотиды гидролизуются ядом гремучей змеи намного легче, чем аналогичные соединения, содержащие концевой 2 - или З - моноэтерифицированный фосфат. Удаление этого концевого фосфата приводит к ряду соединений, члены которого имеют формулу ( нуклеозид) п ( фосфат) -, и при щелочном гидролизе которых получаются нуклеозид-2 ( 3) - фосфат и концевой нуклеозид. [25]

Фингерпринт олигонуклеотидной смеси на хро-матографической бумаге. В одном направлении проводили электрофорез при низком значении рН, в другом - хроматографию в смешанном водноорганическом растворителе. Данный фингерпринт описан Рушицким и Собе-ром ( Rushizky, Sober, 1962. Некоторые олигонук-леотиды были идентифицированы следующим образом. [26]

Обычно олигонуклеотиды разделяются лучше, когда в одном из направлений ведут электрофорез, по-видимому, вследствие возможности лучшего контроля за состоянием ионизации оснований. [27]

Многие олигонуклеотиды можно быстро идентифицировать единственно на основании их положения на двумерной электрофореграмме, или фингерпринге. [28]

Положение олигонуклеотида на двумерной электрофореграмме определяется в основном его составом. [29]

Эти низшие олигонуклеотиды ( вплоть до пентануклеотида), как было показано, являются членами гомологического ряда линейных полимеров, содержащих нуклеотиды, связанные 2 - 5 - и 3 - 5 -фосфоди-эфирными связями и оканчивающиеся 2: 3 -циклическим фосфатом. [30]

Страницы: 1 2 3 4 5