Участка - связывание
Cтраница 3
Участки связывания БАК в разных промоторах не идентичны по нуклеотидной последовательности, но проявляют значительное сходство друг с другом. Эти участки в разных промоторах располагаются по-разному относительно стартовых точек транскриптов, которые стимулируются БАК В промоторе галактозного оперона участок связывания БАК непосредственно прилегает к участку связывания РНК-полимеразы. Рядом располагается второй участок связывания БАК; с ним БАК связывается только в том случае, если на промоторе уже находится РНК-полимераза и БАК на первом участке. В промоторе лактозного оперона имеется только один участок связывания БАК, ориентированный относительно участка связывания РНК-полимеразы точно так же, как второй участок связывания БАК в галактозном промоторе. В промоторах мальтозных и арабинозного оперонов, между участками связываний БАК и участками связывания РНК-полимеразы, располагаются участки связывания белков-активаторов этих оперонов, кодируемых генами malT и агаС соответственно. [31]
Участки связывания БАК в разных промоторах не идентичны по нуклеотидной последовательности, но проявляют значительное сходство друг с другом. Эти участки в разных промоторах располагаются по-разному относительно стартовых точек транскриптов, которые стимулируются БАК - В промоторе галактозного оперона участок связывания БАК непосредственно прилегает к участку связывания РНК-полимеразы. Рядом располагается второй участок связывания БАК; с ним БАК связывается только в том случае, если на промоторе уже находится РНК-полимераза и БАК на первом участке. В промоторе лактозного оперона имеется только один участок связывания БАК, ориентированный относительно участка связывания РНК-полимеразы точно так же, как второй участок связывания БАК в галактозном промоторе. В промоторах мальтозных и арабинозного оперонов, между участками связывания БАК и участками связывания РНК-полимеразы, располагаются участки связывания белков-активаторов этих оперонов, кодируемых генами та. [32]
Участки связывания БАК в разных промоторах не идентичны по нуклеотидной последовательности, но проявляют значительное сходство друг с другом. Эти участки в разных промоторах располагаются по-разному относительно стартовых точек транскриптов, которые стимулируются БАК - В промоторе галактозного оперона участок связывания БАК непосредственно прилегает к участку связывания РНК-полимеразы. Рядом располагается второй участок связывания БАК; с ним БАК связывается только в том случае, если на промоторе уже находится РНК-полимераза и БАК на первом участке. В промоторе лактозного оперона имеется только один участок связывания БАК, ориентированный относительно участка связывания РНК-полимеразы точно так же, как второй участок связывания БАК в галактозном промоторе. В промоторах мальтозных и арабинозного оперонов, между участками связывания БАК и участками связывания РНК-полимеразы, располагаются участки связывания белков-активаторов этих оперонов, кодируемых генами malT и агаС соответственно. [33]
Антибактериальные макролиды обладают бактериостатическим действием, хотя при больших концентрациях и могут вызывать гибель чувствительных клеток. Все они связываются с 50S субчастицами 70S рибосом а соотношении 1: 1 и совершенно не реагируют с 80S рибосомами эукариотов. Участки связывания эритромицина и хлора мфе ни кола частично перекрываются. Детальные исследования показали, что эритромицин, по-видимому, взаимодействует с белком LI5, который находится иа Р - центре рибосомы и модулирует пептидилтраисферазную активность белка L16, способного специфически связываться с хлора мфе ииколом. Вероятно, эритромицин препятствует правильному взаимодействию пептидил-т РНК с донорным участком во время траислокации. Ои обычно связывается с рибосомами, содержащими короткие пептиды или уже освободившимися от них, и буквально замораживает полисомы, останавливая биосинтез белка. [34]
Таким образом, ионные каналы непосредственно участвуют в передаче сигнала возбудимыми клетками. Существуют хемовозбу-димые ( рецепторы ацетилхолина, у-аминомасляной кислоты, глута-мата, глицина и др.) и электровозбудимые ( натриевые, калиевые, кальциевые, хлорные и др.) каналы. В эти транспортные системы входят участки связывания нейромедиаторов или сенсоры изменения силы электрического поля мембраны, а также непосредственно ионные поры, образованные несколькими транс мембранными белковыми фрагментами. [35]
В некоторых исследованиях [ ПО, 111 ] сделана попытка сопоставить процессы связывания бенздиазепинов специфическими рецепторами в мозге животных с медиа-горными функциями ряда веществ, в частности ГАМК. Показано, что ГАМК в зависимости от концентрации усиливает сродство 8Н - флунитразепама к рецепторам, но существенно не влияет на коэффициент связывания. Следовательно, ГАМК не взаимодействует непосредственно с участками связывания препарата, но может увеличивать сродство путем изменения конфор-мации рецептора, либо снижать синтез или высвобождением эндогенного лиганда, конкурирующего с флунитразепамом за рецептор-ные участки. [36]
Присутствие некоторых низкомолекулярных Сахаров оказывает ин-гибирующее действие на реакцию между конканавалином А и вышеупомянутыми полисахаридами. Оказалось, что минимальным требованием к структуре сахарного остатка, необходимым для взаимодействия с ним белка, является наличие незамещенных гид-роксильных групп при С-3, С-4 и С-6 а-о-манно - или а-гглюкопираноз-ного кольца. На примере гомологического ряда мальтодекстринов и изомальтодекстринов [25] нами было показано, что участки связывания конканавалина А специфичны по отношению к терминальному невосстанавливающему моносахаридному остатку; причем а-конфигура-ция гликозидной связи последнего является явно предпочтительной. [37]
Эта изменчивость в центрах связывания субстрата дает возможность полагать, что семейство сериновых протеиназ возникло в процессе эволюции от общего предка и относительно недавно. В некоторых случаях такие ферменты, включая лактат -, малат - и глицеральдегид-3 - фосфат-дегидрогеназы, имеют очень близкие трехмерные структуры в участках связывания кофермента, в то время как другие участки структуры совершенно различны. Этот участок связывания ди-нуклеотида присутствует в широко варьируемых участках первичной структуры этих ферментов и состоит из двух очень близких звеньев связывания мононуклеотида, одно из которых специфично к адениновой половине кофермента. Гораздо большее число ферментов катализирует реакции адениновых нуклеотидов, AMP, ADP и АТР ( см. гл. [38]
Определение концентрации субъединиц, одновременно занятых двумя лигандами, которые не влияют на связывание друг друга с белком. В предыдущем подразделе было описано взаимодействие лиганда с тетрамерным белком в равновесной системе ( с. Анализ связывания второго лиганда в таких условиях основывается на следующих предпосылках, которые выполняются в случае взаимодействия ЛДГ с аурамином О и с НАД: 1) все участки связывания аура-мина О идентичны и независимы друг от друга; 2) все активные центры ЛДГ идентично и независимо связывают НАД; 3) взаимодействие ЛДГ с аурамином О не влияет на связывание НАД и наоборот. [39]
Были использованы различные подходы и методические приемы. Так, при химико-фармакологическом подходе путем сопоставления химической структуры ли-гаидов с их фармакологической активностью удалось показать, что молекулы катехоламинов имеют несколько существенных функциональных групп: пирокатехиповое ядро с мета-гидроксилом, аминогруппу ( протонирован-ную при физиологических значениях рН) и спиртовой гидроксил. Следовательно, на адренорецепторе, исходя из принципа комплементарности активного центра рецептора к молекуле адреномиметика, имеются вступающие во взаимодействие с вышеуказанными группами области: арилофильная, нуклеофильная, участки связывания - гидрокснльной группы н гндроксильных групп пирокатехннового ядра [ Triggle D. J., Triggle С. Обобщая многочисленные литературные и собственные данные, полученные при изучении механизма действия - галоидалкиламинов, в частности дибенамина, И. В. Комиссаров и И. И. Абрамец ( 1977) так представляют структуру активного центра ai - адренорецептора: арадренорецептор - это белок, полипептидные цепи которого включают аминокислоты 1-аргинин и цнстеин. [40]
 |
Структура молекулы иммуноглобулина G. [41] |
Тяжелые ( Н) цепи состоят из 440, а легкие ( L) - из 220 аминокислотных остатков. Каждая цепь имеет константные и вариабельные области. Вариабельные области локализованы на JV-концах обеих цепей, и именно они образуют участок связывания антигена. Разные варианты аминокислотных последовательностей в участке связывания антигена обусловливают структурное разнообразие сайтов взаимодействия с антигенами. [42]
Физиологически рецепторы функционируют как регулятор-ные белки. Число, сродство и активность рецепторов находятся под контролем различных механизмов регуляции. Они также являются местом действия многочисленных экзогенных эффекторов, а именно лекарств и токсинов. Некоторые, так называемые рецепторы, особенно участки связывания лекарств, могут быть в действительности регуляторными связывающими центрами или субъединицами истинных комплексов нейромедиатор - рецептор. Таким образом, мягкие транквилизаторы, бенздиазепины и барбитураты, которые усиливают ингибиторное действие GABA-эр-гических нейронов, по-видимому, действуют путем стимуляции связывания GABA с ее рецептором. [43]
При токсических дозах свинец в печени, почках и селезенке частично связывается с ферритином и нерастворимым гидрок-сидом железа. Происходит ли аналогичное связывание в норме, неизвестно [ Russel H. В мозге свинец концентрируется в сером веществе и базальных ганглиях [ Klein M. Внутри нервных клеток этот МЭ локализуется преимущественно в митохондриях, занимая, по-видимому, участки связывания кальция. В норме у человека более 20 % свинца находится в скелете. Из них около 70 % приходится на трубчатые кости. Свинец откладывается в кости сперва в легкорастворимой форме, затек превращается в трифосфат. Обмен этого элемента во многом аналогичен обмену кальция. Концентрация этого МЭ в зубах выше, чем в костной ткани, причем находится он в них в прочно связанной форме. [44]
Механизм антибиотического действия тетрациклинов до настоящего времени окончательно ие установлен. Уже в 1950 г. было показано, что хлортетрациклин является специфическим ингибитором синтеза белка у Staphylococcus aureus. В настоящее время известно, что тетрациклины в присутствии иоиов калия и магния образуют прочные комплексы ( 1: 1) как с 70S рибосомами прокариотов, так и с 80S рибосомами эукариотов и полностью блокируют синтез белка. Конкретные мишени действия тетрациклинов - 30S и 40S субчастицы рибосом, а точнее - их участки акцепторного связывания аминоацил-т РНК ( А-центры) ( см. с. Взаимодействие тетрациклинов с рибосомами ( и полисомами) обратимо, и это обусловливает бактериостатический характер их активности. [45]
Страницы: 1 2 3 4