Растущая полипептидная цепь

Cтраница 2

Транспортная РНК, тРНК ( Transfer RNA) Молекула РНК, выступающая в роли адаптера при специфическом переносе аминокислот к растущей полипептидной цепи в процессе трансляции. [16]

Идея о том, что синтез белков на мембраносвязанных рибосомах сопряжен с трансмембранным транспортом белков, возникла из наблюдений по тесной ассоциации растущих полипептидных цепей с мембраной шероховатого эндоплазматического ретикулума в эука-риотических клетках или с внутренней цитоплазматической мембраной бактерий. Транслирующие рибосомы оказались прочно заякоренными на мембране растущим пептидом, и лишь обработка пуромицином, приводящая к аборту пептида из рибосомы, позволяла диссоциировать комплекс на интактные рибосомы и мембраны, оставляя пептид в мембране. Таким образом, стало ясно, что существенный вклад в ассоциацию транслирующей рибосомы с мембраной вносит сам растущий пептид. В бактериях разрыв этого якоря пуромицином приводит к немедленному освобождению рибосом от мембраны, откуда делается вывод, что растущие пептиды являются единственным прочным соединением полирибосом с цитоплазматической мембраной. [17]

Стадия транслокации. Рибосома передвигается иа один кодон вперед в направлении З - конца мРНК за счет энергии, выделяющейся при гидролизе GTP, связанного с фактором элонгации О. Дипептидил - тРНК2 перемещается в Р - участок рибосомы, освобождая А-участок для следующей аминоацил-т РНК3. [18]

По мере движения рибосомы от кодона к кодону вдоль мРНК к ее З - концу аминокислотные остатки один за другим добавляются к растущей полипептидной цепи, которая, все это время остается связанной с тРНК, соответствующей последней включенной аминокислоте. [19]

Неоспоримое преимущество этого метода по сравнению с классическими методами синтеза пептидов состоит в том, что ни на одной из стадий он не требует выделения растущей полипептидной цепи. В силу чрезвычайно низкой растворимости аддукт пептида и полимера легко отмывается после каждой реакции от побочных продуктов, растворителей и избытка реагентов без потери пептида, после чего аддукт готов к следующей реакции. Эти приборы добавляют реактивы в надлежащей последовательности, меняют условия реакций, обеспечивают необходимое время реакции, отмывают побочные продукты, после чего начинают всю операцию сначала. При помощи метода ТФСП были синтезированы инсулин и фермент рибонуклеаза, состоящий из 124 аминокислот. [20]

Хотя это объяснение носит гипотетический характер, нам кажется, что его стоило привести, так как с ним связан интересный вопрос, касающийся механизмов биохимической адаптации: может ли растущая полипептидная цепь принимать при разных температурах различные конформации и - как следствие этого - приобретать различные ферментативные свойства. [21]

Строение 705-рибосомы. ( В субчастицах SOS-рибосомы больше белка, а в ее большой субчастице содержится не две, а три молекулы рРНК. [22]

В синтезе участвуют: матричная РНК ( мРНК), несущая генетические инструкции от клеточного ядра, транспортная РНК ( тРНК), доставляющая к рибосоме требуемые аминокислоты, и растущая полипептидная цепь. Кроме того, в этом процессе участвуют факторы инициации, элонгации и терминации цепи. [23]

Транспортная РНК выполняет две раздельные функции: во-первых, она узнает специфический активирующий фермент и поэтому может акцептировать именно соответствующую активированную аминокислоту [3] и, во-вторых, вместе с m - РНК она участвует в реализации кода, обеспечивая переносимой аминокислоте присоединение к растущей полипептидной цепи как раз в том месте, где необходимо. По-видимому, вторичная структура s - PHK не участвует в распознавании активирующего фермента, потому что при нагревании, нарушающем обычно вторичную структуру, способность акцептировать аминокислоты не ослабевает. [24]

РНК ( точнее - полирибосома, являющаяся комплексом мРНК и рибосом); 3) набор всех типов аминоацил-т РНК ( набор молекул-адаптеров); различные регуляторные и вспомогательные факторы белковой природы; 4) АТФ, ГТФ, ионы магния и др. Трансляция молекул мРНК начинается с 5 -конца с образованием TV-конца растущей полипептидной цепи. Информация считывается в направлении 5 - 3 и заканчивается образованием С-конца белковой молекулы. У эукариот процесс транскрипции происходит в ядре, а трансляции мРНК - в цитоплазме. [25]

Аминокислотная последовательность грамицидина S. [26]

В методе используются полимерный носитель и полинуклеотидная матрица, но отсутствует необходимость, как и в природных системах, временно защищать аминокислоты для образования правильных связей. Растущая полипептидная цепь связана концевой карбоксильной группой с 5 - ОН-группой олигонуклеотида эфирной связью. [27]

Схема пептидного синтеза с использованием комплементарных носителей, предложенная Лентсингером и Клотцем, которая очень схожа с механизмом рибосомного синтеза белков. [28]

Эту последовательность реакций можно повторять, пока не будет синтезирована желаемая полипептидная цепь. Отметим, что на каждой стадии растущая полипептидная цепь переносится на олигонуклеотидный носитель, а после окончания синтеза оли-гонуклеотидный носитель отщепляют от нерастворимой матрицы. Олигонуклеотид, прикрепленный к полипептидной цепи, облегчит хроматографическую очистку полипептида, а затем его можно отщепить мягкой щелочной обработкой. [29]

Фокус этого подхода состоял в том, что растущая полипептидная цепь была химически присоединена к инертному нерастворимому полимерному носителю. В результате выделение и очистка промежуточных и целевых производных пептидов сводились просто к фильтрованию и тщательной промывке твердого полимера для удаления всех избыточных реагентов и побочных продуктов, остающихся в растворе. [30]

Страницы: 1 2 3 4