Белковая глобула

Cтраница 1

Белковая глобула представляет собой образование, в котором внутримолекулярные связи предельно насыщены. [1]

Белковая глобула представляет собой динамическую систему. Имеется ряд заслуживающих внимания попыток физического истолкования поведения такой системы при ее взаимодействии с субстратом. [2]

Белковая глобула представляет собой не статистическую, а динамическую систему. Это своего рода машина, работа которой в конечном счете определяется конкретными деталями ее устройства. Тем не менее не только законно, но и необходимо рассмотреть эту машину как целостную физическую систему. [3]

Схема строения витка глобулы белка. [4]

Белковая глобула представляет собой образование, в котором внутримолекулярные связи максимально развиты и насыщены. [5]

Компактность белковой глобулы обеспечивается в основном гидрофобным эффектом; гидрофобные звенья располагаются в основном внутри глобулы, гидрофильные-на поверхности. [6]

Поместив белковую глобулу в плохие внешние условия, можно, конечно, разрушить нативную структуру-это явление называется денатурацией. Часто, однако, денатурация имеет обратимый характер-вернув денатурированный белок в подходящую среду, можно повторить процесс самоорганизации, который в этой связи называют также ренатурацией. [7]

Пространственное распределение электронной плотности. [8]

Если бы белковая глобула представляла собой не апериодический кристалл, а сильно флуктуирующее образование, то можно было бы думать, что кристаллизация означает отбор одной или нескольких конформаций из большого их числа в растворе. Но глобула имеет фиксированное строение. Кристаллические белки, как уже сказано, содержат большое количество воды, и их изучают в маточном растворе. [9]

Так как поверхность белковой глобулы доступна для растворителя как в иативном, так и в денатурированном состоянии, денатурация должна, следовательно, приводить к понижению коэффициентов активности внутренних боковых групп белка, которые становятся доступными для растворителя. Диссоциацию и растворение белков можно рассматривать таким же образом, относя коэффициенты активности к поверхностным участкам, доступность которых для растворителя меняется в этих процессах. В случае осаждения, однако, имеется осложняющий фактор, состоящий в том, что состав твердой фазы может не быть постоянным. Так, осаждение трихлорацетатом и перхлоратом в кислом растворе, вероятно, сопровождается связыванием этих анионов катионными белками, что приводит к уменьшению заряда белка и в результате этого к осаждению его в виде комплекса с солью. До тех пор, пока состав обеих фаз остается постоянным, объяснение вызываемых солью процессов денатурации, осаждения и агрегации сводится к определению, у каких боковых групп изменяются коэффициенты активности ( или растворимость) в присутствии данной соли. [10]

В гидрофобном ядре белковой глобулы нет или почти нет молекул воды; соответственно они не конкурируют за водородные связи, и поэтому для находящихся в ядре участков цепи термодинамически очень выгодно образование вторичной структуры. Энергия стабилизации вторичной структуры такова, что соответствующие отрезки а-спиралей или Р - ЛИСТОВ ведут себя в ядре глобулы как практически неразрушаемые и весьма жесткие блоки. [11]

Подчеркнем снова, что белковая глобула - не статистическая, но динамическая система, подобная машине, работа которой зависит от расположения и взаимодействия всех ее деталей. [12]

В нативном же состоянии белковой глобулы однозначно определен весь пространственный ход полипептидной цепи, другими словами, с точностью до тепловых колебаний фиксированы координаты многих ( - - Л /, где N-степень полимеризации) атомов. [13]

Напротив, пространственная структура любой белковой глобулы, поскольку она состоит из разнотипных аминокислотных остатков, в высшей степени геометрически неоднородна и нерегулярна. По этому признаку белковая глобула может быть до некоторой степени уподоблена известным в физике неупорядоченным системам-например, стеклам. [14]

Сложная природа движений в белковой глобуле приводит к тому, что некоторые из них характеризуются гигантскими релаксационными временами до сотен миллисекунд, обычно совершенно не характерными для объектов таких скромных размеров. [15]

Страницы: 1 2 3 4